ばらばらに構築・管理→検索・解析・応用が困難
Written by bonohu in misc on 水 16 12月 2009.
なのを打開するために、遺伝子発現データの方も大量のデータアーカイブの中から発掘作業。明日仕分け作業を行う …
Category: misc
墓穴を掘る
Written by bonohu in misc on 水 16 12月 2009.
そうしてるのかとオモタが？
続・事後処理
Written by bonohu in misc on 火 15 12月 2009.
出張書類の類いは昨日に終えたので、それ以外をぼちぼちと。先週のポスター発表のA4の紙を、内容が古くなってしまったB0のポスターの裏にぺたぺたと再構成して廊下に掲示 …
活動再開
Written by bonohu in misc on 日 13 12月 2009.
先週湧いてきた案件から。
マシンのセットアップからかと思いきや、CentOS5を入れてもらっていたことを思い出し、yum updateで凌ぐ。大分、手間を稼げた。
懸案のデータに …
分生を振り返って
Written by bonohu in misc on 日 13 12月 2009.
思ったことを徒然と。
ディスカッサをやってみて。ポスター発表をしている若い研究者たちを見ていると論文（という …
分生4日目
Written by bonohu in misc on 土 12 12月 2009.
ディスカッサというアレをアレする。議論を吹っかけてまわるのはそれほどでもないと思うけど、時間的拘束がちょ …
分生3日目
Written by bonohu in misc on 金 11 12月 2009.
「バイオテクノロジーセミナー」にて、某社のしたたかな営業戦略とその技術力に舌を巻く。
昼からは某連携にかかわる …
分生２日目
Written by bonohu in misc on 木 10 12月 2009.
「バイオテクノロジーセミナー」が取れたので拝聴する。研究者自身が罹患者の病気の解析のために自分自身のゲノム …
分生１日目
Written by bonohu in misc on 水 09 12月 2009.
基本的にブース対応補助のつもりだったが、それではいけなかったんだと夕方までは気がつかず…横浜駅西口近くで …
人生山あり谷あり
Written by bonohu in misc on 火 08 12月 2009.
すべては思った通りにはいかない。それが人生なのやも知れん。
医学と芸術展 関連トークセッション１生命とは何か－新しい医療と生命の未来
Written by bonohu in misc on 月 07 12月 2009.
招待券申し込んだら当たったようなので訊きにいく。
一般向けの講演はかくあるべし、というの …
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 月 07 12月 2009.
中五週間。
第七回がんとハイポキシア研究会
Written by bonohu in misc on 日 06 12月 2009.
第7回 がんとハイポキシア研究会 - がんとハイポキシア研究会
今日は雨が降っていなかったので、四条通→木屋町通と行 …
「がんと低酸素」
Written by bonohu in misc on 金 04 12月 2009.
四条烏丸のベースキャンプから雨のふる中、四条通→寺町通→御池通→川端通→二条通→東大路→東一条通を経由して、四十分ほ …
統合データベース講演会＠静岡県立大学
Written by bonohu in misc on 金 04 12月 2009.
人の数こそ14,5人だったが、すでにLSDBのサービスを使っていらっしゃる方が複数居て、途中でも質問も出てくるなど活発な会となった。各サービスの全容を私なりに1.自然言語 …
さんざんな一日
Written by bonohu in misc on 木 03 12月 2009.
プリンターのキューを消されたり、質問に誠実に答えようとして質問しているのに因縁をつけられたり。そこで言い …
カフスボタン比べ
Written by bonohu in misc on 木 03 12月 2009.
明後日用にそっち系のデータを抽出してTSで可視化していっちょ上げる。
来週のそれは、個々の比較よりも全体での比較をやろうという欲が出て、また計算待ちということに…
カフスボタン
Written by bonohu in misc on 水 02 12月 2009.
までなんとか。ここまで動かしてデータ解釈ができることを示すスライドを来週までに一枚でもいいから作成した …
Wordpress始めました
Written by bonohu in misc on 水 02 12月 2009.
昨日お披露目したサイトをインディーズデビューさせることに。その際にいろいろと説明などを加えるCMSとして。別の某計 …
9002番から80番
Written by bonohu in misc on 水 02 12月 2009.
に変更。そのディレクトリ以下ですべてが収まるように時間があるときにちゃんとしないといけないが、とりあえず …
セミナー当番
Written by bonohu in misc on 火 01 12月 2009.
じっくり話したかったが海外学会報告もやったので、さらっと。初めて聞いた人には分かりづらかったことでしょう …
シンポジウムはしご
Written by bonohu in misc on 月 30 11月 2009.
午後に。今週来週とプレゼン目白押しなのに…。
前半には大変懐かしい方に二人もお会いできたし、他では聞けない話が …
嬉しい一言
Written by bonohu in misc on 金 27 11月 2009.
勤め先でやっていた某ワークショップが終わった頃に様子を見に行ったら、帰りがけの参加者の一人に、統合データ …
我田引水
Written by bonohu in misc on 金 27 11月 2009.
どうあがいても中に居る以上そうにしかみえない。これまでとくにそうしてこなかったのにその類いのことだけを …
某承認
Written by bonohu in misc on 木 26 11月 2009.
実は、断片的にしかホスト役の彼のことを知らなかったことを知る。それと同時に彼のことをとても心配しているボ …
定例会議
Written by bonohu in misc on 木 26 11月 2009.
それぞれのサービスごとに目指すべき「レベル」というものがあるのだ。議論すべきはそこじゃない。
人を動かすにはそ …
某サポート
Written by bonohu in misc on 木 26 11月 2009.
