JSGEDIT 6th

Written by Hidemasa Bono in misc on 金 18 6月 2021.

日本ゲノム編集学会第6回大会

オンサイトで福岡で開催の予定が、オンラインになってしまった。 去年、中止になってしまっ …

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BioDX outreach movie

Written by Hidemasa Bono in misc on 火 01 6月 2021.

バイオDXの宣伝動画

約2ヶ月半前に取材していただいたBio×Digital Transformation (バイオDX)のアウトリーチ動画の編集作業が終わり、いつの間にか、公開されてた。 しかもYouTubeに。

共創の場 …

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May2021

Written by Hidemasa Bono in misc on 月 31 5月 2021.

2021年5月を振り返って

これまでとは違って学生や研究員がラボに常駐しているので、彼らとの議論なども散発的にあって、一年前とは大 …

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sava can

Written by Hidemasa Bono in misc on 金 28 5月 2021.

サヴァ缶

最近、このシリーズのレモンバジルパスタソースがお気に入り。 そこで、本家のサヴァ缶もということで。

缶詰 …

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Magcup for the paper

Written by Hidemasa Bono in misc on 土 22 5月 2021.

論文マグカップ

自分がcorresponding authorの、自ラボから出た論文が出始めた。 twitterでも話題になっていた論文マグカップをbonohulabでもやってみたいと思ったが、コロナ禍の状況で海外のサービスを使ってオーダー …

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April2021

Written by Hidemasa Bono in misc on 金 30 4月 2021.

2021年4月を振り返って

先月までとは打って変わり、ラボに人が常駐するようになった。 まずは彼らとやるべき課題を一緒に考え、そしてそ …

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Diversification of mineralocorticoid receptor genes in a naked mole-rat

Written by Hidemasa Bono in papers on 木 15 4月 2021.

ハダカデバネズミの2つのMR遺伝子論文

Diversification of mineralocorticoid receptor genes in a subterranean rodent, the naked mole-rat. https://doi.org/10.1530/JME-20-0325

ハダカデバネズミの2つのミネラルコルチコイド受容体遺伝子論文が査読論文誌である Journal of Molecular Endocrinology に出版された。

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Paper submission rush

Written by Hidemasa Bono in misc on 金 09 4月 2021.

論文投稿ラッシュ

今週は、コラボ関係で論文が2本投稿された。 bioRxivへアップして、そして投稿という流れができつつあって、とてもいい感じ。

そうい …

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RNAseqRecipe 3rd print

Written by Hidemasa Bono in RecipeBook on 月 05 4月 2021.

RNAseqレシピ本第3刷

「RNA-Seqデータ解析 WETラボのための鉄板レシピ」(略称、RNAseqレシピ本)の第3刷が送られてきた。 2019年11月末に上梓、2020年3月に第2刷をしたので、ちょうど1年ぶりに。

RNA-Seqデータ解析に特化したコンテンツで、同時期に出たDRY解析教本2にもRNA-Seq解析の章があったにもかかわらず、第3刷を出すことになるほどの売れ行き。

出版から1年後の2020年末にはAnnual Updateも公開され、売れ行きに拍車がか …

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bonohulab becomes non-bocchilab

Written by Hidemasa Bono in misc on 木 01 4月 2021.

ボッチラボではなくなった

新年度(2021年度)を迎え、bonohulabも新しいメンバーを4人も迎えることとなった。

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March2021

Written by Hidemasa Bono in misc on 水 31 3月 2021.

2021年3月を振り返って

この3月は、年度末であることと、春の学会シーズンということもあって、外部講演が3つもあった。

  1. 「データ駆動型ゲノム育種技術の …

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Shutoiten 1year

Written by Hidemasa Bono in misc on 木 25 3月 2021.

酒都移転1年

今日で酒都西条に移転して丸1年。 職種の関係上、引きこもり生活になることが予測されていたが、COVID-19の影響でより完全に出張のない新しい …

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Return the debt

Written by Hidemasa Bono in misc on 金 12 3月 2021.

借りを返す

有給休暇取得5日達成、ということで。 自覚症状あるぐらいの、大変良いリフレッシュに。 このようなリフレッシュ …

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TapeStation4150

Written by Hidemasa Bono in misc on 水 10 3月 2021.

TapeStation他納品

これで自ラボでRIN値が測定できるように。 外注でRNA-Seq出す時にサンプルのRIN値を求められることが多く、そこがメインの目的であったが、説明を聞いてみるとそれだけではない色々が。 大昔に使 …

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Samplingthon

Written by Hidemasa Bono in misc on 火 09 3月 2021.

サンプリング大会

自分は最初と最後だけだったが、現場まで2往復してバトンを渡す。 どちらかというとサンプリングリレーかもしれない …

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Inhibiting SARS-CoV-2 infection in vitro by suppressing ACE2 via aryl-hydrocarbon receptor signal

Written by Hidemasa Bono in papers on 金 05 3月 2021.

AHRシグナルを介したACE2の抑制によるSARS-CoV-2感染のin vitroでの抑制

メンバー的には以前からの共同研究者との研究だが、広島に来てから始めた共同研究。 bioRxivにアップロードされたのが公開。

Inhibiting SARS-CoV-2 infection in vitro by suppressing its receptor, angiotensin-converting …

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DrBonoBon2 dispatch

Written by Hidemasa Bono in drbonobon on 火 02 3月 2021.

Bono本第2版第1報

出版から3年経って、多くのウェブサイトがHTTPS化したことや、URL自体が変わってしまっていることなど、気がついたアップデートは山ほど見つかった。 これらは出版社に連絡して …

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February2021

Written by Hidemasa Bono in misc on 日 28 2月 2021.

2021年2月を振り返って

緊急事態宣言継続で引きこもりも継続だったが、大学や大学院の研究発表会の季節ということでそれを嘆く暇も …

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Catalina's trap

Written by Hidemasa Bono in misc on 月 22 2月 2021.

Catalinaの罠(Java編)

リモートからラボのmacOS Catalina(c10.15.7)なマシンにsshして計算させているときに。 なぜか、いつもはすぐに実行されるプロセスが開始しない。 おかし …

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January2021

Written by Hidemasa Bono in misc on 土 30 1月 2021.

2021年1月を振り返って

緊急事態宣言発令により、出張が全てキャンセルになってしまった。 職場のエリアには出なかったものの、出張先が …

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Python for Bioinformatics 2nd Eds in Japanese

Written by Hidemasa Bono in misc on 土 23 1月 2021.

Pythonによるバイオインフォマティクス 原著第2版

Twitterでその出版予定を知る。 2021年2月末に出版されるらしい。

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1 liner of 210114

Written by Hidemasa Bono in misc on 木 14 1月 2021.

今日のワンライナー

今日重宝したワンライナー。

gene1
gene2
gene3
...

みたいなfile.txtというファイルに書き込まれた改行区切りの …

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1 liner of 210106

Written by Hidemasa Bono in misc on 水 06 1月 2021.

今日のワンライナー

今日重宝したワンライナー。

gene1 -2.0
gene2 -1.5
gene3 1
...

みたいなデータから-1以下の行だけ抽出。

% perl -anle 'print $_ if(@F[1] < -1)' DEG.txt

Gene …

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Plan 2021

Written by Hidemasa Bono in misc on 金 01 1月 2021.

2021年の計

明けましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いします。 年頭恒例にしている「一年の計は元旦にあり」。 今年 …

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