感情的にしかみえない
Written by bonohu in misc on 水 25 11月 2009.
まわりは基本的に研究費を減らされるということで。もう少し視野を広げて、考えてみることもしてみたら？
Category: misc
データベース「統合家」
Written by bonohu in misc on 水 25 11月 2009.
新しい職業として提唱したい。
'@DDBJ'
Written by bonohu in misc on 火 24 11月 2009.
登場人物が被り過ぎ。
キャリアパスセミナー＠東北大
Written by bonohu in misc on 火 24 11月 2009.
なるものをやることに。「生命科学分野のデータベースを統合する仕事：落ちこぼれ大学生が.DB(Doctor of the database)にいたるまで …
可視化してみると
Written by bonohu in misc on 火 17 11月 2009.
やはりデータのあらが気になる。TSをカスタマイズしてBLAT計算結果へ直リンク張ってみるとuniqueにmapされたところだけ抽出しているはずなのにそうはならず…。どうもrm関係らしい。そういえば、かつてこれを計算したときrmかけないと計算が終わらず断念した記憶がよみがえってきた。
そこで、rmしていないのをダウンロードして、それらを先週RAさんに構築してもらった計算パイプラインを利用して再計算してみる。とり …
可視化するために
Written by bonohu in misc on 月 16 11月 2009.
トロントで貰ってきた宿題を、とりあえずのバナーもどきを作って完了、提出。模様眺めモードに移行。
それと、某再計算 …
事業仕分け
Written by bonohu in misc on 金 13 11月 2009.
ネット上で模様を眺めながら自分の方も。g86たちにやってもらう分、自分自身でやる分。共に大きな進捗があった一日だった。
事業仕分けWS3まとめWiki
Written by bonohu in misc on 金 13 11月 2009.
家に帰ってtwitter眺めていたらWikiが必要という流れだったので、作ってみたら…。「導火線を引く」とこれほどまでに反応があるというのは、やはり普段から思うことがある …
セミナー三連ちゃん
Written by bonohu in misc on 木 12 11月 2009.
日常業務に復帰…と思いきや。セミナーはもっと聴衆を考えて用意してこようよ…。もちろん、いろいろな要因はあるのだ …
Spotfireユーザー会2日目
Written by bonohu in misc on 水 11 11月 2009.
昨日に引き続き。午後一で講演。MBAからの外部モニタ出力が機能せず、PDFをWindowsマシンで一枚ずつみせて話をすることに。ま、しょうがない。
無事（？）、これからユーザー会会長をやることになってしまった。本当 …
Spotfireユーザー会1日目
Written by bonohu in misc on 火 10 11月 2009.
六本木アカデミーヒルズにて。
統合データベース講演会＠東京農大
Written by bonohu in misc on 日 08 11月 2009.
これまで見た中で一番広い100人は入れるコンピュータ実習室にて。参加者は主に大学院生約30人。会場が広いこともあって、サイドモニターにプレゼンの画 …
Go for it
Written by bonohu in misc on 日 08 11月 2009.
とにかく、前につきすすんでいくしかない。生きている限り。できるところまで、できるかぎり、死力を尽くして。
チップチーム同窓会
Written by bonohu in misc on 金 06 11月 2009.
前の前の職場の。そこを離れて、早６年半。月日が経つのは早いものだ。
AJACSりんくう
Written by bonohu in misc on 金 06 11月 2009.
初めての関西開催。ホスト大学の大阪府立大学以外の参加者も5名ほど居たりで関心は高かったのかもしれないが…。毎回反省することが多い。今後の活動に活かしてい …
第35回 情報処理 技術検討交換会
Written by bonohu in misc on 木 05 11月 2009.
というアツマリにて統合DB普及活動の一環のお話をしに大阪千里中央へ。
会場に着いた時の雰囲気ではちょっと違うかな、と思ったが、結果としてなかなかウケた …
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 水 04 11月 2009.
中6.5週間。明日からの講演クラスターに備えて。
EDW3日目
Written by bonohu in misc on 土 31 10月 2009.
昨日のexerciseの続き。それを終えたら、ほぼ終了の時間。
EDW2日目
Written by bonohu in misc on 土 31 10月 2009.
