RNA-Seq recipe 2 on pre-sale
Written by Hidemasa Bono in RecipeBook on 金 22 9月 2023.
RNAseqレシピ本2先行発売
先のエントリで何が新しくなったかを書いた「改訂版RNA-Seqデータ解析 WETラボのための超鉄板レシピ ヒトから非モデル生物まで 公共データの活用も充実」 だ …
What's new in RNA-Seq recipe 2
Written by Hidemasa Bono in RecipeBook on 金 15 9月 2023.
RNAseqレシピ本2で何が新しくなったか
先のエントリで第一報をお届けした「改訂版RNA-Seqデータ解析 WETラボのための超鉄板レシピ ヒトから非モデル生物まで 公共データの活用も充実」 だが、Amazonでも予約できるようになったよう …
RNA-Seq recipe 2 dispatch
Written by Hidemasa Bono in RecipeBook on 金 08 9月 2023.
RNAseqレシピ本2第一報
去年(2022年)9月。 パシフィコ横浜で開催された第81回日本癌学会学術総会には出れなかったものの、他の用事で上京していた。 その際に桜木町駅にて、RNA-Seqデータ解析レシピ本の今後に関して出版社の方と話し合った。 ANNUAL UPDATEが3回終わって次をどうするか、ということな …
August2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 31 8月 2023.
2023年8月を振り返って
この8月は出張が3回あった上に盆休みもあったため、ラボにいる日が極端に少なかった。 その一つが、沖縄での講演で沖縄に行ったのは実に9年半ぶり。 また、月初めには学 …
Meta-analysis of Heat-Streassed Transcriptomes Published
Written by Hidemasa Bono in papers on 水 30 8月 2023.
公共遺伝子発現データベースを用いたヒトとマウスの熱ストレストランスクリプトームのメタ解析論文出版
M2の大学院生がfirst authorである …
Lecture in Okinawa
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 12 8月 2023.
講演＠沖縄
台風6号の影響が懸念され、直前までちゃんと行けるのか不明な事態だったが、9年半ぶりに沖縄に行ってこれた。
2023年8月9日沖縄県立博物館・美術館（おきみゅー）講堂にて開催されたシ …
Lab Tour for undergraduates
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 02 8月 2023.
学部生対象研究室見学会
ラボ開設4年目にして初の学部生3年生を対象にした研究室見学会を今日2023年8月2日に。 限られた時間なので詳しい研究の内容などは話せなかったが、それは先月の7月にやった授業で話して …
July2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 31 7月 2023.
2023年7月を振り返って
この7月は出張もなく、ずっとラボに通う毎日であった。 しかし、学部授業、そして対面授業を3年4ヶ月目にして初めて行ったことは大きなイベントだった。 また、月末にはDBCLSの小野さんをお招きしてTogoTVthonなる統合TV製作者の集まりをローカルに開いたのも初めてのことだった。
相変わらず報道され …
R3 WikiPathways report in BioHack23
Written by Hidemasa Bono in papers on 木 13 7月 2023.
R3 WikiPathways group report in BioHack23
2023年6月に参加したBioHackathon2023 。
BioHackathon2023 / "2019年に博多で開催して以来、開催できてなかった国際版のBiohackathon。4年ぶりについに開催で、今年2023年は香川県の高松と小豆島にて。" https://t.co/a0vh2yzrfh#biohackjp pic.twitter.com/Nfr5DQcU8K
— オープンサイエンス推進者な …
First lecture with students
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 12 7月 2023.
生徒がいる初の授業
大学に転職して3年3ヶ月半にして、やっと初対面授業。 3年前来てすぐに講義デビューはしたものの、自分の担当である大学院講義は基本、オン …
Bonohulab Dojo 23 finished
Written by Hidemasa Bono in drbonodojo on 火 11 7月 2023.
23年度bonohulab道場終了
bonohulabで新入生を対象に行っているbonohulab道場。 具体的には、生命科学者のためのDr.Bonoデータ解析実践道場(道場本)を使った、週1回約1時間ほどのセミナー。 セミナーといっても基本は私が解説して、可能ならハ …
June2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 30 6月 2023.
2023年6月を振り返って
6月は学会年会とBioHackathon2023（とそれに続く関東出張）で出張が多く、合計12泊の外泊。 もちろん、月当たりの数では転職以来最多。 その結果、多くの人とあっ …
BioHackathon2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 28 6月 2023.
Biohack23
2019年に博多で開催して以来、開催できてなかった国際版のBiohackathon。 今年2023年、4年ぶりに香川県の高松と小豆島にてDBCLS BioHackathon2023開催。 日曜日に高松に集合して、続く月曜日から土曜日ま …
JSGEDIT 8th
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 08 6月 2023.
日本ゲノム編集学会第8回大会
今年は（結果として）4年ぶりにオンサイトで。 しかも前回オンサイトで行われた東京・船堀にて。 そのころはまだ前 …
May2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 31 5月 2023.
