月別アーカイブ: 2014年7月

スパコンユーザー会

他の方々の使い方を垣間見れて参考になった。公共データベースを利用して、という使い方はそれほどメジャーではなかったものの、そういう要望も出てきているようで。私も計算をする前の調査ばかりじゃなくて、そろそろメインの計算始めな … 続きを読む

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Soylatte事始め

DBCLS SRA Metadata Search の結果をJSONで取ってくるのを教えてもらったので、備忘録的に。 まずは出力されるJSONを処理するコマンドとして、jqをインストールしておく。 で。SRAデータの中で … 続きを読む

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Python Imaging Library

http://www.pythonware.com/products/pil/ から入手できるとのことで、 Python Imaging Library 1.1.7 Source Kit (all platforms) … 続きを読む

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実践コンピュータビジョン

「実践コンピュータビジョン」(原著: Programming Computer Vision with Python)を本屋で手にとってみてから購入。次の展開にむけた体力づくりのため、勉強^2。 来月末にあるこの本の勉強 … 続きを読む

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続・Selenium+PhantomJSで縦長のスクリーンショットを撮る

前のエントリのSeleniumとPhantomJSを使ってブラウザを起動しないでスクリーンショットを撮るスクリプトの汎用化をpythonの勉強がてら。 以下のスクリプトをscsho.pyとして、コマンドライン引数としてU … 続きを読む

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Selenium+PhantomJSで縦長のスクリーンショットを撮る

ウェブブラウザのスクリーンショットは画面の大きさしか撮れないのだが(当たり前)、ポスター発表の際に縦長のそれを作成して説明に使いたい時がある。それを実現するのに良いツールに思わぬ所で出くわしたので、それをφ(..)メモメ … 続きを読む

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第13回スポットファイアーワークショップ(創薬研究領域)

昨日7月18日(金)に、東京有楽町東京国際フォーラムにて。今回のテーマは「創薬研究初期におけるデータの活用」。ライフサイエンスデータの流通業を本業としている我々にとって、「データの活用」のためにこそ「流通業」をやっている … 続きを読む

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ウェブサイト統合

研究者としての情報は、大学院時代から研究室で自ら立てたウェブサーバで発信してきました。ソフト的には、最初はNCSAなhttpdで始め、ほどなくApacheを使うようになってそれ以来ずっとApache。ハードとしては、最初 … 続きを読む

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Mishima.syk#3

Mishima.sykというライフサイエンス業界な勉強会に参加してきました。その名の通り、2014年4月からの職場である三島近辺のその業界の勇士^H^H有志たちの勉強会です。職場が引っ越す前に開かれた、前回の第2回目に参 … 続きを読む

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NIG retreat 2014

7/3-4と遺伝研のリトリートに参加させて頂いて参りました。遺伝研からバスで40分ほどの御殿場高原時之栖にあるホテルがリトリートの会場。リトリートとは、「仕事や家庭生活等の日常生活から離れ、自分だけの時間や人間関係に浸る … 続きを読む

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