ぼうのブログ

Category: misc

北の国へ

Written by bonohu in misc on 火 27 7月 2010.

共同研究打ち合わせというよりも逆家庭訪問のような…。夕刻、明日午前の講演に備えて札幌に。午後五時前に職場発、午後六時半羽田発の便で、札幌駅には午後九時前。

TS&TSWP3.1

Written by bonohu in misc on 月 26 7月 2010.

についに。これで可視化はこちらに。あとは実際の解析実例！

ウチバリカン

Written by bonohu in misc on 日 25 7月 2010.

中八週間？結構空いてしまったらしい。今週は札幌で講演、来週は仙台で講習会ということで。オーダーしていたスーツも今日届くなど、ちょうどいいタイミング。

目を見張る

Written by bonohu in misc on 土 24 7月 2010.

RAさんたちのそれぞれの得意分野を活かした成長ぶりに。素晴らしいロゴがまた追加され、ますます完成度が高くなった統合TV。統合牧場技術開発部のデータ解析開発。この高いモチベーションを維持していって欲しい。

あまりやりたくなかったが。DBCLSの統合牧場にていろいろといいかんじにやっているのにそれがただ議論されては消えるという「鉛筆（シャープペンシル）で書いては消しゴムで消し」ていく状態だったので。試験問題の答えのように結論だけ残せばいいってもんじゃないんよ。もちろん、twitterにその断片があるのだろうけど、それをまとめるのも立派な「研究」のプロセスだから。しっかり「ペンで書きとどめ」ていくように。きっとあとでそれを見返すことがあるから…。

発現統合reloaded

Written by bonohu in misc on 木 22 7月 2010.

今後に向けて、再構築が本格的に。やはり一人ほそぼそとやっているよりも複数人で議論したほうがよくなるわけで。

講演（講師でない）

Written by bonohu in misc on 水 21 7月 2010.

見ているだけは楽しいが…。場数を踏むべきでしょう。

3週間ぶりの全体会

Written by bonohu in misc on 火 20 7月 2010.

もとくに大きな進展もなく。焦らずじっくり、でもしっかり進めよう。

distinctに泣く

Written by bonohu in misc on 金 16 7月 2010.

とりあえず、distinctを足してみるとある程度は解決された。あとは、人間がみるとダブっていると思うエントリの除去が必要。

EMBOSS-6.3.0

Written by bonohu in misc on 木 15 7月 2010.

EMBOSS-6.3.0が出たらしいので、とりあえずコンパイル。Support for BAM/SAM filesもあるので期待できそう。いろいろ読み解きたいのだが、一人じゃあまりにも非力なのでみんなでやりましょう！

某書き物

Written by bonohu in misc on 水 14 7月 2010.

Google docsで書き込んでいたのだが、よく考えたらそれをeditorとshareするというのもオモシロイ試みだと思ってやってみた。まだまだ不完全だが、ここまで書いているんだということが先方にも伝わるので良いシステムではないかと思ったり。

Biocuration2010

Written by bonohu in misc on 火 13 7月 2010.

で、発現統合プロジェクトのキュレーション活動を報告しようと意気込み、話しあってアブストラクトを書き上げたものの、一ヶ月近い締め切り延長で最後の最後にヤル気を失った一日。

BMB2010抄録登録

Written by bonohu in misc on 月 12 7月 2010.

日曜日の晩にYoruFukurouを落として書き上げた二つを一晩寝かせた上でもう一度直して午前のうちに処理。

さらに統合牧場技術開発部と発現統合プロジェクトを一体的に位置づける方向で頭の中の整理。大分やるべきことが具現化してきた。

いつも笑顔でかくしていたけど

Written by bonohu in misc on 日 11 7月 2010.

夏が過ぎるたびこの胸が痛い

夜はとてもとても長く感じるのです

Puff the magic dragon lived by the sea

Written by bonohu in misc on 土 10 7月 2010.