講習が楽しみで早起きしてしまったのではなくて、単純に調子悪かったら早めに寝た結果。
というわけで万全を期し …
GI4日目
Written by bonohu in misc on 金 30 10月 2009.
最終日。ほぼ午前で終了だが、Talkが合計16とちょっと過密スケジュール。なのでいつもより15分早めのスタートと連絡があったが果たしてどうなるか？
結果としてなんとか終了。これまでにない、かなり激しい最終日だ …
EDW1日目
Written by bonohu in misc on 木 29 10月 2009.
Ensembl Developers' Workshop。講師5人に生徒11人だが、その生徒の中にもEnsembl staffのalumiが2,3人居たりという感じ。PCにVMwareを入れて講習するようだが、そのセットアップも講習開始の時点では出来ておらず…。明日の講習には間 …
GI3日目
Written by bonohu in misc on 木 29 10月 2009.
普段の時間帯とほぼ半日ずれているために朝起きてメールがどかっと溜まっている。こちらに来ているせいで直接 …
GI2日目
Written by bonohu in misc on 火 27 10月 2009.
午前はEpigenomics & Gene regulationのセッション。午後からポスター発表。他のを見るために自分の説明は控えめで。やはりこちらはポスター発表もおも …
LGAtoCSH
Written by bonohu in misc on 火 27 10月 2009.
LGAからは電車サービスがない。バス乗り換えで迷いたくなかったので、マンハッタン経由でLIRRに、と思ったのに空港からの高速バスの降りるところ …
YYZtoLGA
Written by bonohu in misc on 火 27 10月 2009.
map機能は今回も使えず。ダメだな、ここは。今度から別のにしよう。
GI1日目
Written by bonohu in misc on 月 26 10月 2009.
abstract bookの厚さから参加者のみならずポスター発表者の数が多いことがうかがいしれるレベル。そのなかでなんと幸運なことにこれまで泊まったことなかった食堂の真上の区画に泊まることに。ここはそれ …
OICR
Written by bonohu in misc on 月 26 10月 2009.
Ontario Institute for Cancer Research。今日お世話になったBiomartのArek Kasprzykだけでなく、BINDをやっていたB. F. Francis Ouellette、HapMapとかReactomeとかWormbaseとかCGI.pmとかいろんなことでこの世界で超有名なLincoln Steinが「常勤で」居る研究所と知り、驚く。ここはこれからはもっとtranlational medicineを目指すBioinformaticsな研究者が集まり、さ …
長い一日
Written by bonohu in misc on 土 24 10月 2009.
再び。ACなので機内エンターテイメントが日本人に最適化されておらずむしろ助かる（だが、まだ見ていなかった「おくりびと」はしっかり見たが）。しかもAC110VやUSB電源があって大助かり。それもあってこれを書いていたりする（アッ …
…
Written by bonohu in misc on 金 23 10月 2009.
私にどうしろというのか。それを減らしたところでそっちに行くかというとそうでもないのではないだろうか？ま、私 …
書類上は休み
Written by bonohu in misc on 月 19 10月 2009.
でも何かと忙しいこの季節、出動。来週またいないし。次のAJACSの諸々、科研費何を出すかの判断、等々。
「ゲノム解析学」講義
Written by bonohu in misc on 木 15 10月 2009.
代打で、統合データベースプロジェクトについて90分話す。そのとき用いたスライドはこちら。ローカル統合TVの用意をわざわざしていったのに本番で装備しわすれて使えなかったのが大変心名残り。インターネッ …
統合データベース講習会AJACS近江2
Written by bonohu in misc on 木 15 10月 2009.
基本的にはいつもどおりだが、久しぶりにセンター長も参加しての講習会。
統合TVの統合TV 2009年版
Written by bonohu in misc on 木 15 10月 2009.
217ということで、前の時点の倍以上に。そのシステムの適当さを指摘されることもあるものの、コンテンツがないことにはすべてが …
AJACSネゴシエーション
Written by bonohu in misc on 木 15 10月 2009.
九州と北陸方面。前者は2010/1/18-19に決定。後者は来年2月か3月という方向で検討開始。
NIGネゴシエーション
Written by bonohu in misc on 木 15 10月 2009.
