月別アーカイブ: 2013年7月

localBLASTで遺伝子対応表作成

本日(2013年7月25日)、PLOS ONEから論文を発表しました。お世辞にもいい機能アノテーションがなされているとは言えない「非モデル」生物種カイコにおいてマイクロアレイデータ解析を可能とし、ヒトで使われているパスウ … 続きを読む

カテゴリー: 2010年代のバイオインフォマティクス, マイクロアレイ解析 | 2件のコメント

RでPCA

マイクロアレイデータを再利用する際、遺伝子方向のみならずサンプル方向のデータの相関が気になってくると思います。justRMAでnormalizeしたデータで次に行うのは、おそらくサンプル方向のPCA(Principal … 続きを読む

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エントリ数を数える

ファイルが何行あるか知りたいだけなら、いちいちテキストファイルをWordで開いて文字カウントツールを使うまでもありません。そのファイルをfile.txtとするとコマンドラインでは で良くて、文字数とかバイト数も合わせて知 … 続きを読む

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