前門の虎、後門の狼
Written by bonohu in misc on 土 24 4月 2010.
努めておとなしく。
Category: misc
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 土 24 4月 2010.
中四週間。本日のイベントに向けて。
RNA polIIIのChIP-seq
Written by bonohu in misc on 金 23 4月 2010.
これであのプロジェクトが進められるな。
温度差が15℃
Written by bonohu in misc on 木 22 4月 2010.
昨日の今頃は22℃だったのに対して、今日は7℃…。
行けることが再度確かとなった9月の日本癌学会の抄録を。英語の上に、共著者（共同発表者）は当該学会会員のみという厳しい制約。RefExとその具体的な活用事例を発表してこうようと。
一期一会
Written by bonohu in misc on 水 21 4月 2010.
人との出会いを大事にしていきたい。
自転車操業
Written by bonohu in misc on 火 20 4月 2010.
並列にこなせる部分はそうしたいので現在はそういうモードで。一つ正式に進み出したので、次に。
丸二年
Written by bonohu in misc on 月 19 4月 2010.
今のところに引越してきて。早いものだ…
気分転換
Written by bonohu in misc on 日 18 4月 2010.
いろいろと悩んだが、結局外に。家にいてもずっと悶々とネットやっているだけだろうから。始めは家にもう戻ろうかというぐらいの行楽渋滞に巻き込まれたものの、その後渋滞には巻き込まれず。いくらか気分が晴れた。
デリバリーバイオインフォマティクス
Written by bonohu in misc on 土 17 4月 2010.
id:sesejun さんによる データ整備・解析のためのインフラ整備について - Loud Minority を遅ればせながら見たあと自分なりに考えて、その後散歩していてふとひらめいた。
ATフィールド全開
Written by bonohu in misc on 木 15 4月 2010.
どうしてそういうことになったのかは共感しかねるが、今年度の自分の担当開発だけややこしいことに。それ関係で上司に言われた通りやっていたら他の課の偉いさんから横槍。 偉いさん同士で決めた話は下々の者は聞いておりません。こちらは知らぬ存ぜぬだが、その連絡不行き届き（では本当はないんだけど…）がその課の部下の方にいくかと思うといたたまれず。やりとりをするメールがどんどんクソ丁寧になっていくのに自分でも笑ってしまったり。
早く自分持ちの予算だけで動かすようにしたい。いや、してみせるぜ。
たらい回し対応
Written by bonohu in misc on 木 15 4月 2010.
こういうことがあると全部自分でやったほうが(ry、という気持ちになるわけですよ実際。
墓暴き
Written by bonohu in misc on 水 14 4月 2010.
ふとしたきっかけで壊れたtime capsleを分解。中にあるというHDDを抽出してみる。そのままMacProにささるソレだったので、そのままさしてみると…まんま認識されて、time machineのファイルシステムが丸見え。そのまま初期化して増設HDDとして利用することに。
獅子の子落とし
Written by bonohu in misc on 火 13 4月 2010.
というわけではないが。これまで自分がやってきたことを、それぞれの部分で複数の後輩たちに徐々に任せられるよう導火線を引きつつ。一方で昨日連絡した件の打ち合わせを早速。また別の方も早速見積もり頂いたり。気がついたら外はもう真っ暗という。テンポよく仕事がこなせたかな。
銀鱈の照り焼き（980円の三割引）。
2010年度
Written by bonohu in misc on 月 12 4月 2010.
が本格的に稼働してきた感じ。取引先への仕事お願いや、事務的な書類等々。
寝食を忘れて研究
Written by bonohu in misc on 土 10 4月 2010.
とまではいかなかったけれど、全パワーを研究に向けていたなー、と。そのパワーの源は他ならぬ復讐心であり、年限で学位が取れなかったことに対する焦りであったなー、と。
生命科学分野のデータベースを統合する仕事：落ちこぼれ大学生が.DB（Doctor of the database）にいたるまで - 統合TV (togotv)(2010-01-27)
10年前の自分をふと思い起こす土曜日の昼下がり。
享年37
Written by bonohu in misc on 木 08 4月 2010.
