HMMER v3.4
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 04 1月 2024.
HMMER v3.4
ふと気づいたら、新しいバージョンのHMMER v3.4がリリースされてた。
これまで、Apple silicon Macでnativeには動かず、Docker上で動かしていたのだが、
普通にconfigure
してmake
したらエラーもなくすんなり …
ふと気づいたら、新しいバージョンのHMMER v3.4がリリースされてた。
これまで、Apple silicon Macでnativeには動かず、Docker上で動かしていたのだが、
普通にconfigure
してmake
したらエラーもなくすんなり …
明けましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いします。
あけましておめでとうございます。今年は初日の …
今年2023年はラボを主宰し始めてから早4年目。 去年からさらにいろいろと変化の年となった。
まずは自分自身の「特任」がとれたこと。 プロジェクト雇いの年 …
8月に有給休暇を早めに規定数以上取得してたので、この2023年12月は有給休暇の消化ということもなく、28日まできっちり出勤日だった。 12月恒例の日本分子生物学会年会にはじまり、Togothonへの参加(関東出張)だけでなく、初の学部1年生向けの講義など、まさに「師走」であった。 とくに道 …
去年からはオンサイトになった修論中間発表会は、ことしもポスター発表形式で。 昨年もそうであ …
毎年恒例にしている出張外泊数。 年内の出張がすべて終わって数が確定した。 2021年は11泊、去年(2022年)は22泊と倍増してきていた。 そ …
本日で2023年最後のラボミーティングということで、開催前のお昼休みに(いつもより早めに)集まっていただき、2023年一年お疲れ様という意味も込めて、ピザパーティー。 主には10月に入った新しいメンバーである学部3年生の歓迎会、そ …
色々と驚きの連続であったMBSJ2023だが、その一つがこの「サイエンスイラストレーターのお仕事展」。
ご好 …
千葉の幕張であった去年に引き続き、今年も恒例の分セーに参加。 今年は、久しぶりの神戸ポートアイランド。 分セ …
初旬にはバイオインフォマティクス講義の収録も終え、研究室内のことに取り組んだ11月だった。 新しい部屋の整備も進み …
去年(2022年)11月に4回目からちょうど1年後の2023年11月に5回目を。 5回目にして初のファイザー製で、市中の医院で接種してもらってきた。
副反応を予想し …
ミツバチサミット2019以来、4年ぶりのオンサイト開催ということで、今回も参加。
ミツバチサミット🐝 pic.twitter.com/DNHfeAOVKB
— オープンデータ推進者なの …
今年も11月の第一土曜日はホームカミングデーということで、恒例になりつつある工学部横の並木道の紅葉をチェックしつつ、散歩がてらに 振り返ってみると …
この10月から定年制雇用に切り替わり、これまでの卓越大学院がメインの大学院教育だけから学部(理学部生物科学科)の教育もカバーするように …
昨年に引き続き、今年もBioJapanに参加。 ちょうど職名も変わってというタイミングで、お披露目にもちょうど良く。 今年はフル参 …
昨年に引き続き、今年も酒まつりへ行ってきた。 ついに今年2023年、コロナ前の2019年と同じ規模での開催ということで。
まさかの。PayPayで支払えないレベルの人の混雑 https://t.co/4afh5adBKL pic.twitter.com/c94o07KmH1 …
2023年9月30日に特任教員(特任教授)を退職。 翌2023年10月1日に教授として採用されました。 これまでの卓越大学院のバイオインフォマティクス教育が本務のプロジェクト雇用(任期 …
2023年9月30日をもって広島大学大学院統合生命科学研究科の特任教員を辞めることになりました。
来月2020年4月からは転職して、バイオインフォマティクスの教育をしながら、生命科学分野の高速道路を使い倒して研究をす …
この8月は出張が3回あった上に盆休みもあったため、ラボにいる日が極端に少なかった。 その一つが、沖縄での講演で沖縄に行ったのは実に9年半ぶり。 また、月初めには学 …
台風6号の影響が懸念され、直前までちゃんと行けるのか不明な事態だったが、9年半ぶりに沖縄に行ってこれた。
2023年8月9日沖縄県立博物館・美術館(おきみゅー)講堂にて開催されたシ …
ラボ開設4年目にして初の学部生3年生を対象にした研究室見学会を今日2023年8月2日に。 限られた時間なので詳しい研究の内容などは話せなかったが、それは先月の7月にやった授業で話して …
この7月は出張もなく、ずっとラボに通う毎日であった。 しかし、学部授業、そして対面授業を3年4ヶ月目にして初めて行ったことは大きなイベントだった。 また、月末にはDBCLSの小野さんをお招きしてTogoTVthonなる統合TV製作者の集まりをローカルに開いたのも初めてのことだった。
