Genome Editing Bluebacks
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 06 7月 2020.
ゲノム編集とはなにか
講談社ブルーバックスから広島大学大学院統合生命科学研究科 山本卓教授による「ゲノム編 …
Category: misc
Important is real discussion
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 03 7月 2020.
重要なのは対面の議論
出張が解禁になって、訪問者が増えてきた。 その人たちとの議論がとても重要だと今更ながら …
June2020
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 30 6月 2020.
2020年6月を振り返って
予算獲得のためにいろいろ考えたり、書き物したりの毎日だった6月。
リモート参加しようと思っていた今月のSPARQLthonであるSPARQLthon93 …
BoYata
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 21 6月 2020.
ノートパソコンスタンド導入
MacBookProでの作業はもう長い間やっているものの、長時間同じ姿勢を取ってしまいがち。 そこで自然と、体勢を変えたりして体が固まら …
Fermentation mash
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 06 6月 2020.
仕込み
県外から初の来客。 そういうわけで、やはり初の街のご案内。 数ヶ月前にも自分が紹介される側で来たのだが、今 …
May2020
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 31 5月 2020.
2020年5月を振り返って
StayHomeで家に缶詰の大型連休はかなり久しぶりではないだろうか。 その前から在宅続きのため、より長く感じたのは私だけではなかろう。
前半は、初の担当分の大学院講義の準備。 こ …
First lecture without students
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 15 5月 2020.
生徒のいない初授業
大学に転職して1ヶ月半、ついに本日(2020/05/15)についに初授業。 「先端生命技術概論」という毎回違う先生が …
Statistical Genetics Seminar Book
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 09 5月 2020.
ゼロから実践する遺伝統計学セミナー
異動する前に出版社の方からご恵贈いただいていたのだが、バタバタで見さ …
Dishwasher dryer
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 08 5月 2020.
食器洗い乾燥機導入
Stay Home励行ということで、自炊が増えて、洗い物が増えた。 なかなか大変ということで、食器洗い乾燥機を検討してみよ …
roomba reloaded
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 03 5月 2020.
ルンバ復活
6年前に買ったルンバ871。
他の掃除機との併用ぐらしでそんなに利用頻度は高くなかったものの、すぐに充電切れになるように …
R.I.P. James Taylor
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 02 5月 2020.
追悼James Taylorさん
TwitterにGalaxyの生みの親であるJames Taylorさんがなくなったと流れてきて、驚きを隠せなかった。 彼とは去年(2019年)のCold Spring Harbor Laboratoryでの The Biology of Genomes で会って、彼のポスター …
April2020
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 30 4月 2020.
2020年4月を振り返って
怒涛の1ヶ月が終わろうとしている。
ラボの立ち上げということでほぼゼロから始めていたものの。 移ってきてすぐに周りのラボの方との挨 …
Website for bonohulab
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 29 4月 2020.
bonohulabウェブサイト
bonohulabのウェブサイトは、着任当初は来たばかりで大学で提供されているサービス等全くわからなかったこともあって、自鯖上に作った …
Convict Conditioning Started
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 19 4月 2020.
プリズナートレーニング開始
ようやく、生活も落ち着いてきたと思ったら、「週末・平日に関わらず外出を自粛」要請と …
launching bonohulab
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 10 4月 2020.
bonohulabの立ち上げ
埼玉医大でのきしょいラボ(2003年)やDBCLS(2007年)など、新しい研究室のセットアップをこれまで何度か経験してきたが、今回は …
March2020
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 31 3月 2020.
DBCLSでの約13年を振り返って
本日2020年3月31日をもってライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)を辞めました。 いつかはこの日が来るだろうと勤めだした …
eBooks for Dr Bono Series
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 09 3月 2020.
DrBono本と道場本の電子版
先日公開したエントリ、生命科学データ解析の本ガイドでも紹介した以下の2冊の電子版が、医書.jpより本日2020年3月9日に発売開始に。
26th Workflow Meetup
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 04 3月 2020.
26th Workflow Meetup
なんとか開催になった26回目。 リモート参加も可能だったが、いつも通り、東京会場にて。 ほとんどリモート参加かと …
Feburary2020
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 29 2月 2020.
2020年2月を振り返って
2020年2月は前半に共同研究打ち合わせの出張があった他は出張も少なく、懸案の論文執筆を進めたり、データ解析を進めたり、研究を進めることができた。
そして、先月に続いて、論文の公開 …
AirPods Pro
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 19 2月 2020.
