第57回日本人類遺伝学会大会 教育講演
2012年10月26日に「バイオインフォマティクス:データベース統合化によるアプローチ」 と題して行った講演のWeb supplemental materials置き場です。講演要旨はこちら。
統合DB: Table of contents
2012年10月26日の講演で紹介したDBやウェブツールにアクセスしやすいようにまとめておきました。基本的にここはその後アップデートしません。その後どんどん古くなり、より新しくて便利なものが出てくると考えられます。より新しい私の講演資料を参照して下さい。
DBチュートリアル:統合TV
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統合データベース講習会AJACSみちのく2「R+Bioconductorを使ったNGS解析」(その1、その2)
DBカタログ&コンテンツ
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DB検索
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生命科学DB横断検索, Sagace by 医薬基盤研究所
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テキスト系
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inMeXes → LSD
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DNA配列他
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GGRNA(RefSeq search)
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RefEx (Reference Expression dataset)
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DBCLS SRA(SRAを便利に使うためのサイト、講演当時はSRAsと紹介)
DBアーカイブ
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DDBJ(DNA DataBank of Japan: 塩基配列データ)
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DOR(DDBJ Omics Archive: 遺伝子発現データを含めたオミックスなデータ)、GEO(遺伝子発現データ)
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DRA(SRA)(DDBJ Sequence Read Archive: 次世代シーケンサーから得られた塩基配列データ)
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生命科学系DBアーカイブ(上記を含めたその他諸々)
DB知恵袋: ライフサイエンスQA(LSQA)
講演スライド
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** 第57回日本人類遺伝学会大会 教育講演「バイオインフォマティクス:データベース統合化によるアプローチ」 ** from Hidemasa Bono