Category: misc

目を見張る

Written by bonohu in misc on 土 24 7月 2010.

RAさんたちのそれぞれの得意分野を活かした成長ぶりに。素晴らしいロゴがまた追加され、ますます完成度が高くなった統合TV。統合牧場技術開発部のデータ解析開発。この高いモチベーションを維持していって欲しい。

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お願いではありません命令です

Written by bonohu in misc on 金 23 7月 2010.

あまりやりたくなかったが。DBCLSの統合牧場にていろいろといいかんじにやっているのにそれがただ議論されては消えるという「鉛筆(シャープペンシル)で書いては消しゴムで消し」ていく状態だったので。試験問題の答えのように結論だけ残せばいいってもんじゃないんよ。もちろん、twitterにその断片があるのだろうけど、それをまとめるのも立派な「研究」のプロセスだから。しっかり「ペンで書きとどめ」ていくように。きっとあとでそれを見返すことがあるから…。

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発現統合reloaded

Written by bonohu in misc on 木 22 7月 2010.

今後に向けて、再構築が本格的に。やはり一人ほそぼそとやっているよりも複数人で議論したほうがよくなるわけで。

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distinctに泣く

Written by bonohu in misc on 金 16 7月 2010.

とりあえず、distinctを足してみるとある程度は解決された。あとは、人間がみるとダブっていると思うエントリの除去が必要。

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EMBOSS-6.3.0

Written by bonohu in misc on 木 15 7月 2010.

EMBOSS-6.3.0が出たらしいので、とりあえずコンパイル。Support for BAM/SAM filesもあるので期待できそう。いろいろ読み解きたいのだが、一人じゃあまりにも非力なのでみんなでやりましょう!

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某書き物

Written by bonohu in misc on 水 14 7月 2010.

Google docsで書き込んでいたのだが、よく考えたらそれをeditorとshareするというのもオモシロイ試みだと思ってやってみた。まだまだ不完全だが、ここまで書いているんだということが先方にも伝わるので良いシステムではないかと思ったり。

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Biocuration2010

Written by bonohu in misc on 火 13 7月 2010.

で、発現統合プロジェクトのキュレーション活動を報告しようと意気込み、話しあってアブストラクトを書き上げたものの、一ヶ月近い締め切り延長で最後の最後にヤル気を失った一日。

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BMB2010抄録登録

Written by bonohu in misc on 月 12 7月 2010.

日曜日の晩にYoruFukurouを落として書き上げた二つを一晩寝かせた上でもう一度直して午前のうちに処理。

さらに統合牧場技術開発部と発現統合プロジェクトを一体的に位置づける方向で頭の中の整理。大分やるべきことが具現化してきた。

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某ユーザー会ワークショップ@東京

Written by bonohu in misc on 金 09 7月 2010.

衝撃を受けつつ出陣。ランチは地鶏やにて。

ワークショップ自体は大阪と同じ内容ということだが、基本的には聴きやすくなっていたり。聴衆の数も倍以上で、ユーザーレベルも異なっていてそれなりに飽きることもなく。

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831lab

Written by bonohu in misc on 火 06 7月 2010.

今日開店ということで寄ってみた。店の中でレタスを育てる、輸送コストは0の新しいハタケ。是非ガンバッテ欲しいので、景気づけ(マーキング)にBLTを。今後お世話になりそう。

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重なるときは重なる

Written by bonohu in misc on 月 05 7月 2010.

Pocket WiFi 機種変更。ネットワーク回線速度測定の数値的にはそれほど変わらないが、USBが一つしかないMBA的にはそこを占有しなくなっただけ、利便性が上がることが見込まれる。

帰りにHDMIケーブルを上野のヨドバシで買って帰り、接続。デスクトップが広くなった!

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ADSL開通

Written by bonohu in misc on 日 04 7月 2010.

ブロードバンドルーター兼のADSLモデムに、MacMiniをつないでそこを無線LANのアクセスポイントに。あとはHDMIでモニタに接続すれば完璧だ。

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Shiga.R#NA

Written by bonohu in misc on 金 02 7月 2010.

にて発表。DBCLSの紹介を中心にテキストマイニングネタを(発表資料)。Osaka.Rな人をはじめ、関西の有志たちと交流できたのが大変有意義だった。

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某ユーザー会ワークショップ@大阪

Written by bonohu in misc on 金 02 7月 2010.

にて主にLSDB関係のテキストマイニングな話を中心に広報普及活動。これまでやったことのないお題での話だったこともあり、終わったらいつも以上にヘトヘトに。聴衆は20人ちょいであったが、話の後に協力的な申し出や示唆的な意見を頂く。黙って公開されるのを待つんじゃなくて、一人でも多くの人が「はよ公開せんかい!」と声を上げることです。そういった声に励まされてやっているのだな、とまたまた再確認。

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4年目突入

Written by bonohu in misc on 木 01 7月 2010.

であると同時に月初めでもある。やるべきことのリストをEvernoteにupdate。相手の事情で変えられてしまうのは仕方が無い気もするが腹立たしくもある。もっと(自分の考える)発現統合に時間を割いて精進すべし、それぞれのyouknowな人達が動いているのをうまくまとめて前に進むようにしむけつつ…。そして夕刻、大阪に空路旅立つ。

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丸3年

Written by bonohu in misc on 水 30 6月 2010.

今の所属に来てから。これまで良かれと思ってやってきたことは果たしてライフサイエンス分野のデータベース統合化、ひいては科学の発展に少しでも寄与できたのだろうか?

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RDFの2つの謎

Written by bonohu in misc on 火 29 6月 2010.

ちょっと前から某ポータルサイトに我々の提供サービスのRSSフィードが表示されなくなっていて、それについて原因を探っていただいた。そしたら、一つめは中身に&があったせいで処理が途中でおちていたせいだったらしい。もう一つは、コメントSPAMが来たときにそれを自動的に消すせいで、提供したいRSSの内容も一緒に消えてしまうという。更新されたときにtwitterにも流しているので、それのRSS使うようにしたほうがヨサゲかも。

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黒い林檎

Written by bonohu in misc on 日 27 6月 2010.

ポチってから8日、ようやく。一回り大きくなった気がするが、かなり薄くなり、重量感が増した感じ。自宅作業用の私費購入なのだが…

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AJACS&DDBJing共催を振り返って

Written by bonohu in misc on 日 27 6月 2010.

それぞれの講習会の温度差を感じた二日間だった。それぞれをみることで自分たちについて改めて知ることが出来る良い機会だったのではないかと。

今度は三島のDDBJにてAJACS&DDBJingを共催できればと。

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ホワイトビンゴ

Written by bonohu in misc on 土 26 6月 2010.

二次会からの参戦。持っていったプレゼントに喜んでいただいて、とても嬉しかったり。先々月の会に引き続き、ビンゴゲームでチーム勝利!今回も何も貢献しておらず、ただ運がいいだけ。

末永くお幸せに。

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AJACS & DDBJing in 東京 1日目

Written by bonohu in misc on 水 23 6月 2010.

講習会で話すのは実は久しぶり。発現統合プロジェクトで作ってきたRefExのお披露目ともなった。まあ、こんな感じでしょう。やっぱりデータの重複を取り除くことをしないと気になるなあ。

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Shiga.R

Written by bonohu in misc on 火 22 6月 2010.

滋賀.Rなのに、なぜか@十三。席数が限られていますので、関西な方早めに是非。話しますし、この機会にオフラインに交流しませんか?

Shiga.R #NA : ATND

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