COI-NEXT BioDX meeting 2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 15 2月 2024.
COI-NEXTバイオDX拠点全体会議2023
あいにくの雨の中、昨年度のキックオフミーティングに引き続き、オンサイト（ハイブリッド）でBioDX拠点の全体会議をミライクリエにて。 修論発表の翌日、学 …
Master's thesis presentation 2024
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 14 2月 2024.
修論発表会2024
これまでのオンライン方式から代わって、オンサイトでの修論発表会。 4年目の私だけが初めてかとおもいきや、新しく発足した研究科的にも …
ROIS DS JOINT Research meeting 2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 09 2月 2024.
昆虫における次世代シーケンスデータ解析および公共データベース利用 II
今年度も昨年度に引き続き、オンサイト …
Setsubun 2024
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 04 2月 2024.
節分2024
今年2024年は節分2月3日だったらしい。 子供の頃は2月4日だったような記憶があるのだが、それは1984年だけらしい。 その記憶はひょっとしたら立春と間違っていたかもしれない。 「節分」をDeepLで英訳してみると …
RNA-Seq recipe 2 ranking 2401
Written by Hidemasa Bono in RecipeBook on 土 03 2月 2024.
RNAseqレシピ本2のランキング 24年1月
2023年10月に発売されたRNAseqレシピ本2。 出版元が毎月出しているランキングの生命科学・基礎医学で10月登場時に2位。 その後、11月7位、12月9位と下がってきてたが、年が変わって2024年1月には5位と …
January2024
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 31 1月 2024.
2024年1月を振り返って
今月は、華麗に加齢な月ということで、age++ 自然災害、航空機事故と1年の不幸が年頭からという年。 今後はいいことが多いと良いのだが。
そんな中、PAG31 …
Lecture at the Land of Sunshine
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 31 1月 2024.
晴れの国の大学にて講演
晴れの国のはずなのにぐずいた天気の中、彼の地にある大学での講演にオンサイトにて。 木 …
Writing private grant 24
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 27 1月 2024.
民間助成金書き
JST共創の場形成支援プログラムによって研究予算十分というわけでなく、新たな取り組みをすべきだし、実際それを推奨されている。 今年度、民間助成金をいただいたことで …
DrBonoBon2 2nd printing
Written by Hidemasa Bono in drbonobon on 金 26 1月 2024.
Bono本第2版の2刷
「Dr.Bonoの生命科学データ解析」(Bono本)の第2版が出版されてから今度の4月でもう3年。 著者の私からしてみると早いものだなあという感覚。 これも加齢のなせ …
Unrecognized SSD sent
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 25 1月 2024.
認識しない、SSD送付
年末に買ったものの、認識しないSSD。 マウントされないどころか、ディスクユティリティでも認識しない …
PAG31
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 21 1月 2024.
Plant and Animal Genome 31
昨年に続き、International Plant and Animal Genome (PAG)参加。 今回は行けるのかどうか怪しい状況であったが、途中（後半）からの参加とは …
HMMER v3.4
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 04 1月 2024.
HMMER v3.4
ふと気づいたら、新しいバージョンのHMMER v3.4がリリースされてた。
これまで、Apple silicon Macでnativeには動かず、Docker上で動かしていたのだが、
普通にconfigureしてmakeしたらエラーもなくすんなり …
Plan 2024
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 01 1月 2024.
2024年の計
明けましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いします。
あけましておめでとうございます。今年は初日の …
Review 2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 31 12月 2023.
2023年を振り返って
今年2023年はラボを主宰し始めてから早4年目。 去年からさらにいろいろと変化の年となった。
まずは自分自身の「特任」がとれたこと。 プロジェクト雇いの年 …
December2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 30 12月 2023.
2023年12月を振り返って
8月に有給休暇を早めに規定数以上取得してたので、この2023年12月は有給休暇の消化ということもなく、28日まできっちり出勤日だった。 12月恒例の日本分子生物学会年会にはじまり、Togothonへの参加（関東出張）だけでなく、初の学部1年生向けの講義など、まさに「師走」であった。 とくに道 …
Mid-term presentation of master's thesis 23
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 26 12月 2023.
修論中間発表会23
去年からはオンサイトになった修論中間発表会は、ことしもポスター発表形式で。 昨年もそうであ …
Nights in hotels 2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 25 12月 2023.
2023年出張外泊数
毎年恒例にしている出張外泊数。 年内の出張がすべて終わって数が確定した。 2021年は11泊、去年(2022年)は22泊と倍増してきていた。 そ …
Welcome and thank you party 23
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 19 12月 2023.
歓迎会とお礼の会
本日で2023年最後のラボミーティングということで、開催前のお昼休みに（いつもより早めに）集まっていただき、2023年一年お疲れ様という意味も込めて、ピザパーティー。 主には10月に入った新しいメンバーである学部3年生の歓迎会、そ …
Artwork by science illustrators in MBSJ2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 09 12月 2023.
サイエンスイラストレーターのお仕事展
色々と驚きの連続であったMBSJ2023だが、その一つがこの「サイエンスイラストレーターのお仕事展」。
ご好 …
46th annual meeting of the molecular biological society of Japan
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 08 12月 2023.
