Return the debt

Written by Hidemasa Bono in misc on 金 12 3月 2021.

借りを返す

有給休暇取得5日達成、ということで。 自覚症状あるぐらいの、大変良いリフレッシュに。 このようなリフレッシュ …

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TapeStation4150

Written by Hidemasa Bono in misc on 水 10 3月 2021.

TapeStation他納品

これで自ラボでRIN値が測定できるように。 外注でRNA-Seq出す時にサンプルのRIN値を求められることが多く、そこがメインの目的であったが、説明を聞いてみるとそれだけではない色々が。 大昔に使 …

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Samplingthon

Written by Hidemasa Bono in misc on 火 09 3月 2021.

サンプリング大会

自分は最初と最後だけだったが、現場まで2往復してバトンを渡す。 どちらかというとサンプリングリレーかもしれない …

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Inhibiting SARS-CoV-2 infection in vitro by suppressing ACE2 via aryl-hydrocarbon receptor signal

Written by Hidemasa Bono in papers on 金 05 3月 2021.

AHRシグナルを介したACE2の抑制によるSARS-CoV-2感染のin vitroでの抑制

メンバー的には以前からの共同研究者との研究だが、広島に来てから始めた共同研究。 bioRxivにアップロードされたのが公開。

Inhibiting SARS-CoV-2 infection in vitro by suppressing its receptor, angiotensin-converting …

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DrBonoBon2 dispatch

Written by Hidemasa Bono in drbonobon on 火 02 3月 2021.

Bono本第2版第1報

出版から3年経って、多くのウェブサイトがHTTPS化したことや、URL自体が変わってしまっていることなど、気がついたアップデートは山ほど見つかった。 これらは出版社に連絡して …

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February2021

Written by Hidemasa Bono in misc on 日 28 2月 2021.

2021年2月を振り返って

緊急事態宣言継続で引きこもりも継続だったが、大学や大学院の研究発表会の季節ということでそれを嘆く暇も …

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Catalina's trap

Written by Hidemasa Bono in misc on 月 22 2月 2021.

Catalinaの罠(Java編)

リモートからラボのmacOS Catalina(c10.15.7)なマシンにsshして計算させているときに。 なぜか、いつもはすぐに実行されるプロセスが開始しない。 おかし …

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January2021

Written by Hidemasa Bono in misc on 土 30 1月 2021.

2021年1月を振り返って

緊急事態宣言発令により、出張が全てキャンセルになってしまった。 職場のエリアには出なかったものの、出張先が …

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Python for Bioinformatics 2nd Eds in Japanese

Written by Hidemasa Bono in misc on 土 23 1月 2021.

Pythonによるバイオインフォマティクス 原著第2版

Twitterでその出版予定を知る。 2021年2月末に出版されるらしい。

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1 liner of 210114

Written by Hidemasa Bono in misc on 木 14 1月 2021.

今日のワンライナー

今日重宝したワンライナー。

gene1
gene2
gene3
...

みたいなfile.txtというファイルに書き込まれた改行区切りの …

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1 liner of 210106

Written by Hidemasa Bono in misc on 水 06 1月 2021.

今日のワンライナー

今日重宝したワンライナー。

gene1 -2.0
gene2 -1.5
gene3 1
...

みたいなデータから-1以下の行だけ抽出。

% perl -anle 'print $_ if(@F[1] < -1)' DEG.txt

Gene …

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Plan 2021

Written by Hidemasa Bono in misc on 金 01 1月 2021.

2021年の計

明けましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いします。 年頭恒例にしている「一年の計は元旦にあり」。 今年 …

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December2020

Written by Hidemasa Bono in misc on 火 29 12月 2020.

2020年12月を振り返って

書類上の出勤日は昨日28までということで、少し早めの12月の振り返りエントリ。

先月からの流れで、(ウェットな)実験室整備を着々と進めた2020年12月であった。 特に注文していたMinIONが届いたり

そん …

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COI-NEXT started

Written by Hidemasa Bono in misc on 火 15 12月 2020.

共創の場形成支援プログラム「育成型」採択

2020年4月に東広島に来た当初からその構想を練り、準備して来た「共創の場形成支援プログラム」に広島大学が代表機関とし …

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RNAseqRecipe Annual Update 2020

Written by Hidemasa Bono in RecipeBook on 月 14 12月 2020.

RNAseqレシピ本 Annual Update 2020

「RNA-Seqデータ解析 WETラボのための鉄板レシピ」(略称、RNAseqレシピ本)が出版されて1年が経った。

Mac界隈は相変わらず日進月歩である。 その短い間に新しいバージョンのOSが2度もリリースされて、デフォルトのシェルがbashからzshに変更されるなど、RNAseqレシピ本販売直後から「書いてある …

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The First Business Trip 2020

Written by Hidemasa Bono in misc on 金 11 12月 2020.

2020年度初出張

転職後初の出張で、古巣へ。 つまり、2020年度初の出張ということなのだが、去年度まで100日近い出張宿泊日数であった自分。 それからすると、激変した今年であったわけで。 COVID-19が主な原因ではあるが、転職というのも …

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Mariner-like elements in Apis

Written by Hidemasa Bono in papers on 火 01 12月 2020.

Evolutionary insights into Mariner-like elements in Apis species

着任後まもない、この4月に一度bioRxivにアップロードしてあったApis(ミツバチ属)のMariner-like elementに関する論文(プレプリント)をアップデート。 とはいえ、ほぼ全 …

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Lay the groundwork

Written by Hidemasa Bono in misc on 木 26 11月 2020.

根回し重要

本日、2つの講演依頼が来た。 1つはかねてより他の機会にその話を聞いていたもの、他方は今日初めて「寝耳に水」的にしかも学会事務局から事務的に来たものであった。 結果は言う …

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