昨日急に決まった会議参加。よくわからないままつないでみたが、アレで本当によかったの？
口撃再開
Written by bonohu in misc on 火 13 10月 2009.
満を持して、DNA配列との格闘再開。喉が渇くのは気のせいではなかろう。オリジナルなSayaMatcherを久しぶりに動かし、某解析パイプラインを後進に伝授する。
秋の日は釣瓶落とし
Written by bonohu in misc on 月 12 10月 2009.
週末のプレゼン資料に結局時間がかかってしまう。一年前のそれが使えないぐらいアップデートが多かったという …
どうしてDBCLSで「教育」をするのか？
Written by bonohu in misc on 日 11 10月 2009.
よくDBCLSはDB統合のための拠点なのだからDBの構築維持管理だけしていればいいのにといぶかしがられるが、上に対する答えはきわめて簡単。使いたい人もこれから使うべき人も、生命科学分野のDBに関して多くの場合、教育されていないか …
帰路
Written by bonohu in misc on 土 10 10月 2009.
不思議な縁で学会で一緒だった人とずっと同じ。SFO行きが一時間ほど遅れたが、元々乗り換えに余裕があったためセーフ。SFOからNRTへは約11時間のフライトだったが、飯食って新劇場版エヴァンゲリオン序を見ていたら寝て …
'The Next-Gen: not only for sequencer but also for human resource'
Written by bonohu in misc on 金 09 10月 2009.
MGED12 で思ったこと。一介のメリーランド大学の大学院生が次世代シーケンサーからの配列データの定量用のプログラ …
MGED12 最終日
Written by bonohu in misc on 木 08 10月 2009.
我らがR研のKさんが口頭発表。引き続きFANTOMアクティビティとして頑張ってくれているのを見るのは大変喜ばしく。今後どういう展開を考えているのだろう？そこで自分に対して思ったのは、以前の自分を引きず …
MGED12 3日目
Written by bonohu in misc on 火 06 10月 2009.
自分のポスター発表。なんとか凌ぐ。新しく始めたDBCLSの発現統合プロジェクト(togoexp)と、DRA(DDBJ Read Archive)との協力体制について早い時期に発表できたこと …
MGED12 2日目
Written by bonohu in misc on 月 05 10月 2009.
写真は会場となっているホテル。詳細はtwitterのハッシュタグ#MGED12を参照。
今日からがこの学会の本チャン（昨日は前座のチュートリアル＆ワークシ …
MGED12 1日目
Written by bonohu in misc on 月 05 10月 2009.
チュートリアルな1日。午前にDeep sequencing analysisのtutorial、午後に3つのWorkshop(Submitting UTHS data to GEO/ArrayExpress, MAGE-TAB annotation, BioConductor)。いろいろ新しい有益な情報で知恵熱が出そう。
Phoenix, AZへ
Written by bonohu in misc on 日 04 10月 2009.
ちょうど10年ぶり。「I'm drunken!」の迷言を産み出したマイクロアレイの会議で行って以来。自分は果たしてあの頃思い描いていた「10年後 …
Sheraton Phoenix Downton Hotel
Written by bonohu in misc on 土 03 10月 2009.
このホテル、高い割には便利じゃない。すなわち、部屋でネットが無料じゃない、お湯を沸かせるポットがない、テッシュ …
壁に耳あり障子に目あり
Written by bonohu in misc on 土 03 10月 2009.
みんな実は良く見ているということが判明。仕事中寝るような行為はこうやって広まっていくのだろうな…。そしてよ …
小さな世界
Written by bonohu in misc on 土 03 10月 2009.
昨日のそれに追い討ちをかけるように、普段お世話になっている方がそこに関係していることがさらに判明。この世 …
自転車ソウギョウ
Written by bonohu in misc on 土 03 10月 2009.
学会会場にてなんとかsubmit。一日遅れで。
It’s a small world after all!
Written by bonohu in misc on 金 02 10月 2009.
やっぱり世界は狭い、ということが今回の学会参加でも明らかに。まさか、前の前の職場での知り合いが現職場の同僚 …