月別アーカイブ: 2017年1月

GTExへのリンク

human transcriptomeのデータベース The Genotype-Tissue Expression (GTEx) へリンク張るには、いわゆる遺伝子名(Gene Symbol)で、例えばEPAS1の場合 … 続きを読む

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Papers using RefEx

RefExを使ってくれている論文たちを、2017年1月現在でリストアップ。PMCの全文検索、Google Schalor、そして出版社提供のalertによる定点観測から得たデータを総合。6本あって、やはり医学系ばかりとい … 続きを読む

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Identification of functional enolase genes of the silkworm Bombyx mori from public databases with a combination of dry and wet bench processes

2016年年末にacceptになったとブログエントリ「Pfamから得たプロファイルHMMでhmmsearch」に書いた論文、ついにpublish。 Identification of functional enolase … 続きを読む

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ArrayExpress mirror自動化

移動中、ふと思い立って、これまで都度パスワードを入力しないといけなくなっていたascpの件を解決しようと。ちょっと調べたら、“Setting an environment variable” であっさり解決。 を実行する … 続きを読む

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DOIのすゝめ

Nucleic Acids Research誌では、毎年年頭にデータベース特集号(Database issue)が刊行されている。いつからかは知らないが、私が大学院生の頃(20世紀末…)にはすでにそれがあった。今年(20 … 続きを読む

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macOS Sierraにアップデート

年末に予約できるようになって速攻予約していて、やっと届いたAirPods。自分へのクリスマスプレゼントのつもりだったが、やはり発送遅れ、結果として「お年玉」になってしまった。iPhone7にして充電しながらイヤホンが使 … 続きを読む

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2017 NBDC 新年会

日頃から共同研究先としてお世話になっているNBDC (National Bioscience Database Center:バイオサイエンスデータベースセンター)の新年会に呼んでいただいたので、参加させていただく。大変 … 続きを読む

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2017年の計

年末に書いた2016年を振り返って、につづいて、年頭恒例にしているその年の計を。 2017年は、大学院に入って研究を本格的に始めてからの年数がついに産まれてきてからの年数の半分を越える年ということで、ある意味節目の年 … 続きを読む

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