And frolicked in the autumn mist

In a land called Honahlee.

某ユーザー会ワークショップ＠東京

Written by bonohu in misc on 金 09 7月 2010.

衝撃を受けつつ出陣。ランチは地鶏やにて。

ワークショップ自体は大阪と同じ内容ということだが、基本的には聴きやすくなっていたり。聴衆の数も倍以上で、ユーザーレベルも異なっていてそれなりに飽きることもなく。

BMB2010ワークショップ打ち合わせ

Written by bonohu in misc on 木 08 7月 2010.

とともに、DDBJにて統合TV取材。結果、トリを務めさせていただくことに。とっととアブストラクト送ること。

発現統合開発打ち合わせ

Written by bonohu in misc on 水 07 7月 2010.

入れるべきデータを外部データベースから取ってくるところのシステム化。その下流は実際にやっている人が判断していれていくしかないんだけど。

831lab

Written by bonohu in misc on 火 06 7月 2010.

今日開店ということで寄ってみた。店の中でレタスを育てる、輸送コストは0の新しいハタケ。是非ガンバッテ欲しいので、景気づけ（マーキング）にBLTを。今後お世話になりそう。

重なるときは重なる

Written by bonohu in misc on 月 05 7月 2010.

Pocket WiFi 機種変更。ネットワーク回線速度測定の数値的にはそれほど変わらないが、USBが一つしかないMBA的にはそこを占有しなくなっただけ、利便性が上がることが見込まれる。

帰りにHDMIケーブルを上野のヨドバシで買って帰り、接続。デスクトップが広くなった！

ADSL開通

Written by bonohu in misc on 日 04 7月 2010.

ブロードバンドルーター兼のADSLモデムに、MacMiniをつないでそこを無線LANのアクセスポイントに。あとはHDMIでモニタに接続すれば完璧だ。

Shiga.R#NA

Written by bonohu in misc on 金 02 7月 2010.

にて発表。DBCLSの紹介を中心にテキストマイニングネタを（発表資料）。Osaka.Rな人をはじめ、関西の有志たちと交流できたのが大変有意義だった。

某ユーザー会ワークショップ＠大阪

Written by bonohu in misc on 金 02 7月 2010.

にて主にLSDB関係のテキストマイニングな話を中心に広報普及活動。これまでやったことのないお題での話だったこともあり、終わったらいつも以上にヘトヘトに。聴衆は20人ちょいであったが、話の後に協力的な申し出や示唆的な意見を頂く。黙って公開されるのを待つんじゃなくて、一人でも多くの人が「はよ公開せんかい！」と声を上げることです。そういった声に励まされてやっているのだな、とまたまた再確認。

4年目突入

Written by bonohu in misc on 木 01 7月 2010.

であると同時に月初めでもある。やるべきことのリストをEvernoteにupdate。相手の事情で変えられてしまうのは仕方が無い気もするが腹立たしくもある。もっと（自分の考える）発現統合に時間を割いて精進すべし、それぞれのyouknowな人達が動いているのをうまくまとめて前に進むようにしむけつつ…。そして夕刻、大阪に空路旅立つ。

丸3年

Written by bonohu in misc on 水 30 6月 2010.

今の所属に来てから。これまで良かれと思ってやってきたことは果たしてライフサイエンス分野のデータベース統合化、ひいては科学の発展に少しでも寄与できたのだろうか？

RDFの2つの謎

Written by bonohu in misc on 火 29 6月 2010.

ちょっと前から某ポータルサイトに我々の提供サービスのRSSフィードが表示されなくなっていて、それについて原因を探っていただいた。そしたら、一つめは中身に&があったせいで処理が途中でおちていたせいだったらしい。もう一つは、コメントSPAMが来たときにそれを自動的に消すせいで、提供したいRSSの内容も一緒に消えてしまうという。更新されたときにtwitterにも流しているので、それのRSS使うようにしたほうがヨサゲかも。