某サポート

Written by bonohu in misc on 木 26 11月 2009.

三島より入電。ついには電話に。今後は直接Google Chatで来そうな予感。お礼は、今度一緒にお食事とか、いかが?

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可視化してみると

Written by bonohu in misc on 火 17 11月 2009.

やはりデータのあらが気になる。TSをカスタマイズしてBLAT計算結果へ直リンク張ってみるとuniqueにmapされたところだけ抽出しているはずなのにそうはならず…。どうもrm関係らしい。そういえば、かつてこれを計算したときrmかけないと計算が終わらず断念した記憶がよみがえってきた。

そこで、rmしていないのをダウンロードして、それらを先週RAさんに構築してもらった計算パイプラインを利用して再計算してみる。とり …

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可視化するために

Written by bonohu in misc on 月 16 11月 2009.

トロントで貰ってきた宿題を、とりあえずのバナーもどきを作って完了、提出。模様眺めモードに移行。

それと、某再計算 …

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事業仕分け

Written by bonohu in misc on 金 13 11月 2009.

ネット上で模様を眺めながら自分の方も。g86たちにやってもらう分、自分自身でやる分。共に大きな進捗があった一日だった。

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Spotfireユーザー会2日目

Written by bonohu in misc on 水 11 11月 2009.

昨日に引き続き。午後一で講演。MBAからの外部モニタ出力が機能せず、PDFをWindowsマシンで一枚ずつみせて話をすることに。ま、しょうがない。

無事(?)、これからユーザー会会長をやることになってしまった。本当 …

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Go for it

Written by bonohu in misc on 日 08 11月 2009.

とにかく、前につきすすんでいくしかない。生きている限り。できるところまで、できるかぎり、死力を尽くして。

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AJACSりんくう

Written by bonohu in misc on 金 06 11月 2009.

初めての関西開催。ホスト大学の大阪府立大学以外の参加者も5名ほど居たりで関心は高かったのかもしれないが…。毎回反省することが多い。今後の活動に活かしてい …

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EDW2日目

Written by bonohu in misc on 土 31 10月 2009.

講習が楽しみで早起きしてしまったのではなくて、単純に調子悪かったら早めに寝た結果。

というわけで万全を期し …

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GI4日目

Written by bonohu in misc on 金 30 10月 2009.

最終日。ほぼ午前で終了だが、Talkが合計16とちょっと過密スケジュール。なのでいつもより15分早めのスタートと連絡があったが果たしてどうなるか?

結果としてなんとか終了。これまでにない、かなり激しい最終日だ …

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EDW1日目

Written by bonohu in misc on 木 29 10月 2009.

Ensembl Developers' Workshop。講師5人に生徒11人だが、その生徒の中にもEnsembl staffのalumiが2,3人居たりという感じ。PCにVMwareを入れて講習するようだが、そのセットアップも講習開始の時点では出来ておらず…。明日の講習には間 …

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GI3日目

Written by bonohu in misc on 木 29 10月 2009.

普段の時間帯とほぼ半日ずれているために朝起きてメールがどかっと溜まっている。こちらに来ているせいで直接 …

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GI2日目

Written by bonohu in misc on 火 27 10月 2009.

午前はEpigenomics & Gene regulationのセッション。午後からポスター発表。他のを見るために自分の説明は控えめで。やはりこちらはポスター発表もおも …

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LGAtoCSH

Written by bonohu in misc on 火 27 10月 2009.

LGAからは電車サービスがない。バス乗り換えで迷いたくなかったので、マンハッタン経由でLIRRに、と思ったのに空港からの高速バスの降りるところ …

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GI1日目

Written by bonohu in misc on 月 26 10月 2009.

abstract bookの厚さから参加者のみならずポスター発表者の数が多いことがうかがいしれるレベル。そのなかでなんと幸運なことにこれまで泊まったことなかった食堂の真上の区画に泊まることに。ここはそれ …

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OICR

Written by bonohu in misc on 月 26 10月 2009.

Ontario Institute for Cancer Research。今日お世話になったBiomartのArek Kasprzykだけでなく、BINDをやっていたB. F. Francis Ouellette、HapMapとかReactomeとかWormbaseとかCGI.pmとかいろんなことでこの世界で超有名なLincoln Steinが「常勤で」居る研究所と知り、驚く。ここはこれからはもっとtranlational medicineを目指すBioinformaticsな研究者が集まり、さ …

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長い一日

Written by bonohu in misc on 土 24 10月 2009.

再び。ACなので機内エンターテイメントが日本人に最適化されておらずむしろ助かる(だが、まだ見ていなかった「おくりびと」はしっかり見たが)。しかもAC110VやUSB電源があって大助かり。それもあってこれを書いていたりする(アッ …

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Written by bonohu in misc on 金 23 10月 2009.

私にどうしろというのか。それを減らしたところでそっちに行くかというとそうでもないのではないだろうか?ま、私 …

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口撃再開

Written by bonohu in misc on 火 13 10月 2009.

満を持して、DNA配列との格闘再開。喉が渇くのは気のせいではなかろう。オリジナルなSayaMatcherを久しぶりに動かし、某解析パイプラインを後進に伝授する。

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どうしてDBCLSで「教育」をするのか?

Written by bonohu in misc on 日 11 10月 2009.

よくDBCLSはDB統合のための拠点なのだからDBの構築維持管理だけしていればいいのにといぶかしがられるが、上に対する答えはきわめて簡単。使いたい人もこれから使うべき人も、生命科学分野のDBに関して多くの場合、教育されていないか …

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帰路

Written by bonohu in misc on 土 10 10月 2009.

不思議な縁で学会で一緒だった人とずっと同じ。SFO行きが一時間ほど遅れたが、元々乗り換えに余裕があったためセーフ。SFOからNRTへは約11時間のフライトだったが、飯食って新劇場版エヴァンゲリオン序を見ていたら寝て …

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MGED12 最終日

Written by bonohu in misc on 木 08 10月 2009.

我らがR研のKさんが口頭発表。引き続きFANTOMアクティビティとして頑張ってくれているのを見るのは大変喜ばしく。今後どういう展開を考えているのだろう?そこで自分に対して思ったのは、以前の自分を引きず …

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MGED12 3日目

Written by bonohu in misc on 火 06 10月 2009.

自分のポスター発表。なんとか凌ぐ。新しく始めたDBCLSの発現統合プロジェクト(togoexp)と、DRA(DDBJ Read Archive)との協力体制について早い時期に発表できたこと …

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MGED12 1日目

Written by bonohu in misc on 月 05 10月 2009.

チュートリアルな1日。午前にDeep sequencing analysisのtutorial、午後に3つのWorkshop(Submitting UTHS data to GEO/ArrayExpress, MAGE-TAB annotation, BioConductor)。いろいろ新しい有益な情報で知恵熱が出そう。

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Phoenix, AZへ

Written by bonohu in misc on 日 04 10月 2009.

ちょうど10年ぶり。「I'm drunken!」の迷言を産み出したマイクロアレイの会議で行って以来。自分は果たしてあの頃思い描いていた「10年後 …

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小さな世界

Written by bonohu in misc on 土 03 10月 2009.

昨日のそれに追い討ちをかけるように、普段お世話になっている方がそこに関係していることがさらに判明。この世 …

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