xenomeのindex作成
xenome続き。indexの作成だが、以下のように。 [shell] xenome index -v -T 6 -P fuga_in_hoge -H hoge.fa -G fuga.fa [/shell] 最初この実行が終わらず、プログラムが暴走しているのかと思って-Tオプション(thread数)をいじったり、-vオプション(verbose:ログがたくさん出るようになる)を追加したり。その結果、単に実行に時間がかかっているだけ、ということが放置しておいた結果から判明。 6CPU指定で、今回の哺乳類クラスのゲノムサイズの例だと、約15時間半かかったり。macOSでの実行だからだろうか?