cuffdiffの怪

cufflinksに含まれるプログラムのcuffdiffは発現差を調べるのに有用なのだが、うまく動かないことも。その場合にしたこととして、 -pまたは--num-threadsで指定するthread数の指定を減らす、それでもダメな場合は1に。 また、IDとNAME両方が一番右っかわのカラムにないとcuffdiffがセグフォするらしい。無理やり書く捨てコード(実際はPerlワンライナー)で対処したが、そのへんのスクリプトが必要かもですね。


Written by bonohu in misc on 土 21 3月 2015.