CancerDAT now on sale

がんゲノムデータ解析本発売開始

目次も公開され、セミナー動画も公開された「がんゲノムデータ解析」。 ついに本日2022年8月29日(月)から発売開始!

出版社のウェブページにも掲載されている目次。

  • 第1章 がんのゲノム・オミックス解析を視野に入れた検体保存方法
    • COLUMN 1 がんゲノム研究と倫理的・法的・社会的課題
  • 第2章 がんのターゲットリシークエンス―がんパネルシークエンスによる乳がん変異検出
    • 再現・検証 とある検査技師のブラックボックスへの挑戦録
    • 再現・検証 DRY解析初心者遺伝カウンセラーの挑戦
    • 特別寄稿 遺伝カウンセラーが「がん患者」になるとき
    • COLUMN 2 がんゲノムプロファイリング検査におけるエキスパートパネルの概要と課題
    • COLUMN 3 がん遺伝子パネル検査の課題 ①医師の立場として 
    • COLUMN 4 がん遺伝子パネル検査の課題 ②臨床検査会社として
  • 第3章 がんの融合遺伝子検出―RNAシークエンスによるがん融合遺伝子検出
    • 再現・検証 Macか,Windowsか,それが問題だ
  • 第4章 がんのCNV検出―SNPアレイによる転移性肝がん,およびメラノーマのコピー数変異検出 
    • 再現・検証 中年も,大志を抱け―Linuxを扱うべきか扱わないべきかそれが問題だ 
  • 第5章 がんのゲノム解析―ロングリードシークエンサーによる肺がんゲノム構造変異検出 
    • 再現・検証 遺伝子解析? それ美味しいの? 完全門外漢によるはじめての遺伝子解析 
    • COLUMN 5 完全ヒトゲノム配列ががんゲノム解析にもたらす恩恵
  • 第6章 がんのGWAS―GWASによる乳がん感受性多型の検出
    • 再現・検証 世界で一番スマートなGWAS体験をあなたへ
  • 第7章 がんのポリジェニックリスクスコア―ゲノムデータから乳がんリスクスコアを計算
    • 再現・検証 Mac初心者にもできる!できると楽しい!PRSの再現・検証 
    • COLUMN 6 がん環境要因の疫学研究と分子疫学
  • 第8章 がんのエピゲノム解析―マイクロアレイによる腎がんエピゲノム変異検出
    • 再現・検証 R(ほぼ)初心者,EWASに挑戦―驚愕!?メチル化データによる性別推定の有用性と謎
  • 第9章 がんのcfDNA解析―リキッドバイオプシーによる大腸がん変異検出
    • 再現・検証 「血の一滴」はどれだけ「重い」―cfDNAで読みとく運命の行方 
    • COLUMN 7 がんワクチン臨床試験の統計学的課題

DRY解析教本同様に、各章ごとに再現者が割り当てられ、著者だけでなく、彼らと、あと編集の我らが再現を試みた。 しかし、今回はできる限り(intel) Macで、という緩い制約での再現。 Linux上でしか再現できてないものもあれば、Apple silicon Macでも動くというプロトコールもあるので、ご注意のほど。


Written by Hidemasa Bono in NGS_DAT on 月 29 8月 2022.