月別アーカイブ: 2014年11月

NO DATABASE, NO RESEARCH. DBCLS

「種を超えて保存された生理代謝機構の解明に向けて:データベースによるアプローチ」と題して、第37回日本分子生物学会年会にてフォーラムという枠をいただいた。そもそもワークショップ採択を目指して応募したものの落とされ、その後 … 続きを読む

カテゴリー: 雑感 | NO DATABASE, NO RESEARCH. DBCLS はコメントを受け付けていません。

目訴本

amazonにも目訴本のエントリが。Ensembl, Jalview, InterPro, GEO/ArrayExpressの項のほか、第1部の「ウェットな研究にデータベースやウェブツールを役立てるための秘訣」という雑文 … 続きを読む

カテゴリー: 雑感 | 目訴本 はコメントを受け付けていません。

Biohackathon2014終了

宮城県松島で開催されたBiohackathon2014に参加してきました。目標にあげた、複数のマシンに分かれてやっているAOEのデータ更新の仕組みの統合化とgithubでの公開は達成しました。そして、データ更新も開発者が … 続きを読む

カテゴリー: 雑感 | Biohackathon2014終了 はコメントを受け付けていません。

自家製BLAST用DBから必要な配列エントリバッチ取得

自家製BLAST用DBから必要な配列エントリ取得の続き。 配列セットを作成したいときは2,3本でなく、数十本から数百本といったことが多いようです。 といったコマンドを繰り返せばもちろん取得できますが、IDだけが書かれたフ … 続きを読む

カテゴリー: 2010年代のバイオインフォマティクス | 自家製BLAST用DBから必要な配列エントリバッチ取得 はコメントを受け付けていません。

BioHackathon2014

2014年11月10日〜14日までの丸一週間、宮城県は松島海岸のホテルでBioHackathon2014に参加中。ハッシュタグは #biohack14 。個人的には、現在複数のマシンに分かれてやっているAOEのデータ更新 … 続きを読む

カテゴリー: 雑感 | BioHackathon2014 はコメントを受け付けていません。