A chromosome-level genome sequence of Chrysanthemum seticuspe, a model species for hexaploid cultivated chrysanthemum

モデルギクの染色体レベルのゲノム配列 published

すでにbioRxivにアップロードしてあった6倍体栽培ギクのリファレンスとなる2倍体のモデルギクGojo-0 (Chrysanthemum seticuspe)の染色体レベルのゲノム配列の論文がCommunications Biologyから出版。

A chromosome-level genome sequence of Chrysanthemum seticuspe, a model species for hexaploid cultivated chrysanthemum https://doi.org/10.1038/s42003-021-02704-y

同じ研究科の草場先生との共同研究で、同じ研究科の別のグループとの共同研究による査読ずみ論文は初めて。 自分は、6倍体栽培ギクのRNA-Seqデータを公共DB(Sequence Read Archive)から集めてきて、新たに決定したゲノム配列にマッピングすることによるデータ解析で貢献させていただいた。

このプロジェクトに関わるきっかけは、昨年(2020年)の8月末にあった第2回東広島100人論文という学内の他の方との交流を促進するというオンラインイベント。 そのイベントでメールのやり取りしたことから、先方のゲノム配列解析の一部に関わることとなったのであった。 東広島100人論文を企画運営された東広島市産学金官連携推進協議会、広島大学学術・社会連携室の皆様に感謝申し上げます!


Written by Hidemasa Bono in papers on 木 07 10月 2021.