はっきりいって、同じ年の自分にとっては非常に辛い。若いときに盛りのあるスポーツ選手とはいえ、先に逝ってしまわれるのは。まだまだこれからの人生があったはずだ。残された者としてそれを少しでも補う存在でありたい。
某特務機関箱根支部
Written by bonohu in misc on 木 08 4月 2010.
にて執務。今年度もこちらでの仕事は、なくならないどころか…。いつのまにこんなことになってしまったんだろう。
RAさんの過半数が東大
Written by bonohu in misc on 水 07 4月 2010.
もしくは東大大学院、ということが、実際に数えてみて判明。これまで少数派だったのだが、生物情報科学科からの学部生のアルバイトさんの参入で昨年度2人から今年度は7人に。一応そこの非常勤講師（大学院新領域創成科学研究科）となっているので、計算機センターのアカウントの更新書類がきたので申請しておく。
over fifty
Written by bonohu in misc on 月 05 4月 2010.
になったらしい、RAさんたちも含めて。RAさんたち以外に5人も4月から新しい人が来ていたとは…。定例会議の後、全体写真撮影。そして、夜に新歓。その新人さんのお一人からDBCLSに行くと言ったら私が居るところですね、と言われたと聞いて気を良くする。知らない間に相次いで上の人達が居なくなり…。僭越ながら中締めをさせて頂いた。こういうことも今後増えてくるのだろうな。
第2回某役員会
Written by bonohu in misc on 日 04 4月 2010.
引っ越したT社オフィスにて。ワークショップでもテキストマイニングネタをやることに。
情報更新
Written by bonohu in misc on 土 03 4月 2010.
自分のウェブサイトの。とくに大きくかわったところはないが、最新版にしておく。そうしておくことで、自分で書類を作成せざるを得ない時にコピペで済むし、場合によっては自らの手をわずらわすことなく必要な書類が作られていたり。
統合牧場リニューアル
Written by bonohu in misc on 土 03 4月 2010.
RA(Research Assistant; 大学院生アルバイトの呼称)＆大学生アルバイトさんたちの増加に対応すべく。変更点は大まかに
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新たにデスク4つを壁際に2つづつ配置
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これまでPC3台が乗っていた丸机（4人用打ち合わせ机）をディスカッションスペースとして用途変更し、そのPCは上記のデスク(2つ分)へ配置
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新たに長方形の机2つ（各4人座れる）をさらなるディスカッションスペースとして配置（上記丸机があったところと、ソファーがおいてあったところ）
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より使われるよう、ソファーの位置を移動（使われていないもう一方の出入口をふさぐ形で(w）
あとは、昨日のエントリにも書いた、使ってきたマシンの展示位置を変更したり。出入口から時計回りに撮影した全景を載せますが、百聞は一見にしかずということで、是非一度DBCLSにあそびにきてください。お待ちしております。
一番左側（↑）。左手前側に統合TV作成現場が。右に長方形の机のディスカッションスペース。奥にカラクラ(ColorClassic)とホワイトボードに箱根補完マップ。
真ん中（↑）。左に長方形の机のディスカッションスペース（続き）。このパーティションの向こうに私ども常勤の者の机が。
一番右側（↑）。左にコーヒーメーカー。右手前側にこれまでの丸机、真ん中に新たに設置された丸机のディスカッションスペースが。右奥にはソファー、その左の真ん中奥には新たに配置した壁際の机2つ（と椅子4つ）。
.DB project 始動
Written by bonohu in misc on 金 02 4月 2010.
doctor of the database(dotDB -> .DB)を育成するtogofarmの新しい活動。それに向けて二年目のチルドレンたちの歯車が噛み合い、動き始めた。詳細は次々とtwitter「統合牧場」TL(timeline)で明らかになっていくことでしょう。
おかたづけ continued
Written by bonohu in misc on 金 02 4月 2010.
引き続き。デスクの方もほぼ落ち着くが、まだ自分のデスクらしくない印象で落ち着かない。統合牧場博物館の常設展「オレ様のマシンたち」の配置をほぼ終える。1990年代～現在まで、オレ様が使ってきたマシンが時系列に展示。あとはそれぞれに対するアノテーション。頑張ってつけていこう！
新記録樹立
Written by bonohu in misc on 金 02 4月 2010.
