春の嵐

Written by bonohu in misc on 日 02 4月 2017.

三島も4年目に突入。年度頭から締め切りに追われているが、ブレインストーミングに温泉インフォマティクス研究 …

Continue reading »









説明会、その後

Written by bonohu in misc on 金 24 3月 2017.

説明会。この種のそれは約十年勤めてきて初めて。わかったことは、現状今後のことはよくわからないということ。 終了 …

Continue reading »


命の洗濯

Written by bonohu in misc on 木 23 3月 2017.

有給休暇扱いにして、ホームワーク。所属はしていないが勤務先のある研究所で開催される公開セミナーを聞きに職 …

Continue reading »


csvlookが使えない

Written by bonohu in misc on 月 20 3月 2017.

ある日、タブ区切りのデータを人に見せる必要があって、csvlookを使おうとしたら

zsh: /usr/local/bin/csvlook: bad interpreter: /usr/local/opt/python3/bin/python3.5: no such file …

Continue reading »




SPARQLthon54

Written by bonohu in misc on 月 13 3月 2017.

三島開催。だが、急用で1日目だけの参加。 引き続き、ArrayExpressにない、RNA-seqデータを回収する件。ArrayExpressのデータと同じようにTitle行をど …

Continue reading »




あの頃の未来

Written by bonohu in misc on 金 10 3月 2017.

26年前の今日(1991/3/10)、大学の合格発表だった。その時から画一的な評価基準を離れ、好き勝手にやってきたわけだが。曲 …

Continue reading »


足元を見られる

Written by bonohu in misc on 木 09 3月 2017.

来週の講演に向けて、外行きの靴を買いに。まったくないわけではないが、良い機会なので。「足元を見られる」という話を …

Continue reading »


もっと並列に!

Written by bonohu in misc on 水 08 3月 2017.

多数のプロジェクトをかかえ、それぞれにさまざまな進捗状況になるのは当たり前。それをうまく並列に御して業績 …

Continue reading »




2月は逃げる

Written by bonohu in misc on 火 28 2月 2017.

本当に今年2017年の2月はそんな感じだった。1月のうちは、それほど予定も詰まっておらずじっくり研究に取り組めると …

Continue reading »



出会いを大事に

Written by bonohu in misc on 土 18 2月 2017.

今回の東京連続出張の機会に複数の知り合いと再会。人との出会いの中から自分のアイデンティティを再確認。ちょ …

Continue reading »


SPARQLthon53 day2

Written by bonohu in misc on 金 17 2月 2017.

昨日でデータは取ってこれるようになったので、それを整形して必要なデータだけ抽出できるように。

まずは、BioProject(PRJか …

Continue reading »


SPARQLthon53 day1

Written by bonohu in misc on 木 16 2月 2017.

前回に引き続き、DBCLS SRAのAPIをいじる。AOE2.0に必要なデータを作成するパイプラインを作成するために。 前回上手くいか …

Continue reading »





歴史は繰り返す

Written by bonohu in misc on 火 07 2月 2017.

約20年前、大学院生だったころと全く同じ手順を、対象配列セットを換え、ツールを換え、やっていることにふと気づく …

Continue reading »



WordPressテーマ変更

Written by bonohu in misc on 日 05 2月 2017.

鯖が復活して、WordPressの設定をいろいろいじっていて、気分転換にWordPressのテーマを変更してみた。バックアップ先"ぼうのブロ …

Continue reading »


bonohu.jp鯖復旧

Written by bonohu in misc on 土 04 2月 2017.

マシンも老朽化しているので、別の例にもあったようにマシンリプレイスが必要となるかと思いきや、単にInternet connectionが切 …

Continue reading »



Papers using RefEx

Written by bonohu in misc on 火 17 1月 2017.

RefExを使ってくれている論文たちを、2017年1月現在でリストアップ。PMCの全文検索、Google Schalor、そして出版社提供のalertによる定 …

Continue reading »


Papers using RefEx

Written by bonohu in misc on 月 16 1月 2017.

RefExを使ってくれている論文たちを、2017年1月現在でリストアップ。PMCの全文検索、Google Schalor、そして出版社提供のalertによる定 …

Continue reading »




DOIのすゝめ

Written by bonohu in misc on 火 10 1月 2017.

Nucleic Acids Research誌では、毎年年頭にデータベース特集号(Database issue)が刊行されている。いつからかは知らないが、私が大学院生の頃(20 …

Continue reading »






2016年出張外泊数

Written by bonohu in misc on 火 27 12月 2016.

一昨年から数えだしている「仕事で外泊」した日数。明日(12月28日)で2016年仕事納め、というわけで、2016年の日数確定。 なんと …

Continue reading »