三島より入電。ついには電話に。今後は直接Google Chatで来そうな予感。お礼は、今度一緒にお食事とか、いかが？
感情的にしかみえない
Written by bonohu in misc on 水 25 11月 2009.
まわりは基本的に研究費を減らされるということで。もう少し視野を広げて、考えてみることもしてみたら？
データベース「統合家」
Written by bonohu in misc on 水 25 11月 2009.
新しい職業として提唱したい。
'@DDBJ'
Written by bonohu in misc on 火 24 11月 2009.
登場人物が被り過ぎ。
キャリアパスセミナー＠東北大
Written by bonohu in misc on 火 24 11月 2009.
なるものをやることに。「生命科学分野のデータベースを統合する仕事：落ちこぼれ大学生が.DB(Doctor of the database)にいたるまで …
可視化してみると
Written by bonohu in misc on 火 17 11月 2009.
やはりデータのあらが気になる。TSをカスタマイズしてBLAT計算結果へ直リンク張ってみるとuniqueにmapされたところだけ抽出しているはずなのにそうはならず…。どうもrm関係らしい。そういえば、かつてこれを計算したときrmかけないと計算が終わらず断念した記憶がよみがえってきた。
そこで、rmしていないのをダウンロードして、それらを先週RAさんに構築してもらった計算パイプラインを利用して再計算してみる。とり …
可視化するために
Written by bonohu in misc on 月 16 11月 2009.
トロントで貰ってきた宿題を、とりあえずのバナーもどきを作って完了、提出。模様眺めモードに移行。
それと、某再計算 …
事業仕分け
Written by bonohu in misc on 金 13 11月 2009.
ネット上で模様を眺めながら自分の方も。g86たちにやってもらう分、自分自身でやる分。共に大きな進捗があった一日だった。
事業仕分けWS3まとめWiki
Written by bonohu in misc on 金 13 11月 2009.
家に帰ってtwitter眺めていたらWikiが必要という流れだったので、作ってみたら…。「導火線を引く」とこれほどまでに反応があるというのは、やはり普段から思うことがある …
セミナー三連ちゃん
Written by bonohu in misc on 木 12 11月 2009.
日常業務に復帰…と思いきや。セミナーはもっと聴衆を考えて用意してこようよ…。もちろん、いろいろな要因はあるのだ …
Spotfireユーザー会2日目
Written by bonohu in misc on 水 11 11月 2009.
昨日に引き続き。午後一で講演。MBAからの外部モニタ出力が機能せず、PDFをWindowsマシンで一枚ずつみせて話をすることに。ま、しょうがない。
無事（？）、これからユーザー会会長をやることになってしまった。本当 …
Spotfireユーザー会1日目
Written by bonohu in misc on 火 10 11月 2009.
六本木アカデミーヒルズにて。
統合データベース講演会＠東京農大
Written by bonohu in misc on 日 08 11月 2009.
これまで見た中で一番広い100人は入れるコンピュータ実習室にて。参加者は主に大学院生約30人。会場が広いこともあって、サイドモニターにプレゼンの画 …
Go for it
Written by bonohu in misc on 日 08 11月 2009.
とにかく、前につきすすんでいくしかない。生きている限り。できるところまで、できるかぎり、死力を尽くして。
チップチーム同窓会
Written by bonohu in misc on 金 06 11月 2009.
前の前の職場の。そこを離れて、早６年半。月日が経つのは早いものだ。
AJACSりんくう
Written by bonohu in misc on 金 06 11月 2009.
初めての関西開催。ホスト大学の大阪府立大学以外の参加者も5名ほど居たりで関心は高かったのかもしれないが…。毎回反省することが多い。今後の活動に活かしてい …
第35回 情報処理 技術検討交換会
Written by bonohu in misc on 木 05 11月 2009.
というアツマリにて統合DB普及活動の一環のお話をしに大阪千里中央へ。
会場に着いた時の雰囲気ではちょっと違うかな、と思ったが、結果としてなかなかウケた …
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 水 04 11月 2009.
中6.5週間。明日からの講演クラスターに備えて。
EDW3日目
Written by bonohu in misc on 土 31 10月 2009.
昨日のexerciseの続き。それを終えたら、ほぼ終了の時間。
EDW2日目
Written by bonohu in misc on 土 31 10月 2009.
講習が楽しみで早起きしてしまったのではなくて、単純に調子悪かったら早めに寝た結果。
というわけで万全を期し …
GI4日目
Written by bonohu in misc on 金 30 10月 2009.
最終日。ほぼ午前で終了だが、Talkが合計16とちょっと過密スケジュール。なのでいつもより15分早めのスタートと連絡があったが果たしてどうなるか？
結果としてなんとか終了。これまでにない、かなり激しい最終日だ …
EDW1日目
Written by bonohu in misc on 木 29 10月 2009.
Ensembl Developers' Workshop。講師5人に生徒11人だが、その生徒の中にもEnsembl staffのalumiが2,3人居たりという感じ。PCにVMwareを入れて講習するようだが、そのセットアップも講習開始の時点では出来ておらず…。明日の講習には間 …
GI3日目
Written by bonohu in misc on 木 29 10月 2009.
普段の時間帯とほぼ半日ずれているために朝起きてメールがどかっと溜まっている。こちらに来ているせいで直接 …
GI2日目
Written by bonohu in misc on 火 27 10月 2009.
午前はEpigenomics & Gene regulationのセッション。午後からポスター発表。他のを見るために自分の説明は控えめで。やはりこちらはポスター発表もおも …