April2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 30 4月 2023.
2023年4月を振り返って
年度が変わり、bonohulabでの4年目がスタート。 学生の数が5人から8人となった。 今年は大学院入学の問い合わせは博士課程後期、しかも社会人特別入試にかかわる …
Food Security Symposium 2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 22 4月 2023.
食料安全保障シンポジウム
G7広島サミットと広島大学75+75周年記念事業の食料安全保障シンポジウムが学内であるということで参加。
食料安全保障シンポジ …
March2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 31 3月 2023.
2023年3月を振り返って
2023年3月は BioDXのアウトリーチイベントや学会発表、そして初の研究会内でのbonohulabの研究紹介的なポスター発表など、対外的なイベントが多く。 懸案だった共同研究打ち合わせにも月 …
Shutoiten 3years
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 25 3月 2023.
酒都移転3年
今日2023年3月25日で酒都西条に移転して丸3年になった。
2年目に比べると出張にもだいぶ行けるようになり、コロナ禍以前の状態に戻ってきているのではな …
Research Presentation 230324
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 24 3月 2023.
研究発表会230324
研究科内でオンサイトでの研究発表会（ポスター発表）があるということで、発表した。 ちょうどコロナ禍 …
BioDX outreach event 2023 done
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 21 3月 2023.
ミライ牧場イベント2nd無事終了
2023年3月5日(日)に開催したバイオDXを紹介するアウトリーチイベント「ゲノム解読から生物のプログラミング〜教科書の外へいこう 未来の …
Hiroshima Bio Forum 22
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 17 3月 2023.
令和4年度広島バイオフォーラム
去年は自分が講演した広島バイオテクノロジー推進協議会主催の広島バイオフォーラム。 残念ながらコロナ …
odokon2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 15 3月 2023.
日本応用動物昆虫学会大会2023＠摂南大農学部
2023年3月13日〜15日まで、第67回日本応用動物昆虫学会大会が大阪府枚方市と京都府八幡市にまたがる摂南大学で開かれた。
今回も小集会の講師として参加。 コロナ禍でもオンラインで開 …
Feburary2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 28 2月 2023.
2023年2月を振り返って
今月は、2月ということもあって行事が多く。 なかなか研究活動に時間が取れなかったものの、今年度導入した大型実験機器によるデータが取れてき …
BioDX outreach event 2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 05 2月 2023.
バイオDXのアウトリーチイベント2023
昨年も実施したバイオDXのアウトリーチイベントを今年もやります！ 今回のタイトルは、「ゲノム解読から生物のプログラミング〜教科 …
January2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 31 1月 2023.
2023年1月を振り返って
今月は、3年ぶり＆現職初の海外学会参加でバタバタしていた。 3年ぶりのSan Diegoで大きな刺激を受け、また同時に大きな「種」も得てきた。 それをうまく育ててい …
PAG30
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 21 1月 2023.
Plant and Animal Genome Conference 30
3年ぶりのInternational Plant and Animal Genome Conference (PAG)参加。 すでに転職してから3年目も後半に差し掛かっているが、なんと転職後、初めての海外学会発表。 色々と必要な手続きがこれで良いのか、気を揉みつつ。
こ …
Plan 2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 01 1月 2023.
2023年の計
明けましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いします。
明けましておめでとうございます。今年も無事初 …
Review 2022
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 31 12月 2022.
2022年を振り返って
ラボ3年目の2022年は、「飛躍」の去年からさらに飛躍の年になった。
研究室関係のニュースはラボのニュースに取り上げて溜めてき …
December2022
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 28 12月 2022.
2022年12月を振り返って
この2022年12月は年末ということもあり、月末が29日から休み。 しかも、有給休暇を取得していないということで、28日もお休みということで、書類上は昨日27日までということであった。
この12月は久しぶりに参加の日本分子生物学会年会 …
Mid-term presentation of master's thesis 22
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 26 12月 2022.
修論中間発表会22
去年はオンライン開催だった修論中間発表会が今年はオンサイト、ポスター発表ということで。 去 …
Nights in hotels 2022
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 24 12月 2022.
2022年出張外泊数
毎年恒例にしている出張外泊数。 去年(2021年)は11泊であったが、
来年はもっと増えるんだろうなあ。
という予測通り、今年2022年は …
Number of PubMed entries 3 digits
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 23 12月 2022.
PubMedエントリ数3桁到達
普段から使っている自分の名前の入った論文を年代順にリストアップする検索式（日本語の論文を含めない自分 …
1st GEM paper published
Written by Hidemasa Bono in papers on 木 22 12月 2022.
