「GEO目次による低酸素刺激前後のトランスクリプトームの種横断的解析」
Written by bonohu in misc on 土 21 7月 2012.
トーゴーの日シンポジウムにてポスター発表。個人的な研究テーマとしてやってきた低酸素刺激による比較トラン …
Category: misc
共同研究打ち合わせ
Written by bonohu in misc on 月 09 7月 2012.
解き明かしたい現象が共有できる研究テーマであれば、「解析請け負い」とか言われることはない。自分がやりたいこと …
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 土 07 7月 2012.
中4.5週間。来週からの出張に備えて。
「新型シーケンサーから得られる大規模DNA配列データを解釈し活用する：統合データベースからのアプローチ」
Written by bonohu in misc on 金 06 7月 2012.
Ingenuity Pathways Analysis ユーザーミーティングにて2日目の2012/08/03に標記のお題で。本務でやっている新型シーケンサーから出てくるデータを利用する術を …
内藤コンファレンス
Written by bonohu in misc on 金 29 6月 2012.
酸素生物学というテーマでガッツリ勉強させてもらった。とくに酸化ストレス方面はいろいろと。本業絡みのところ …
BioMed Central Editors’ Summit 2012
Written by bonohu in misc on 日 17 6月 2012.
東京ドームホテルにて。BMC GenomicsのAssociate Editorをしている関係上、参加させていただく。研究成果をオープンアクセスにしていくことは「知のめぐり」をよ …
「バイオインフォマティクス:データベース統合化によるアプローチ」
Written by bonohu in misc on 金 08 6月 2012.
というタイトルで、日本人類遺伝学会第57回大会の教育講演で話す抄録（以下）。英語のタイトルも登録時に必要だったので'Bioinformatics: an integrated database approach'とした。
> > DNAマイクロアレイや新型シーケンサーに代表される大規模解析は、かつては大 …
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 火 05 6月 2012.
見苦しく暑苦しいので。中三週間。間隔が狭まっている。。
「知のめぐりの良い生命科学研究者の10の心得」
Written by bonohu in misc on 土 02 6月 2012.
というタイトルで、第52回生命科学夏の学校にて話す抄録（以下）。若手へのメッセージも合わせて。
> > 各種情報は「ネット検索」によって10秒もかからないうちに簡単に得られるようになり、生命科学研究者の身 …
GGRNA published
Written by bonohu in misc on 月 28 5月 2012.
週末に校正がもう一度返ってきて、すぐ返したら29日までにpublishすると。そしたら28日の夜に出ていたという。DBCLSからの成果発信特別編ということで「新着論文レビュー」に日本語で。ほとんどの日本人に …
Proofreading
Written by bonohu in misc on 木 17 5月 2012.
中1日で返す。あとは掲載を待つのみ
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 火 15 5月 2012.
見苦しく暑苦しいので。中三週間。
GGRNA accepted
Written by bonohu in misc on 日 29 4月 2012.
投稿していたGGRNA論文。移籍395日目の快挙。おめでとう！
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 火 24 4月 2012.
伸びてきた＆暑くなってきたので。中五週間。
2012年の計
Written by bonohu in misc on 日 01 1月 2012.
普段から思って口にもしていることだが、明文化して後で振り返る際のマイルストーンとなるように。
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個別ラボだと …
農業生物資源研究所
Written by bonohu in misc on 月 19 12月 2011.
共同研究打ち合わせで、大わしの方へ。近くにはよく来たのだが、入ったのは初めて。11年前＆六ヶ月しか住んでいなかったの …
百聞は一見にしかず
Written by bonohu in misc on 金 16 12月 2011.
やはり会って話ししたほうがはるかに説得力もあり理解させやすいことを再認識。学会期間中の共同研究打ち合わ …
フォーラム「もし分子生物学者がGoogle+の招待を受けたら When molecular biologists meet Google+」
Written by bonohu in misc on 木 15 12月 2011.
企画＆司会させて頂きました。参加者は自分が勘定した時点で約80名。午後8時台というありえない時間設定の割には集まりは良かったかなあ、と。まだ見ていない方はまずは見てください …
ワークショップ「役に立つデータベース、役に立たないデータベース」
Written by bonohu in misc on 水 14 12月 2011.
講演させて頂きました。内容は英語版コンテンツのDBCLS&NBDC紹介といったところですが、結果として大阪弁（！）で紹介というアレ。スライドはslideshareでどぞ↓。
ブースアテンダー
Written by bonohu in misc on 火 13 12月 2011.
として。これまでとは違う陣容で。うちは統合DBの研究開発をやっていますと説明しても、NBDCとDBCLSは何が違うんですか、一つでいいんじゃないですか的な質問には苦しい応答。早く一つに …
'119'
Written by bonohu in misc on 日 11 12月 2011.
血が止まらず…自分でこの番号をかけたのは多分初めて。大事に至らなくてよかったが。
大規模データ処理勉強会 ～「大きな」データと対峙する（仮称）～
Written by bonohu in misc on 木 08 12月 2011.
我々にとっては超絶アウェイの中。頭数だけはかなり集まったものの、いったいどういう人達なのかは読めず。大規模データの一つに我々のやっているような分野もあることを知っていただけたのなら幸いです。
研究員さんもRAさんも
Written by bonohu in misc on 水 07 12月 2011.
来てもらいやすい環境にするべきだが。難しいところである。
HJA-307IT
Written by bonohu in misc on 火 06 12月 2011.
歩数計が活動量計に。ログ管理が専用アプリからウェブブラウザ経由でクラウド上に。ますますログを取るのが簡単 …
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 金 28 10月 2011.
中5週間。白髪が増えてきたのお
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 土 24 9月 2011.
中9週間！かなり伸びていた
統合TV論文
Written by bonohu in misc on 金 29 7月 2011.