AirPods Pro
ずっと欲しかったAirPods Pro。 自分への誕生日プレゼントと思い、Apple Storeに行った時に売っているかも、と思って何回か挑戦。 2020年1月頭に出張先のSan DiegoのApple Storeでも探したがやはり品切れ。
そこで観念して、帰国 …
Books for Biological Data Analaysis
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 16 2月 2020.
生命科学データ解析の本ガイド
2019年に生命科学データ解析関連で4冊本を出版したため、「ぼうのうさんの本を読みました」と言われてもまず「どの本？」と訊き返すと …
25th Workflow Meetup
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 12 2月 2020.
25th Workflow Meetup
前回は大阪会場から参加。 25回目の今回はいつも通り、東京会場での参加。
今回は、学認クラウドのハンズオンがあり、実際に …
January2020
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 31 1月 2020.
2020年1月を振り返って
2020年1月はPlant and Animal Genome Conference (PAG)に行った影響で、出張外泊数にして年頭から9泊にもなった（PAGでの詳細は、各日のブログエントリ参照。1日目、2日目、3日目、4日目、5日目）。
また、年末に …
bio info meeting around 10th
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 28 1月 2020.
バイオとインフォの会10回目（くらい）
同業種飲み会であるバイオとインフォの会、だいぶご無沙汰していたが、今回予定が …
Uber debut
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 16 1月 2020.
Uberデビュー
空港からの行きは乗せてもらって、帰りは自分でアカウントを作って、今回のPAG出張でUberデビュー。 支払いに一切現金を使わず、運転手 …
Plant and Animal Genome Conference XXVIII day5
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 15 1月 2020.
PAGXXVIII day5
最終日の5日目も、朝8時からplenary lecture x2。 プレゼンテーションがよく見える前方に陣取るが、場所を移してもやはり寒い。 終了後、トイ …
Plant and Animal Genome Conference XXVIII day4
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 14 1月 2020.
PAGXXVIII day4
今日も、朝8時からplenary lecture x2。 プレゼンテーションがよく見える座席は極寒の地でもあるが、着込んで我慢する。
休憩時間中に …
Plant and Animal Genome Conference XXVIII day3
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 13 1月 2020.
PAGXXVIII day3
朝8時からplenary lecture x2。 その後、ポスター発表。 電子メールで通達された番号とアプリで検索して出てくる自分のポスター番号 …
Plant and Animal Genome Conference XXVIII day2
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 12 1月 2020.
PAGXXVIII day2
朝8時からEBIのworkshop、Genome annotation resources at EMBL-EBIに参加。 知っていることも多いが、updateすべき情報も多く、ためになる。 途中から、Non-coding RNAのworkshopに。 R研のHさんの発表を拝聴する。
夕方、いつも通り最初のplenary lecture終了後、reception。
Plant and Animal Genome Conference XXVIII day1
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 11 1月 2020.
PAGXXVIII day1
4年ぶりのInternational Plant and Animal Genome Conference (PAG)参加。 朝8時からArthropod genomics and genome engineering のworkshopがあるなど。 これ以外にもArthropod関係のworkshopが複数、色々とあることが冒頭にアナウンスされ、予定に追加。
California roomの奥で時折PCを充電しつつ休憩。 かつてはこの奥で口頭発表してい …
Plan 2020
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 01 1月 2020.
2020年の計
明けましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いします。 年頭恒例にしている「一年の計は元旦にあり」。 今年 …
Review 2019
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 30 12月 2019.
2019年を振り返って
もう今年(2019年）もわずかということで、今年の年頭に書いた「2019年の計」に沿って、2019年を振り返ってみたい。
1 公共遺伝子発現DB目次の論文化
AOEの論文化は、結果として …
Introduction to Medicine
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 27 12月 2019.
はじめての医学
単行本「はじめての医学」を編集に携わられた編集者の方から年末滑り込みセーフでご恵贈いただい …
Nights in hotels 2019
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 25 12月 2019.
2019年出張外泊数
三島勤務になった2014年以来、数えて来た「仕事で外泊」した日数。 年内の出張が全て終わって、2019年の日数が確定。 その結果、2019年は91泊で昨年より8泊増えて、さ …
Books published in 2019
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 21 12月 2019.
2019年に出版した本
2019年もあと10日となって色々と振り返りモードな情勢。 私も振り返ってみたい。
2019年は、結果として4冊の本を世に出す結果となった。 去年の今頃、全て期限内に出せるか不安だったが、編集担当者や共著者の …
23rd Workflow Meetup
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 16 12月 2019.