1stGenome Editing Meta-DB paper
2022年9月に参加した国内版バイオハッカソンBH22.9 での Genome Editing Meta-database (GEM) の報告をその月の終わりにBioHackrXivにプレプリントとして公開 したが、 この度、その論文を査読 …
Reference genome sequences of Mythimna separata published
Written by Hidemasa Bono in papers on 土 17 12月 2022.
アワヨトウゲノム配列解読論文
1ヶ月前にbioRxivから公開していたアワヨトウゲノム配列解読論文が査読済みとなり、Insectsからpublished。 acceptedから1日でという爆速はいつも通り。
Reference Genome Sequences of the Oriental Armyworm, Mythimna separata (Lepidoptera: Noctuidae)
https://doi.org/10.3390/insects13121172
今年になって始 …
45th annual meeting of the molecular biological society of Japan
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 02 12月 2022.
第45回日本分子生物学会年会
恒例の分セーに参加。 COVID-19の影響もあり、最後に参加してから3年もの月日が経過。 そのため、現在の所属に異動してから初めてということもあり、会 …
November2022
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 30 11月 2022.
2022年11月を振り返って
この2022年11月は、上旬にバイオインフォマティクス講義を取り終えてからは、大型機器の設置のアレンジなど、やはりバタバ …
Meta-analysis of public RNA sequencing data of queens and workers in social Hymenoptera and termites
Written by Hidemasa Bono in papers on 水 23 11月 2022.
社会性ハチ目およびシロアリにおける女王と働き蜂のトランスクリプトームのメタ解析
プロジェクト研究員によ …
bocchi again
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 22 11月 2022.
ボッチ・アゲイン
昨年度（2021年度）はじめに、新しいメンバーを迎え、ボッチラボではなくなったのだが。 その後もラボメンバ …
Reference genome sequences of Mythimna separata
Written by Hidemasa Bono in papers on 土 19 11月 2022.
アワヨトウゲノム配列解読論文
NARO横井さん、上樂さん、筑波大学の古川先生、によるアワヨトウMythimna separataのゲノム配列決定論文がbioRxivから公開 …
Press release 22 6th
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 17 11月 2022.
2022年度6回目のプレスリリース
先月（2022年10月15日）に出版されたセイヨウミツバチリファレンストランスクリプトームデータ構築の論文をNAROと共同でプレスリリース。 出版から1ヶ月以上かかってしまったが、き …
Genome paper for Perilla frutescens in Japan
Written by Hidemasa Bono in papers on 水 16 11月 2022.
アカシソゲノム配列解読論文
約2ヶ月前にbioRxivから公開していたアカシソゲノム配列解読論文が査読済みとなり、DNA Researchからpublished。
A highly contiguous genome assembly of red perilla (Perilla frutescens) domesticated …
COVID-19 Vaccine 4th shot
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 12 11月 2022.
コロナウイルスワクチン注射4回目
今年（2022年）3月に3回目に引き続き、ほぼ8ヶ月後に再び職域接種で4回目。 オミクロン株対応で今回もモデルナ製。
接種希望者が …
Review Genome Editing and Bioinformatics published
Written by Hidemasa Bono in papers on 火 08 11月 2022.
ゲノム編集とバイオインフォマティクスの総説論文出版
共同研究講座助教の中前さんと共に執筆した総説が出版 …
Web-connected text bioinformatics
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 07 11月 2022.
Web連携テキストバイオインフォマティクス
東京大学大学院農学生命科学研究科ではアグリバイオインフォマティクス教育プログラムを10年以上前からやっている。 そのユニットに …
Bioinformatics Lecture 22 recording done
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 06 11月 2022.
バイオインフォマティクス講義22収録完了
目下の最重要事項である卓越大学院のバイオインフォマティクス講義。 本日(22/11 …
First poster presentation in 3 years
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 04 11月 2022.
3年ぶりのポスター発表
理研科技ハブ共同研究プログラム 2022年度合同ワークショップで2020年1月のPAG以来ほぼ3年ぶりのポスター発表。 転職もあって研究内容が大幅に変わって。 発表準備期間としては3年はだいぶ長かったものの、コロ …
October2022
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 31 10月 2022.
2022年10月を振り返って
この2022年10月は、前半は先月に引き続き出張に出ていることが多く。 こちらに来て3年目にして初めてのリアル酒まつり参加とか、12年ぶりのBioJapan参加など、多くの人とお会いする刺激的な出来 …
First private grant awarded
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 26 10月 2022.