最寄駅から品川まで一時間超…いつもの二倍以上。ありえない。
3年目の再出発
Written by bonohu in misc on 水 31 3月 2010.
今日で今の職場ができて丸三年。今のオフィスに引越してきて丸二年。id:Hashがあのエントリを書いてから丸一年。
という節目の日に、他の部屋から机と椅子を多数運び入れての大模様替え大会。今日から二人、新規加入でその二人ともが来てくれたり。
2009年度を振り返って
Written by bonohu in misc on 水 31 3月 2010.
一人脳内反省会。このブログのこの一年のエントリを振り返って、大事だと思ったものはtwitterでつぶやきつつ。大まかにいって、E計画再興と、「精神と時の部屋」から「統合（変態）牧場」への大変革が私にとっては大きな出来事であった。
もちろん、統合TVのウェット版作成やDBCLS HQへの積極的な△のように果たせなかったこともいろいろある。それらを少しでも多く取り組んでいけるよう、統合DBプロジェクトの最終年度2010年度、頑張りたい。
空腹時血糖
Written by bonohu in misc on 火 30 3月 2010.
を測るために朝飯抜き。しかも、昨日頂いた処方箋で薬を受け取りに山越え…。そのあと、さらにウォーキング20分ほど…。朝からタフな一日だった。
統合牧場の春
Written by bonohu in misc on 月 29 3月 2010.
人の入れ替わりとともに、机のレイアウト替えも同時に。明らかに人間の数が増えてきているので。より有効にモノが活かせるように。当然といえば当然なのだが。
白紙粛清
Written by bonohu in misc on 日 28 3月 2010.
年末から三ヶ月ほどたったので、去年の領収書とかを一気に捨てると同時にパンフレット等も。そして、それに付随していた想い出も…。
六本木アートナイト
Written by bonohu in misc on 金 26 3月 2010.
その後、wakutekaと参戦。なにげにミッドタウン初。そして、誘って頂いたお方に初めてお会いして、ゆるくあつまったtwittererな方々と中華に行ったり。その後、六本木ヒルズ方面に行ってみたものの、体調が十分でなく、オール回避。でも、とても楽しめた土曜日の夜＠六本木でした。やっぱり、積極的に週末も出て行かんとあかんなぁ。
Tokyo.R#3
Written by bonohu in misc on 金 26 3月 2010.
六本木でやっていると開催30分前に知って、参加登録してustreamを見ながらお出かけ準備。途中からしか会場では聞けなかったものの、ピザパーティーには参加してそこに集っていた人たち（実は、多くはtwitterのfollower）と話をしたり。異業種な皆様のそれぞれのところでの問題点や悩みを聴かせていただくが、本質的には新しい情報科学技術に旧態依然としたカイシャがついていけなくてその狭間で苦しんでいるのはどこも同じだな、と感じた。そこを、パイロットファームでもある「統合牧場」で社会実験して、まずは我々の分野から成功事例を発信していきたい。
席替え
Written by bonohu in misc on 木 25 3月 2010.
により、左隣の人が入れ替わった。それとともに部屋の机やミーティングスペースの増強も。より多くのRAやアルバイトさんが来ることになっても収容できるように。
Chateau Franc Couplet 2003
Written by bonohu in misc on 木 25 3月 2010.
私の好みにバッチリ合っていた Bordeaux Superieur。結果としてヤケ酒にorz
メール処理＆DM
Written by bonohu in misc on 木 25 3月 2010.
多し。何時までも事務さんに迷惑をかけるわけにもいかず、4月分は締め切らせて頂く。
現実回帰
Written by bonohu in misc on 水 24 3月 2010.
来月からアルバイトとして雇わせていただくためにいろいろ連絡、調整などから。
「第一回」統合収穫祭
Written by bonohu in misc on 木 18 3月 2010.
