月別アーカイブ: 2014年9月

justRMAその後

処理したい生データ(CEL.gzのファイル)だけを実行するdirectoryに集めて、justRMAを実行するのであるが、これらはとくにgzip圧縮を解凍する必要はなく、圧縮されたままでも実行されるようである。同じ生デー … 続きを読む

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GEOにあるCELファイル名を扱いやすくするには?

GEOは遺伝子発現データのアーカイブで、再利用できるデータの宝庫である。だがしかし、多くのユーザがデータをdepositしてきているためファイル名などに一貫性がなく、コンピュータでの一括処理に困ることもたびたびある。 例 … 続きを読む

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バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム(次世代シークエンサ)速習コース

9/5に表題の講習会の講師を務めてきました。普段、日本各所で行っている統合データベースの普及利用促進のための1-2日開催の統合データベース講習会AJACSとは異なり、NGSの速習コース(とはいえ、2週間がっつり)というこ … 続きを読む

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