民間助成金初獲得
これまでずっと縁がなかった民間助成金を初めて獲得。 もちろん、これまでも出してはきていたの …
Meta-analysis of the public RNA-Seq data of the Western honeybee Apis mellifera to construct reference transcriptome data published
Written by Hidemasa Bono in papers on 金 14 10月 2022.
セイヨウミツバチリファレンストランスクリプトームデータ構築論文出版
先月2022年9月にbioRxivにアップした論文が査読論文として公開された。 研 …
BioJapan2022
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 13 10月 2022.
BioJapan2022
おそらく2010年以来、12年ぶりにBioJapanに参加。 現職に移ってから初めて会う方ばかり、ということで名刺を渡すことがとても多く。 2日間でこちらの手元に残った名刺数としては約40枚。 多くの方に現 …
Exploratory Hypoxic Transcritome Meta-Analysis Published
Written by Hidemasa Bono in papers on 火 11 10月 2022.
新しいリファレンストランスクリプトームによる新しい探索的メタ解析
sakematsuri 22
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 08 10月 2022.
酒まつり2022
Press release 22 4th
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 07 10月 2022.
2022年度4回目のプレスリリース
先月末（2022年9月23日）に出版された密度依存的なポリフェニズムを示す昆虫のトランスクリプトームのメタ解析の論文をプ …
Hold your dreams it never ends
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 01 10月 2022.
bonohulab2年半
bonohulabを始めてから今日2022年10月1日で2年半。 つまり月の数にして、30ヶ月。 長くやっているんだなあとむしろ感慨に浸る感じ。
そして同時にぼ …
September2022
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 30 9月 2022.
2022年9月を振り返って
この2022年9月は、とにかく出張に出てた月だった、久しぶりに。
- 1-2 柏の葉（DBCLS兼業）
- 4-9 BH22.9
- 11-13 植物バイオテクノロジー学会
- 29-30 理研横浜 …
GEM report in BH22.9
Written by Hidemasa Bono in papers on 月 26 9月 2022.
Genome Editing Meta-DB report in BH22.9
2022年9月に参加した国内版バイオハッカソンBH22.9 での Genome Editing Meta-database (GEM) の報告が2022年9月26日、BioHackrXivにプレプリントとして公開された。
GEM: Genome …
Meta-analysis of transcriptomes in insects showing density-dependent polyphenism published
Written by Hidemasa Bono in papers on 金 23 9月 2022.
密度依存的なポリフェニズムを示す昆虫のトランスクリプトームのメタ解析論文出版
1st Doctoral Degree Recipient from bonohulab
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 20 9月 2022.
新しい教育方式による新しい博士学位取得者
D2の大学院生（社会人ドクター）が本日2022年9月20日、博士（理学）を取得した。 年限を1年短縮しての早期修了であるうえに、bonohulabはじまって以来、初の博士 …
A highly contiguous genome assembly of red perilla (Perilla frutescens) domesticated in Japan
Written by Hidemasa Bono in papers on 土 17 9月 2022.
アカシソゲノム配列解読論文
プロジェクト研究員によるアカシソゲノム配列解読論文がbioRxivから公開。 材料をいただいた三島 …
JSPB39th
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 13 9月 2022.
第39回 日本植物バイオテクノロジー学会(堺)大会
久しぶりのオンサイト学会年会的な集まりへの参加。 そして、この学会 …
Meta-analysis of the public RNA-Seq data of the Western honeybee Apis mellifera to construct reference transcriptome data
Written by Hidemasa Bono in papers on 月 12 9月 2022.
セイヨウミツバチの公共RNA-Seqデータのメタ解析によるリファレンストランスクリプトームデータの構築論文
研究員（当時）とNARO横井さんによる、セイヨウミツバチApis melliferaの公共RNA-Seqデータのメタ解析によってリファレンストランスクリプトームデータを構築し、それを利用した解析事例の論文がbioRxivから公開。
先 …
BH22.9
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 10 9月 2022.
国内版バイオハッカソン BH22.9
コロナ禍のバイオハッカソン3回目。 今年も国際版はなしで、国内版バイオハッカソン BH22.9 …
Two English Press release 22
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 09 9月 2022.
2本同時の英語プレスリリース
日本語のプレスリリースをすでに出してあった以下の2本の論文の英語のプレスリリースが同日に。
- 2022年7月19日に出版された低酸素環境下における植物トランスクリプトームの …
ROIS-DS-JOINT 22 for insects
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 02 9月 2022.
2022年度ROIS-DS-JOINT共同研究集会「昆虫における次世代シーケンスデータ解析および公共データベース利用」
前年度は遺伝研研究集会としてオンラ …