第46回日本分子生物学会年会
千葉の幕張であった去年に引き続き、今年も恒例の分セーに参加。 今年は、久しぶりの神戸ポートアイランド。 分セ …
DrBonoDojo2 published
Written by Hidemasa Bono in drbonodojo on 金 01 12月 2023.
道場本2無事出版!
当初の発売予定から少々遅くなったものの、目標の日本分子生物学会年会（分セー）の開催前に「生命科学者のためのDr. Bonoデータ解析道場 第2版」が …
November2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 30 11月 2023.
2023年11月を振り返って
初旬にはバイオインフォマティクス講義の収録も終え、研究室内のことに取り組んだ11月だった。 新しい部屋の整備も進み …
COVID-19 Vaccine 5th shot
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 22 11月 2023.
コロナウイルスワクチン注射5回目
去年（2022年）11月に4回目からちょうど1年後の2023年11月に5回目を。 5回目にして初のファイザー製で、市中の医院で接種してもらってきた。
副反応を予想し …
DrBonoDojo2 preface published
Written by Hidemasa Bono in drbonodojo on 火 21 11月 2023.
道場本2の序文公開
今月末には発売となるはずだった「生命科学者のためのDr. Bonoデータ解析道場 第2版」の序文が出版社の道場本2のウェブサイトから公開され …
Bee Summit 2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 19 11月 2023.
ミツバチサミット2023
ミツバチサミット2019以来、4年ぶりのオンサイト開催ということで、今回も参加。
ミツバチサミット🐝 pic.twitter.com/DNHfeAOVKB
— オープンデータ推進者なの …
DrBonoDojo2 cover uncovered
Written by Hidemasa Bono in drbonodojo on 水 15 11月 2023.
道場本2の表紙公開
今月末には発売となるはずだった「生命科学者のためのDr. Bonoデータ解析道場 第2版」の表紙が公開された。
【近刊情報】12月初旬発売予定！
生命科学 …
Home Coming Day 23
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 05 11月 2023.
第17回ホームカミングデー＋第72回大学祭
今年も11月の第一土曜日はホームカミングデーということで、恒例になりつつある工学部横の並木道の紅葉をチェックしつつ、散歩がてらに 振り返ってみると …
DrBonoDojo2 contents
Written by Hidemasa Bono in drbonodojo on 土 04 11月 2023.
道場本2の新しいコンテンツ
早くも11月となり、今月末には発売となる、すでにAmazonにも出ている「生命科学者のためのDr. Bonoデータ解析道場 第2版」。
中身に関する情報で現時点(2023-11-04)で公 …
October2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 火 31 10月 2023.
2023年10月を振り返って
この10月から定年制雇用に切り替わり、これまでの卓越大学院がメインの大学院教育だけから学部（理学部生物科学科）の教育もカバーするように …
DrBonoDojo2 dispatch
Written by Hidemasa Bono in drbonodojo on 木 26 10月 2023.
道場本2第一報
かねてより準備してきた「生命科学者のためのDr. Bonoデータ解析道場 第2版」がAmazonに出てました。 前作と比して、書名に「実践」が抜けた。 著者による …
BioJapan2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 15 10月 2023.
BioJapan2023
昨年に引き続き、今年もBioJapanに参加。 ちょうど職名も変わってというタイミングで、お披露目にもちょうど良く。 今年はフル参 …
sakematsuri 23
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 07 10月 2023.
酒まつり2023
昨年に引き続き、今年も酒まつりへ行ってきた。 ついに今年2023年、コロナ前の2019年と同じ規模での開催ということで。
まさかの。PayPayで支払えないレベルの人の混雑 https://t.co/4afh5adBKL pic.twitter.com/c94o07KmH1 …
relaunching bonohulab
Written by Hidemasa Bono in misc on 日 01 10月 2023.
bonohulabの再立ち上げ
2023年9月30日に特任教員（特任教授）を退職。 翌2023年10月1日に教授として採用されました。 これまでの卓越大学院のバイオインフォマティクス教育が本務のプロジェクト雇用（任期 …
September2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 30 9月 2023.
広大での3年半を振り返って
2023年9月30日をもって広島大学大学院統合生命科学研究科の特任教員を辞めることになりました。
来月2020年4月からは転職して、バイオインフォマティクスの教育をしながら、生命科学分野の高速道路を使い倒して研究をす …
RNA-Seq recipe 2 on pre-sale
Written by Hidemasa Bono in RecipeBook on 金 22 9月 2023.
RNAseqレシピ本2先行発売
先のエントリで何が新しくなったかを書いた「改訂版RNA-Seqデータ解析 WETラボのための超鉄板レシピ ヒトから非モデル生物まで 公共データの活用も充実」 だ …
What's new in RNA-Seq recipe 2
Written by Hidemasa Bono in RecipeBook on 金 15 9月 2023.