またの名を「統合データベース講演会: AJACS本郷6」。思ったことをつらつらと。
何人あつまるか、そしてどういう人が集まるのか、全く読めなかったが、こういう人に参加してもらえたらと意図した人が、ほとんどすべてtwitter経由で知って参加してくれた感じだった。結果として、会場のDBCLS教室がほぼ埋まるぐらいの30人ほどで。2/3ぐらいが関係者だったけれども、今までお互い何をしているのか知らなかったのを知るいい機会になったのだから、それは全く気にしていない。
中身に関して、実はちゃんとプレゼン出来るかなーと心配していたことを白状する。しかし、見事にその予想は裏切られ、この一年間彼らと向きあってやってきたさまざまなことが、思った以上にいい意味で「伝染」していて…（涙）。しかも、話してくれたRAさんのうちほとんどの人が来年度も残ってくれるわけで、今後のことを考えると期待を超越して、むしろオソロシイ。
それにしても、ustream配信が伏兵だった。こちらは補助的な役割かと思っていたが、むしろ主たるコミュニケーション手段という感じ。最大で80人ほど見ていたなんて、想像すらしなかった（せいぜい、会場の人＋10人そこらかと思っていた）。会場にいる人もこちらにコメントや質問を書き記したりで、これからのこの種のイベントのあり方を考えさせられた。これは今後も続けていくべき。ustream配信も、この統合収穫祭も。次回は、一年後といわず、半年後の秋ぐらいにやりたいねー。「秋の収穫祭」に乞うご期待！
事前の自発的な合宿をやったり相互に密に教え合って素晴らしいプレゼンをしてくれたRAのみんな、夜の部を含めて詳細を全く支持しなくてもそれぞれ動いてくれてこの会を支えてくれたDBCLSのみんな …
某ベータ公開
Written by bonohu in misc on 木 18 3月 2010.
に向けてドキュメント的にWPに書き溜める。
ヒワ
Written by bonohu in misc on 水 17 3月 2010.
大学院生当時のツライ生活を思い出すことが立て続けに。
前世代配列解析
Written by bonohu in misc on 月 15 3月 2010.
CUIでそれをやる特訓。これまで半年かけて身につけてもらったコンピュータリテラシがあってこそ、この訓練に耐えられる。これができないと「次世代」のそれは無理だから。
統合TV for Ensembl revised again
Written by bonohu in misc on 月 15 3月 2010.
一番若いRAさんの手によって。
タイトルの配列比較だけじゃなくて、新しいインターフェースの使い方がいろいろと紹介されているので必見であることは間違いない。見れ！
がんばれニッポン
Written by bonohu in misc on 月 15 3月 2010.
パラリンピックもサイエンスも。
円周率の日
Written by bonohu in misc on 日 14 3月 2010.
というわけで某一周。
春何番？
Written by bonohu in misc on 金 12 3月 2010.
風がきついが、一時的に椅子＆テーブルで食事できるぐらいの陽気。
今日の統合牧場
Written by bonohu in misc on 金 12 3月 2010.
最大瞬間風速で、9人ものRAさんが！酒を持たしてやることぐらいしか「司令」にはできぬが、「合宿」の成功を祈る。
私 待つわ いつまでも待つわ
Written by bonohu in misc on 金 12 3月 2010.
返事が来たので、某インターフェース対応。入力ミスを減らすために、明示的に未入力値はそれとして「入力」してもらうようにする。そして、また別の返事待ち。
久しぶりにプレゼンモード
Written by bonohu in misc on 木 11 3月 2010.
に、某作戦会議の結果を受けて移行。最善を尽くしたい。それ以外に某インターフェース対応も少々。そして、返事まち。そういえば昨日のメールの返事も来ていない。
その合間に…
Written by bonohu in misc on 火 09 3月 2010.
来週の講演会の準備でMacにソフトウェアアップデート＆Xcodeインストール。RAさんたちがたくさん居る日でよかった。今後の進め方等についても相談したりして、.DBへとシフト着々と。
某システム
Written by bonohu in misc on 火 09 3月 2010.
sortした結果がおかしいことの原因の一つと思われれる謎のレコード群について問合わせのメールを書く。それとともにnumericalにsortされていない原因を探ると、どうも型がアレのよう。なぜtext型なのか？一から作りなおさないとダメかな、やっぱり。
Thank you!の日
Written by bonohu in misc on 火 09 3月 2010.
とはいえ、今のアレた生活には満足できない現状。