移植性向上

Written by bonohu in misc on 月 15 6月 2009.

懸案だった部分を動くようにする。今日やったことはこれに尽きるが、その待ち時間に他のマシンでも使えるように、スクリプトや出力データの置くディレクトリを分離するように書き直したり。

しかし、結局その先の部分で落ちる罠orz。

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統合データベースプロジェクトシンポジウム2009

Written by bonohu in misc on 金 12 6月 2009.

口頭発表する機会をいただき、それなりに用意して臨む。しかし、直前の講演*1が意外にも我々と同じ路線のそれだったので、前半は繰り返し「また同じ話かよ」モードだったかも。前半はこれまで繰り返し各地の講習会で話している内容だったのでそれなりにこなれて話が出来たかと。問題は『DBCLS=ライフサイエンスデータの「上水処理場」+「下水処理場」』のプレゼン以降の後半で、今回がお初のパート。統合DB講習会ではその後に各種サービスの講習をやるので一切話さなかった部分。それを、手短に、できるかぎり網羅的に、話す必要があり、プレゼン作成の時にもかなり悩んだ部分。時間がなかったらさくっと流す予定だったのが、ここに差しかかった時点で与えられた時間(質疑応答を入れて30分)の半分以上残っていてわりと時間があったのでちょっと丁寧目に話す。特に、この2年間で一番エフォートをつぎ込んでやってきた思い入れの深い統合TVに関しては、実際にウェブブラウザ上で動画を再生して見せるデモまでも*2。プレゼンはいつものところにPDFで

最終的には、講演部分は全体で25分とちょうどいい時間で終われたが、質疑が続出。結果として時間オーバー。それも私では答えられないような、わりと高い次元のそればかりで。東京大学のKさんに指摘された、キーワード検索以上の「統合検索」とでも言うべき何かは、今後g86の皆と取り組んでいくべき宿題として持ち帰らせていただいたつもり。今後、より精力的に取り組んでいきたい。また、大阪大学のKさんからいただいた『(「making-of-統合DB」とでもいうべき …

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なんとか口頭発表

Written by bonohu in misc on 木 11 6月 2009.

もカタチにする。「大阪共同利用キカン邦人」として、落としどころを用意したので、盛大に笑うように。ただ、「ここで笑えへんかったら、ほか笑うとこないでー」的に、その場所は一箇所しかないので、それだと思った瞬間に行動をとること。ご協力の程、よろしく。

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午前にポスター発表

Written by bonohu in misc on 木 11 6月 2009.

仕上げる。懸案の最後の決め台詞は最後まで考え抜いた挙げ句の出力。

未発表なデータセットについても速やかな公開を前提にご相談に乗ります

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とりあえずのパイプライン完成

Written by bonohu in misc on 火 09 6月 2009.

午前の会議以外は、一日中端末に向かう。昨日まで書き散らしたスクリプト群をまとめながら「清書」。その結果、週末のポスター発表に出す中身完成。一部不具合があるが、まあとりあえずのプロトタイプとしてはオッケーということで。

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新型が出た日に…

Written by bonohu in misc on 火 09 6月 2009.

MacBookAirのヒンジ壊れる。これは新型を買えというフラグなのだろうか?

それはともかく、iPhoneの新型が出るまで待っていたわけだが、文句無く新型のiPhone3GS買う決意を固める。

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ターミナル充

Written by bonohu in misc on 月 08 6月 2009.

id:Hashによる「SIBMLによるターミナル改造計画」DBCLS後のHashthonでMac OS XのTerminal改造したりとか - ミームの死骸を待ちながらに触発されて、Visorを導入。なぜかSIBMLはすでに入っていた(一時期やっていたSafariの改造関係?)。それによりこれまでいちいちターミナル窓を新規に開いてやっていたターミナル操作(例えば、mvやrsyncとか)が非常に楽にできるようになり、作業効率が格段に向上した。そのせいか、コードを自分で書いてやる仕事が大幅に進んだ。これで今週末のアレ、なんとかなりそうです!id:Hash、そしてid:mickey24さまさま。ありがとう!

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週末WiiFIt

Written by bonohu in misc on 土 06 6月 2009.

苦手な立ち木のポーズを久しぶりにやると最高スコアが出た。少しはトレーニングの成果が出ているのかもしれぬ。ジャックナイフ、腕立て伏せ、インナーマッスルなトレーニングはいつも通り忘れずに。さらに週末ということで、有酸素運動も。こちらはまだまだ苦手レベル。運動貯金32。

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DBCLSのRA

Written by bonohu in misc on 土 06 6月 2009.

基本的な考え方を示しておかないと、と思ったので。

ライフサイエンス統合データベースセンターの簡略形、DBCLSはDatabase Center for Life Scienceという英語組織名のacronym(頭文字)であることからわかるように、「ライフサイエンス関係の」データベースのセンターです。そもそも研究所という範疇になってはいるものの、「研究開発は行うが、サービス事業」(参考PDF、これの19ページ目)をやっているわけで、その後者の部分をお手伝いしてもらっているという認識です。またアルバイトも、RAというResearch Assistantの頭文字な名前になっていますが、これも他の国立の研究所に「右へならえ」した結果の「痕跡」であり、研究開発をやってもらうつもりでは基本的にはありません。しかしながら、それに興味あるとか自分の研究テーマにしたいというのなら話は別です。ただ、その場合も本業の大学院の研究テーマとしっかり切り分けてやっていただく必要が出てくるであろうと思いますが。

なんか、自分がセンター長のような感じのこと書いていますが、これはid:sayamatcher個人の見解であって、組織としての考え方を代表しているものではありません、念のため。

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gift

Written by bonohu in misc on 金 05 6月 2009.

本日午前届いた模様。六月のすべての記念日に間に合ってよかった。

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10人

Written by bonohu in misc on 金 05 6月 2009.

過去最多。これだけの人がいるとさすがにわが精神と時の部屋も広くは感じない。

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