第57回日本人類遺伝学会大会 教育講演

2012年10月26日に「バイオインフォマティクス:データベース統合化によるアプローチ」 と題して行った講演のWeb supplemental materials置き場です。講演要旨はこちら

統合DB: Table of contents

2012年10月26日の講演で紹介したDBやウェブツールにアクセスしやすいようにまとめておきました。基本的にここはその後アップデートしません。その後どんどん古くなり、より新しくて便利なものが出てくると考えられます。より新しい私の講演資料を参照して下さい。

DBチュートリアル:統合TV

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統合データベース講習会AJACSみちのく2「R+Bioconductorを使ったNGS解析」(その1その2)

DBカタログ&コンテンツ

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Integbioデータベースカタログ

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新着論文レビュー

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領域融合レビュー

DB検索

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生命科学DB横断検索Sagace by 医薬基盤研究所

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テキスト系

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Allie:略語検索エンジン

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inMeXes → LSD

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DNA配列他

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DNA DB overview

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GGRNA(RefSeq search)

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GEO overview

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RefEx (Reference Expression dataset)

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DBCLS SRA(SRAを便利に使うためのサイト、講演当時はSRAsと紹介)

DBアーカイブ

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DDBJ(DNA DataBank of Japan: 塩基配列データ)

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DOR(DDBJ Omics Archive: 遺伝子発現データを含めたオミックスなデータ)、GEO(遺伝子発現データ)

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DRA(SRA)(DDBJ Sequence Read Archive: 次世代シーケンサーから得られた塩基配列データ)

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生命科学系DBアーカイブ(上記を含めたその他諸々)

DB知恵袋: ライフサイエンスQA(LSQA)

講演スライド

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** 第57回日本人類遺伝学会大会 教育講演「バイオインフォマティクス:データベース統合化によるアプローチ」 ** from Hidemasa Bono


Written by bonohu in misc on 金 26 10月 2012.