RNAseqレシピ本2で何が新しくなったか
先のエントリで第一報をお届けした「改訂版RNA-Seqデータ解析 WETラボのための超鉄板レシピ ヒトから非モデル生物まで 公共データの活用も充実」 だが、Amazonでも予約できるようになったよう …
RNA-Seq recipe 2 dispatch
Written by Hidemasa Bono in RecipeBook on 金 08 9月 2023.
RNAseqレシピ本2第一報
去年(2022年)9月。 パシフィコ横浜で開催された第81回日本癌学会学術総会には出れなかったものの、他の用事で上京していた。 その際に桜木町駅にて、RNA-Seqデータ解析レシピ本の今後に関して出版社の方と話し合った。 ANNUAL UPDATEが3回終わって次をどうするか、ということな …
August2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 31 8月 2023.
2023年8月を振り返って
この8月は出張が3回あった上に盆休みもあったため、ラボにいる日が極端に少なかった。 その一つが、沖縄での講演で沖縄に行ったのは実に9年半ぶり。 また、月初めには学 …
Meta-analysis of Heat-Streassed Transcriptomes Published
Written by Hidemasa Bono in papers on 水 30 8月 2023.
公共遺伝子発現データベースを用いたヒトとマウスの熱ストレストランスクリプトームのメタ解析論文出版
M2の大学院生がfirst authorである …
Lecture in Okinawa
Written by Hidemasa Bono in misc on 土 12 8月 2023.
講演＠沖縄
台風6号の影響が懸念され、直前までちゃんと行けるのか不明な事態だったが、9年半ぶりに沖縄に行ってこれた。
2023年8月9日沖縄県立博物館・美術館（おきみゅー）講堂にて開催されたシ …
Lab Tour for undergraduates
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 02 8月 2023.
学部生対象研究室見学会
ラボ開設4年目にして初の学部生3年生を対象にした研究室見学会を今日2023年8月2日に。 限られた時間なので詳しい研究の内容などは話せなかったが、それは先月の7月にやった授業で話して …
July2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 月 31 7月 2023.
2023年7月を振り返って
この7月は出張もなく、ずっとラボに通う毎日であった。 しかし、学部授業、そして対面授業を3年4ヶ月目にして初めて行ったことは大きなイベントだった。 また、月末にはDBCLSの小野さんをお招きしてTogoTVthonなる統合TV製作者の集まりをローカルに開いたのも初めてのことだった。
相変わらず報道され …
R3 WikiPathways report in BioHack23
Written by Hidemasa Bono in papers on 木 13 7月 2023.
R3 WikiPathways group report in BioHack23
2023年6月に参加したBioHackathon2023 。
BioHackathon2023 / "2019年に博多で開催して以来、開催できてなかった国際版のBiohackathon。4年ぶりについに開催で、今年2023年は香川県の高松と小豆島にて。" https://t.co/a0vh2yzrfh#biohackjp pic.twitter.com/Nfr5DQcU8K
— オープンサイエンス推進者な …
First lecture with students
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 12 7月 2023.
生徒がいる初の授業
大学に転職して3年3ヶ月半にして、やっと初対面授業。 3年前来てすぐに講義デビューはしたものの、自分の担当である大学院講義は基本、オン …
Bonohulab Dojo 23 finished
Written by Hidemasa Bono in drbonodojo on 火 11 7月 2023.
23年度bonohulab道場終了
bonohulabで新入生を対象に行っているbonohulab道場。 具体的には、生命科学者のためのDr.Bonoデータ解析実践道場(道場本)を使った、週1回約1時間ほどのセミナー。 セミナーといっても基本は私が解説して、可能ならハ …
June2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 金 30 6月 2023.
2023年6月を振り返って
6月は学会年会とBioHackathon2023（とそれに続く関東出張）で出張が多く、合計12泊の外泊。 もちろん、月当たりの数では転職以来最多。 その結果、多くの人とあっ …
BioHackathon2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 28 6月 2023.
Biohack23
2019年に博多で開催して以来、開催できてなかった国際版のBiohackathon。 今年2023年、4年ぶりに香川県の高松と小豆島にてDBCLS BioHackathon2023開催。 日曜日に高松に集合して、続く月曜日から土曜日ま …
JSGEDIT 8th
Written by Hidemasa Bono in misc on 木 08 6月 2023.
日本ゲノム編集学会第8回大会
今年は（結果として）4年ぶりにオンサイトで。 しかも前回オンサイトで行われた東京・船堀にて。 そのころはまだ前 …
May2023
Written by Hidemasa Bono in misc on 水 31 5月 2023.
2023年5月を振り返って
5月はオンサイトでの外部講演が2つ、大阪と米子に遠征。 米子でのそれは早くも統合TV化された。
バイオDXによるデータ駆動型生命科学研究 @ とっとりバイオフロンティア人材育成セミナー https://t …
Meta-analysis of queen and workers transcriptomes in eusocial insects published
Written by Hidemasa Bono in papers on 土 06 5月 2023.
社会性昆虫における生殖分業に関連する候補遺伝子同定論文出版
2022年11月にbioRxivにプレプリントアップロードしてあった、プロジェクト研究員による公共RNAシーケンスデータのメタ解析による社会性昆虫における生殖分業に関連する候補遺伝子同定の論文が、査 …