AOE archived in LSDB archive
AOE、生命科学系データベースアーカイブに
All of gene expression(AOE)のデータ（遺伝子発現データのメタデータのindex）が、生命科学系データベースアーカイブ(LSDBarchive)という公的なデータアーカイブからダウンロードできるようになった。
なぜそうしたかなのだが、一番の原動力は、（一次データベースではないものの）生命科学系のデータベースとして全てをダウンロードできるようにし、再利用性を高めたいということ。 実は、データ全体が欲しいというリクエストは、以前からあった。 これまではAPI使って取ってください、ということで対応していた。 しかしながら、再利用してもらうにはちょっとハードルが高いかなと、思ってはいた。 それが今回、LSDBarchiveに入ったことで全体のダウンロードもクリックしていくだけで簡単に可能となった。 より使ってもらえるようになったのではないか。
また、寄託したデータ自体に以下のようにDigital Object Identifier(DOI)が付き、引用する際のIDとして使えるようになった。
- データベース全体
doi: 10.18908/lsdba.nbdc00467-000.V001 - 遺伝子発現データリスト
doi: 10.18908/lsdba.nbdc00467-001.V001
公開にあたり、LSDBarchiveのなかの方に大変お世話になった。 ありがとうございました。