23rd Workflow Meetup
前回は参加できなかったが、23回目の今回は参加。
HISAT2-StringTieによる新規transcript発見ワークフローを自分で作ろうとしたのだが、Live codingの話題としていただき、一気に進んだ！ あとは、持ち帰って実際に動かしてみるところに。 あ …
Bee Summit 2019
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 13 12月 2019.
ミツバチサミット2019
最近、ミツバチのゲノム配列比較を共同研究でやっていることもあり、ミツバチサミット2019に参 …
42rd annual meeting of the molecular biological society of Japan day4
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 06 12月 2019.
第42回日本分子生物学会年会4日目
今日で最終日で、展示会も半日で終了。 名前の入ったポスター発表も本日。 相変わらず熱心に発表していたようで …
42rd annual meeting of the molecular biological society of Japan day3
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 05 12月 2019.
第42回日本分子生物学会年会3日目
今日は、午後1時から1時間、著書の合同サイン会ということで。
結果として、24冊の本にサインした。 サインした数としては、新刊の3冊はほぼ同数。
あとDrBono本と統合TV本がちょろっと。
ご購入い …
42rd annual meeting of the molecular biological society of Japan day2
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 04 12月 2019.
第42回日本分子生物学会年会2日目
朝起きるとbioRxivから連絡があって、先週末にアップした論文は新規でなく、以前に出してcloseされてしまったプレプリントのバージョンアップということでまとめていただいた。 そこで、その処理をすると程なく公開。 文字 …
42rd annual meeting of the molecular biological society of Japan day1
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 03 12月 2019.
第42回日本分子生物学会年会1日目
本日2019年12月4日より、今年の日本分子生物学会年会（分生）。
今年も基本的には、バイオデータベース(BioDB)コーナーのNBDC/DBCLSの出展ブースに。 日本で生命 …
autograph session at MBSJ42
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 01 12月 2019.
著者編者サイン会＠第42回日本分子生物学会年会
2019年は多くの日本語の本を出すこととなった。 まず年頭2月に、生命科学データ解析を支える情報技術(IT4BDA)を出版した。 システムエンジニア向け …
November2019
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 30 11月 2019.
2019年11月を振り返って
秋になって出張も多くなって、長らく月末の振り返りエントリがご無沙汰だった。 調べてみると7月以来で、四ヶ月ぶり。
2019年11月は中盤からずっと出張で、出 …
BioHackathon Europe 2019 day5
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 22 11月 2019.
#BH2019Europe day5
ようやく、朝起きるのが正常になった。 しかし、今日でBiohackathon Europe最終日。 Final wrap-upとして以下のまとめを。
- Achievements:
- 1 Clarified what is needed in the data production for gene expression data collection including FANTOM, GTEx and Human Cell Atlas …
BioHackathon Europe 2019 day4
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 21 11月 2019.
#BH2019Europe day4
やはり今日も、時差ボケでやはり朝早く起きてしまう。 このままボケたまま日本に帰れるか!?
まずは、昨日の続きで …
BioHackathon Europe 2019 day3
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 20 11月 2019.
#BH2019Europe day3
やはり今日も、時差ボケでやはり朝早く起きてしまう。 3日目にして初めて、gitterというメッセージングツールが使われていることを …
BioHackathon Europe 2019 day2
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 19 11月 2019.
#BH2019Europe day2
時差ボケでやはり朝早く起きてしまう。 感動的に美味い朝食のあと、午前9時からhack開始。
現在のさまざまな問題点をリストア …
BioHackathon Europe 2019 day1
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 18 11月 2019.
#BH2019Europe day1
パリ市内から会場のある郊外へ。 順調に乗り換えれると約1時間半のところ、途中で1時間の待ちぼうけをくらった。 最寄駅からは歩くのは非推奨だったよう …
BioHackathon Europe 2019 day0
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 17 11月 2019.
#BH2019Europe day0
Biohackathon Europe 2019に参加するため、今度はフランスシャルル・ド・ゴール空港(CDG)へ。 その移動時間、13時間余り。 パリは日本とは8時間の時差があるため、24+8 …
Statistical genetics 2019 day3
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 16 11月 2019.
第4回 ゲノムコホート研究における遺伝統計学 3日目
3日目の最終日には、奄美文化センターにて市民公開講座。 コホートに参加いただいた …