相変わらず報道され …
大学に転職して3年3ヶ月半にして、やっと初対面授業。 3年前来てすぐに講義デビューはしたものの、自分の担当である大学院講義は基本、オン …
6月は学会年会とBioHackathon2023(とそれに続く関東出張)で出張が多く、合計12泊の外泊。 もちろん、月当たりの数では転職以来最多。 その結果、多くの人とあっ …
2019年に博多で開催して以来、開催できてなかった国際版のBiohackathon。 今年2023年、4年ぶりに香川県の高松と小豆島にてDBCLS BioHackathon2023開催。 日曜日に高松に集合して、続く月曜日から土曜日ま …
今年は(結果として)4年ぶりにオンサイトで。 しかも前回オンサイトで行われた東京・船堀にて。 そのころはまだ前 …
5月はオンサイトでの外部講演が2つ、大阪と米子に遠征。 米子でのそれは早くも統合TV化された。
バイオDXによるデータ駆動型生命科学研究 @ とっとりバイオフロンティア人材育成セミナー https://t …
年度が変わり、bonohulabでの4年目がスタート。 学生の数が5人から8人となった。 今年は大学院入学の問い合わせは博士課程後期、しかも社会人特別入試にかかわる …
G7広島サミットと広島大学75+75周年記念事業の食料安全保障シンポジウムが学内であるということで参加。
食料安全保障シンポジ …
2023年3月は BioDXのアウトリーチイベントや学会発表、そして初の研究会内でのbonohulabの研究紹介的なポスター発表など、対外的なイベントが多く。 懸案だった共同研究打ち合わせにも月 …
今日2023年3月25日で酒都西条に移転して丸3年になった。
2年目に比べると出張にもだいぶ行けるようになり、コロナ禍以前の状態に戻ってきているのではな …
研究科内でオンサイトでの研究発表会(ポスター発表)があるということで、発表した。 ちょうどコロナ禍 …
2023年3月5日(日)に開催したバイオDXを紹介するアウトリーチイベント「ゲノム解読から生物のプログラミング〜教科書の外へいこう 未来の …
去年は自分が講演した広島バイオテクノロジー推進協議会主催の広島バイオフォーラム。 残念ながらコロナ …
2023年3月13日〜15日まで、第67回日本応用動物昆虫学会大会が大阪府枚方市と京都府八幡市にまたがる摂南大学で開かれた。
今回も小集会の講師として参加。 コロナ禍でもオンラインで開 …
今月は、2月ということもあって行事が多く。 なかなか研究活動に時間が取れなかったものの、今年度導入した大型実験機器によるデータが取れてき …
昨年も実施したバイオDXのアウトリーチイベントを今年もやります! 今回のタイトルは、「ゲノム解読から生物のプログラミング〜教科 …
今月は、3年ぶり&現職初の海外学会参加でバタバタしていた。 3年ぶりのSan Diegoで大きな刺激を受け、また同時に大きな「種」も得てきた。 それをうまく育ててい …
3年ぶりのInternational Plant and Animal Genome Conference (PAG)参加。 すでに転職してから3年目も後半に差し掛かっているが、なんと転職後、初めての海外学会発表。 色々と必要な手続きがこれで良いのか、気を揉みつつ。
こ …
明けましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いします。
明けましておめでとうございます。今年も無事初 …
ラボ3年目の2022年は、「飛躍」の去年からさらに飛躍の年になった。
研究室関係のニュースはラボのニュースに取り上げて溜めてき …
この2022年12月は年末ということもあり、月末が29日から休み。 しかも、有給休暇を取得していないということで、28日もお休みということで、書類上は昨日27日までということであった。
この12月は久しぶりに参加の日本分子生物学会年会 …
去年はオンライン開催だった修論中間発表会が今年はオンサイト、ポスター発表ということで。 去 …
毎年恒例にしている出張外泊数。 去年(2021年)は11泊であったが、
来年はもっと増えるんだろうなあ。
という予測通り、今年2022年は …
普段から使っている自分の名前の入った論文を年代順にリストアップする検索式(日本語の論文を含めない自分 …
恒例の分セーに参加。 COVID-19の影響もあり、最後に参加してから3年もの月日が経過。 そのため、現在の所属に異動してから初めてということもあり、会 …
この2022年11月は、上旬にバイオインフォマティクス講義を取り終えてからは、大型機器の設置のアレンジなど、やはりバタバ …
昨年度(2021年度)はじめに、新しいメンバーを迎え、ボッチラボではなくなったのだが。 その後もラボメンバ …
先月(2022年10月15日)に出版されたセイヨウミツバチリファレンストランスクリプトームデータ構築の論文をNAROと共同でプレスリリース。 出版から1ヶ月以上かかってしまったが、き …
今年(2022年)3月に3回目に引き続き、ほぼ8ヶ月後に再び職域接種で4回目。 オミクロン株対応で今回もモデルナ製。
接種希望者が …