ついに出た。
> > Tutorial videos of bioinformatics resources: online distribution trial in Japan named TogoTV > > > > Shin Kawano; Hiromasa Ono; Toshihisa Takagi; Hidemasa Bono > > > > Briefings in Bioinformatics 2011; doi: 10.1093/bib/bbr039 > > > >
オープンアクセス論文なので誰でも …
K大K研究所K研究室
Written by bonohu in misc on 火 26 7月 2011.
7月の出張シリーズの最後。共同研究打ち合わせにかつて5年間在籍したところへ。おそらく5,6年ぶり。研究所の入り口も、研究室の場所も、いろいろ変わってしまっていて …
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 土 23 7月 2011.
中5週間。大分伸びていた。
秘境へ
Written by bonohu in misc on 水 20 7月 2011.
7月の出張シリーズも中盤。かつて4年間ちょい在籍したところへ。4年前に辞してから一度もセミナーなどしたこともなかったので、セミナーを。聞きに来てくれた人はかつて居た研究室の人とPIのみという感じ。話した内容を一番必要としているはず …
831lab（再）
Written by bonohu in misc on 水 06 7月 2011.
去年の今日に開店した丸ビルのこの店の一周年ということで、ローストビーフを290円でいただく。考えてみると一年で4,5回しか来なかったなあ。海外出 …
「特務機関」
Written by bonohu in misc on 火 05 7月 2011.
エヴァンゲリヲン的な流れでこれまでのプレゼンで使ってきたこの言葉、不穏当であるというご指摘をいただく。今 …
足の裏のご飯つぶ
Written by bonohu in misc on 月 04 7月 2011.
とれた方がまた一人。おめでたいが、まさにこれから。取れたという事実ではなく、その門出を祝したい。
第二回神経情報基盤ワークショップ＠大阪
Written by bonohu in misc on 火 21 6月 2011.
「情報基盤」ということで関係あるかもしれないということで参加しましたが、データベースとして共有するというフ …
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 日 19 6月 2011.
5月にも一回刈ったはずだが、記録が見つからず…。最近たるんでいるなぁ
統合DBキックオフミーティング
Written by bonohu in misc on 金 10 6月 2011.
それぞれの課題をお互いに知るといったところ。「実務者連絡会」を別にするとのことなので、またそちらにて。「研究開発 …
RefExからGGRNAへ
Written by bonohu in misc on 木 09 6月 2011.
リンクする簡単なお仕事。それに絡んでいくつかの点の改善をお願いしたり。これで相互リンクがなされ、行ったり来 …
粛々と
Written by bonohu in misc on 月 06 6月 2011.
単純にやれることだけを進めるだけじゃねぇ。それと、モノを売るわけじゃないけど、市場調査はきっちりしてから事 …
第二回製薬協フォーラム
Written by bonohu in misc on 金 03 6月 2011.
＠職場。基盤技術開発プログラムの研究総括(PO:Project Organizer)が製薬系の方ということもあり、それに採択されたDBCLSの研究者と製薬協関係の数社の実務者の方々との交流会を仕切らせていただく。製薬企業側の …
ライフサイエンス分野の統合データベースの活用法とその演習（その弐）
Written by bonohu in misc on 月 30 5月 2011.
ということで、明治薬科大学にて「ライフサイエンス分野の統合データベースの活用事例の演習」ということで、遺伝子 …
東京女子医科大学遺伝医学研究会講演会
Written by bonohu in misc on 金 27 5月 2011.
都営大江戸線の若松河田駅が最寄りの東京女子医科大学にて話す機会を頂き。結果として、これまでの統合DBプロジェクト終了後初めての外部講演で、今年度 …
ライフサイエンス分野の統合データベースの活用法とその演習（その壱）
Written by bonohu in misc on 月 23 5月 2011.
ということで、明治薬科大学にてライフサイエンス分野の統合データベースの活用法（実演を交えた講義）をやらせて …
大阪復権？
Written by bonohu in misc on 金 20 5月 2011.
関わることになった共同研究のからみもあって、「脳科学研究を支える集約的・体系的な情報基盤の構築（神経情報基 …
一回休み
Written by bonohu in misc on 木 19 5月 2011.
諸事情あって一日休み。もちろん、それとは関係なくお構いなしに用事は降ってくる。
墓穴を掘る
Written by bonohu in misc on 水 18 5月 2011.
そうとしか思えないことを新よりの緊急入電で知る。どうでもええわ～好きにしたら～。
相手変われど主変わらず
Written by bonohu in misc on 火 17 5月 2011.
外部に向けた勉強会の世話仕事。なんだ、結局去年までとやっていること変わらへんやん。
恩に報いる
Written by bonohu in misc on 月 16 5月 2011.
今年度BP3D開発の仕様説明をセンター長に。
第70回日本癌学会学術総会演題登録もやっつける。
第10回Spotfireユーザー会 ワークショップ
Written by bonohu in misc on 月 09 5月 2011.
Spotfireはデータの統計解析と可視化のためのソフトウェアです。この会の会長を務めていることもあり、2011年7月1日に大阪、8日に東京にて話しします。
> > Title: Visualization and sharing of DNA sequence data from next generation sequencing(NGS) technology by TIBCO Spotfire Web Player（TIBCO Spotfire Web Playerを利用した次世代シーケンサーによる大規模ゲノム配列データの可視化と共有化） > > > > 要旨（アブストラ …
情報は発信するところに集まる
Written by bonohu in misc on 木 28 4月 2011.
アタリマエのことを、またもや体現してしまった。これに早く気づいて欲しいんだけどねぇ。
Weaving a story
Written by bonohu in misc on 月 25 4月 2011.
これまでやってきたこと、やらねばならないことをまとめながら。