2023年5月を振り返って
5月はオンサイトでの外部講演が2つ、大阪と米子に遠征。 米子でのそれは早くも統合TV化された。
バイオDXによるデータ駆動型生命科学研究 @ とっとりバイオフロンティア人材育成セミナー https://t …
Meta-analysis of queen and workers transcriptomes in eusocial insects published
Written by Hidemasa Bono in papers on 土 06 5月 2023.
社会性昆虫における生殖分業に関連する候補遺伝子同定論文出版
2022年11月にbioRxivにプレプリントアップロードしてあった、プロジェクト研究員による公共RNAシーケンスデータのメタ解析による社会性昆虫における生殖分業に関連する候補遺伝子同定の論文が、査 …
April2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 30 4月 2023.
2023年4月を振り返って
年度が変わり、bonohulabでの4年目がスタート。 学生の数が5人から8人となった。 今年は大学院入学の問い合わせは博士課程後期、しかも社会人特別入試にかかわる …
Food Security Symposium 2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 22 4月 2023.
食料安全保障シンポジウム
G7広島サミットと広島大学75+75周年記念事業の食料安全保障シンポジウムが学内であるということで参加。
食料安全保障シンポジ …
March2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 31 3月 2023.
2023年3月を振り返って
2023年3月は BioDXのアウトリーチイベントや学会発表、そして初の研究会内でのbonohulabの研究紹介的なポスター発表など、対外的なイベントが多く。 懸案だった共同研究打ち合わせにも月 …
Shutoiten 3years
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 25 3月 2023.
酒都移転3年
今日2023年3月25日で酒都西条に移転して丸3年になった。
2年目に比べると出張にもだいぶ行けるようになり、コロナ禍以前の状態に戻ってきているのではな …
Research Presentation 230324
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 24 3月 2023.
研究発表会230324
研究科内でオンサイトでの研究発表会（ポスター発表）があるということで、発表した。 ちょうどコロナ禍 …
BioDX outreach event 2023 done
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 21 3月 2023.
ミライ牧場イベント2nd無事終了
2023年3月5日(日)に開催したバイオDXを紹介するアウトリーチイベント「ゲノム解読から生物のプログラミング〜教科書の外へいこう 未来の …
Hiroshima Bio Forum 22
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 17 3月 2023.
令和4年度広島バイオフォーラム
去年は自分が講演した広島バイオテクノロジー推進協議会主催の広島バイオフォーラム。 残念ながらコロナ …
odokon2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 15 3月 2023.
日本応用動物昆虫学会大会2023＠摂南大農学部
2023年3月13日〜15日まで、第67回日本応用動物昆虫学会大会が大阪府枚方市と京都府八幡市にまたがる摂南大学で開かれた。
今回も小集会の講師として参加。 コロナ禍でもオンラインで開 …
Feburary2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 28 2月 2023.
2023年2月を振り返って
今月は、2月ということもあって行事が多く。 なかなか研究活動に時間が取れなかったものの、今年度導入した大型実験機器によるデータが取れてき …
BioDX outreach event 2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 05 2月 2023.
バイオDXのアウトリーチイベント2023
昨年も実施したバイオDXのアウトリーチイベントを今年もやります！ 今回のタイトルは、「ゲノム解読から生物のプログラミング〜教科 …
January2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 31 1月 2023.
2023年1月を振り返って
今月は、3年ぶり＆現職初の海外学会参加でバタバタしていた。 3年ぶりのSan Diegoで大きな刺激を受け、また同時に大きな「種」も得てきた。 それをうまく育ててい …
PAG30
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 21 1月 2023.
Plant and Animal Genome Conference 30
3年ぶりのInternational Plant and Animal Genome Conference (PAG)参加。 すでに転職してから3年目も後半に差し掛かっているが、なんと転職後、初めての海外学会発表。 色々と必要な手続きがこれで良いのか、気を揉みつつ。
こ …
Plan 2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 01 1月 2023.
2023年の計
明けましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いします。
明けましておめでとうございます。今年も無事初 …
Review 2022
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 31 12月 2022.
2022年を振り返って
ラボ3年目の2022年は、「飛躍」の去年からさらに飛躍の年になった。
研究室関係のニュースはラボのニュースに取り上げて溜めてき …
December2022
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 28 12月 2022.
2022年12月を振り返って
この2022年12月は年末ということもあり、月末が29日から休み。 しかも、有給休暇を取得していないということで、28日もお休みということで、書類上は昨日27日までということであった。
この12月は久しぶりに参加の日本分子生物学会年会 …
Mid-term presentation of master's thesis 22
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 26 12月 2022.
修論中間発表会22
去年はオンライン開催だった修論中間発表会が今年はオンサイト、ポスター発表ということで。 去 …
Nights in hotels 2022
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 24 12月 2022.
2022年出張外泊数
毎年恒例にしている出張外泊数。 去年(2021年)は11泊であったが、
来年はもっと増えるんだろうなあ。
という予測通り、今年2022年は …
Number of PubMed entries 3 digits
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 23 12月 2022.
