Category: misc

OICR

Written by bonohu in misc on 月 26 10月 2009.

Ontario Institute for Cancer Research。今日お世話になったBiomartのArek Kasprzykだけでなく、BINDをやっていたB. F. Francis Ouellette、HapMapとかReactomeとかWormbaseとかCGI.pmとかいろんなことでこの世界で超有名なLincoln Steinが「常勤で」居る研究所と知り、驚く。ここはこれからはもっとtranlational medicineを目指すBioinformaticsな研究者が集まり、さ …

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長い一日

Written by bonohu in misc on 土 24 10月 2009.

再び。ACなので機内エンターテイメントが日本人に最適化されておらずむしろ助かる(だが、まだ見ていなかった「おくりびと」はしっかり見たが)。しかもAC110VやUSB電源があって大助かり。それもあってこれを書いていたりする(アッ …

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Written by bonohu in misc on 金 23 10月 2009.

私にどうしろというのか。それを減らしたところでそっちに行くかというとそうでもないのではないだろうか?ま、私 …

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口撃再開

Written by bonohu in misc on 火 13 10月 2009.

満を持して、DNA配列との格闘再開。喉が渇くのは気のせいではなかろう。オリジナルなSayaMatcherを久しぶりに動かし、某解析パイプラインを後進に伝授する。

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どうしてDBCLSで「教育」をするのか?

Written by bonohu in misc on 日 11 10月 2009.

よくDBCLSはDB統合のための拠点なのだからDBの構築維持管理だけしていればいいのにといぶかしがられるが、上に対する答えはきわめて簡単。使いたい人もこれから使うべき人も、生命科学分野のDBに関して多くの場合、教育されていないか …

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帰路

Written by bonohu in misc on 土 10 10月 2009.

不思議な縁で学会で一緒だった人とずっと同じ。SFO行きが一時間ほど遅れたが、元々乗り換えに余裕があったためセーフ。SFOからNRTへは約11時間のフライトだったが、飯食って新劇場版エヴァンゲリオン序を見ていたら寝て …

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MGED12 最終日

Written by bonohu in misc on 木 08 10月 2009.

我らがR研のKさんが口頭発表。引き続きFANTOMアクティビティとして頑張ってくれているのを見るのは大変喜ばしく。今後どういう展開を考えているのだろう?そこで自分に対して思ったのは、以前の自分を引きず …

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MGED12 3日目

Written by bonohu in misc on 火 06 10月 2009.

自分のポスター発表。なんとか凌ぐ。新しく始めたDBCLSの発現統合プロジェクト(togoexp)と、DRA(DDBJ Read Archive)との協力体制について早い時期に発表できたこと …

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MGED12 1日目

Written by bonohu in misc on 月 05 10月 2009.

チュートリアルな1日。午前にDeep sequencing analysisのtutorial、午後に3つのWorkshop(Submitting UTHS data to GEO/ArrayExpress, MAGE-TAB annotation, BioConductor)。いろいろ新しい有益な情報で知恵熱が出そう。

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Phoenix, AZへ

Written by bonohu in misc on 日 04 10月 2009.

ちょうど10年ぶり。「I'm drunken!」の迷言を産み出したマイクロアレイの会議で行って以来。自分は果たしてあの頃思い描いていた「10年後 …

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小さな世界

Written by bonohu in misc on 土 03 10月 2009.

昨日のそれに追い討ちをかけるように、普段お世話になっている方がそこに関係していることがさらに判明。この世 …

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さすが変態牧場!

Written by bonohu in misc on 火 29 9月 2009.

やはりg86な変態たちには、実際にマシンを使って何かをやっている現実を見せるのが一番インパクトがあるようだ。例えばmysql一つとってもそれが実際にどう使われているのか、実際に …

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変更

Written by bonohu in misc on 金 25 9月 2009.

いつものほうとう屋、いつのまにか全席禁煙に。時間によってはクレカが扱えないレジのおばあさんがいたりするこ …

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電撃訪問

Written by bonohu in misc on 木 24 9月 2009.

来てもらえるのはありがたいが、その途中音信不通にしているわけなのだからきっちりとupdateはしていただきたいのが本音。ほんの少し誰かさんぽ …

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停電前夜祭

Written by bonohu in misc on 水 23 9月 2009.

停電のため冷凍庫&冷蔵庫のものが駄目になるという名目の。新人デビューの場となってよかったが果たして…。

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2日連続WiiFit

Written by bonohu in misc on 水 23 9月 2009.

なんていつ以来だろう。今日はお昼に眠気覚ましがてら。三角のポーズをやってみた以外は、昨日とほぼ同じメニュー …

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PHP×PostgreSQL reloaded

Written by bonohu in misc on 月 21 9月 2009.

改訂版 今すぐ導入!PHP×PostgreSQLで作る最強Webシステム (Gihyo Expert Books)

ちょうど10年前にも同じようにマイクロアレイデータを見せるためのウェブサイトを作るために「手習い」を始めたのを思い出した。しかも同じ著者によるPHPの本で。

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迷惑電話

Written by bonohu in misc on 金 18 9月 2009.

普段滅多に電話がかかってこないうちの部屋に電話がじゃんじゃんかかってきた。それも人間からじゃなくて機械 …

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会議三つ

Written by bonohu in misc on 木 17 9月 2009.

本当はもう一つあったのだが。その後の会議の準備もあってパス。さすがにこれだけあると他には何にもできない。復 …

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スーパーあずさ29号

Written by bonohu in misc on 月 14 9月 2009.

で松本へ。明日からの日本遺伝学会第81回大会でのお話に備える。「プロジェクト」の説明のスライドを新規に作成。「センター」との関係を鮮明に。

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異種格闘技再開

Written by bonohu in misc on 月 14 9月 2009.

昨日からまた火がついて。パラメタいじってもっと閾値を上のほうで足切りした方がいいように思う。どうせ下の方 …

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emobile復帰

Written by bonohu in misc on 月 14 9月 2009.

朝起きてもだめだったので、さすがに今日帰って来たら何らかの対策(iPhoneでテサリング?)をしようかと思っていたら、直っていた…。障害 …

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明日の朝食

Written by bonohu in misc on 水 09 9月 2009.

どこにもそれとは書いていないが、どうやら北島康介さんのご実家の肉屋さんのそれ。マルチカにてゲット。

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AJACS蝦夷2 2日目

Written by bonohu in misc on 火 08 9月 2009.

今回初の試みの2日目は中・上級者編ということでこれまでの1日だけの講習会では時間が足りなくて紹介できなかったツールやちょっと高度な使い方を中心に。自分は「次世代シーケンサーから得られる遺伝子配列デー …

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AJACS蝦夷2 1日目

Written by bonohu in misc on 月 07 9月 2009.

去年と同じ部屋なものの、180°回転した状態で。Linux(CentOS)、WindowsXP, VISTAとOSを選べる中からXPで講習。ブラウザもIEをベーシックにFirefoxもインストールされていて良心的(しかしバージョンは2とちと古かったが)。

イントロとしていつもの …

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