月別アーカイブ: 2015年1月

配列データセット大量取得と網羅的配列類似性解析

古典的なモデルでない生物を実験材料として使う際、当然モデル生物データベースは用意されていないので、自らが配列類似性の解析をする必要がある。色々やり方があるが、Ensemblを利用したやり方を以下に。 でftpサイトにある … 続きを読む

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Plant & Animal Genome (PAG) XXIII 参加

個人的には、(どちらかというと)ヒトやそのモデル生物において、post-sequencing(ゲノム配列解読後)な研究ばかり見てきたこの十年だったのですが、次世代シークエンサーが広く使われるようになりこれまで解読されてい … 続きを読む

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2015年の計

2014年は職場の二度の引っ越し(3月に1回、4月にもう1回)でバタバタしていたこともあり、講演活動は前年ほど回数はなかったものの、新しく移った先近くで複数回実施することができた。官民問わずDBを使った研究が注目され、そ … 続きを読む

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