PubMedエントリ数3桁到達
普段から使っている自分の名前の入った論文を年代順にリストアップする検索式（日本語の論文を含めない自分 …
1st GEM paper published
Written by Hidemasa Bono in papers on 木 22 12月 2022.
1stGenome Editing Meta-DB paper
2022年9月に参加した国内版バイオハッカソンBH22.9 での Genome Editing Meta-database (GEM) の報告をその月の終わりにBioHackrXivにプレプリントとして公開 したが、 この度、その論文を査読 …
Reference genome sequences of Mythimna separata published
Written by Hidemasa Bono in papers on 土 17 12月 2022.
アワヨトウゲノム配列解読論文
1ヶ月前にbioRxivから公開していたアワヨトウゲノム配列解読論文が査読済みとなり、Insectsからpublished。 acceptedから1日でという爆速はいつも通り。
Reference Genome Sequences of the Oriental Armyworm, Mythimna separata (Lepidoptera: Noctuidae)
https://doi.org/10.3390/insects13121172
今年になって始 …
45th annual meeting of the molecular biological society of Japan
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 02 12月 2022.
第45回日本分子生物学会年会
恒例の分セーに参加。 COVID-19の影響もあり、最後に参加してから3年もの月日が経過。 そのため、現在の所属に異動してから初めてということもあり、会 …
November2022
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 30 11月 2022.
2022年11月を振り返って
この2022年11月は、上旬にバイオインフォマティクス講義を取り終えてからは、大型機器の設置のアレンジなど、やはりバタバ …
Meta-analysis of public RNA sequencing data of queens and workers in social Hymenoptera and termites
Written by Hidemasa Bono in papers on 水 23 11月 2022.
社会性ハチ目およびシロアリにおける女王と働き蜂のトランスクリプトームのメタ解析
プロジェクト研究員によ …
bocchi again
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 22 11月 2022.
ボッチ・アゲイン
昨年度（2021年度）はじめに、新しいメンバーを迎え、ボッチラボではなくなったのだが。 その後もラボメンバ …
Reference genome sequences of Mythimna separata
Written by Hidemasa Bono in papers on 土 19 11月 2022.
アワヨトウゲノム配列解読論文
NARO横井さん、上樂さん、筑波大学の古川先生、によるアワヨトウMythimna separataのゲノム配列決定論文がbioRxivから公開 …
Press release 22 6th
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 17 11月 2022.
2022年度6回目のプレスリリース
先月（2022年10月15日）に出版されたセイヨウミツバチリファレンストランスクリプトームデータ構築の論文をNAROと共同でプレスリリース。 出版から1ヶ月以上かかってしまったが、き …
Genome paper for Perilla frutescens in Japan
Written by Hidemasa Bono in papers on 水 16 11月 2022.
アカシソゲノム配列解読論文
約2ヶ月前にbioRxivから公開していたアカシソゲノム配列解読論文が査読済みとなり、DNA Researchからpublished。
A highly contiguous genome assembly of red perilla (Perilla frutescens) domesticated …
COVID-19 Vaccine 4th shot
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 12 11月 2022.
コロナウイルスワクチン注射4回目
今年（2022年）3月に3回目に引き続き、ほぼ8ヶ月後に再び職域接種で4回目。 オミクロン株対応で今回もモデルナ製。
接種希望者が …
Review Genome Editing and Bioinformatics published
Written by Hidemasa Bono in papers on 火 08 11月 2022.
ゲノム編集とバイオインフォマティクスの総説論文出版
共同研究講座助教の中前さんと共に執筆した総説が出版 …
Web-connected text bioinformatics
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 07 11月 2022.
Web連携テキストバイオインフォマティクス
東京大学大学院農学生命科学研究科ではアグリバイオインフォマティクス教育プログラムを10年以上前からやっている。 そのユニットに …
Bioinformatics Lecture 22 recording done
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 06 11月 2022.
バイオインフォマティクス講義22収録完了
目下の最重要事項である卓越大学院のバイオインフォマティクス講義。 本日(22/11 …
First poster presentation in 3 years
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 04 11月 2022.
3年ぶりのポスター発表
理研科技ハブ共同研究プログラム 2022年度合同ワークショップで2020年1月のPAG以来ほぼ3年ぶりのポスター発表。 転職もあって研究内容が大幅に変わって。 発表準備期間としては3年はだいぶ長かったものの、コロ …
October2022
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 31 10月 2022.
2022年10月を振り返って
この2022年10月は、前半は先月に引き続き出張に出ていることが多く。 こちらに来て3年目にして初めてのリアル酒まつり参加とか、12年ぶりのBioJapan参加など、多くの人とお会いする刺激的な出来 …
First private grant awarded
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 26 10月 2022.
民間助成金初獲得
これまでずっと縁がなかった民間助成金を初めて獲得。 もちろん、これまでも出してはきていたの …