EDW1日目
Written by bonohu in misc on 木 29 10月 2009.
Ensembl Developers' Workshop。講師5人に生徒11人だが、その生徒の中にもEnsembl staffのalumiが2,3人居たりという感じ。PCにVMwareを入れて講習するようだが、そのセットアップも講習開始の時点では出来ておらず…。明日の講習には間 …
GI3日目
Written by bonohu in misc on 木 29 10月 2009.
普段の時間帯とほぼ半日ずれているために朝起きてメールがどかっと溜まっている。こちらに来ているせいで直接 …
GI2日目
Written by bonohu in misc on 火 27 10月 2009.
午前はEpigenomics & Gene regulationのセッション。午後からポスター発表。他のを見るために自分の説明は控えめで。やはりこちらはポスター発表もおも …
LGAtoCSH
Written by bonohu in misc on 火 27 10月 2009.
LGAからは電車サービスがない。バス乗り換えで迷いたくなかったので、マンハッタン経由でLIRRに、と思ったのに空港からの高速バスの降りるところ …
YYZtoLGA
Written by bonohu in misc on 火 27 10月 2009.
map機能は今回も使えず。ダメだな、ここは。今度から別のにしよう。
GI1日目
Written by bonohu in misc on 月 26 10月 2009.
abstract bookの厚さから参加者のみならずポスター発表者の数が多いことがうかがいしれるレベル。そのなかでなんと幸運なことにこれまで泊まったことなかった食堂の真上の区画に泊まることに。ここはそれ …
OICR
Written by bonohu in misc on 月 26 10月 2009.
Ontario Institute for Cancer Research。今日お世話になったBiomartのArek Kasprzykだけでなく、BINDをやっていたB. F. Francis Ouellette、HapMapとかReactomeとかWormbaseとかCGI.pmとかいろんなことでこの世界で超有名なLincoln Steinが「常勤で」居る研究所と知り、驚く。ここはこれからはもっとtranlational medicineを目指すBioinformaticsな研究者が集まり、さ …
長い一日
Written by bonohu in misc on 土 24 10月 2009.
再び。ACなので機内エンターテイメントが日本人に最適化されておらずむしろ助かる（だが、まだ見ていなかった「おくりびと」はしっかり見たが）。しかもAC110VやUSB電源があって大助かり。それもあってこれを書いていたりする（アッ …
…
Written by bonohu in misc on 金 23 10月 2009.
私にどうしろというのか。それを減らしたところでそっちに行くかというとそうでもないのではないだろうか？ま、私 …
書類上は休み
Written by bonohu in misc on 月 19 10月 2009.
でも何かと忙しいこの季節、出動。来週またいないし。次のAJACSの諸々、科研費何を出すかの判断、等々。
「ゲノム解析学」講義
Written by bonohu in misc on 木 15 10月 2009.
代打で、統合データベースプロジェクトについて90分話す。そのとき用いたスライドはこちら。ローカル統合TVの用意をわざわざしていったのに本番で装備しわすれて使えなかったのが大変心名残り。インターネッ …
統合データベース講習会AJACS近江2
Written by bonohu in misc on 木 15 10月 2009.
基本的にはいつもどおりだが、久しぶりにセンター長も参加しての講習会。
統合TVの統合TV 2009年版
Written by bonohu in misc on 木 15 10月 2009.
217ということで、前の時点の倍以上に。そのシステムの適当さを指摘されることもあるものの、コンテンツがないことにはすべてが …
AJACSネゴシエーション
Written by bonohu in misc on 木 15 10月 2009.
九州と北陸方面。前者は2010/1/18-19に決定。後者は来年2月か3月という方向で検討開始。
NIGネゴシエーション
Written by bonohu in misc on 木 15 10月 2009.
昨日急に決まった会議参加。よくわからないままつないでみたが、アレで本当によかったの？
口撃再開
Written by bonohu in misc on 火 13 10月 2009.
満を持して、DNA配列との格闘再開。喉が渇くのは気のせいではなかろう。オリジナルなSayaMatcherを久しぶりに動かし、某解析パイプラインを後進に伝授する。
秋の日は釣瓶落とし
Written by bonohu in misc on 月 12 10月 2009.
週末のプレゼン資料に結局時間がかかってしまう。一年前のそれが使えないぐらいアップデートが多かったという …
どうしてDBCLSで「教育」をするのか？
Written by bonohu in misc on 日 11 10月 2009.
よくDBCLSはDB統合のための拠点なのだからDBの構築維持管理だけしていればいいのにといぶかしがられるが、上に対する答えはきわめて簡単。使いたい人もこれから使うべき人も、生命科学分野のDBに関して多くの場合、教育されていないか …
帰路
Written by bonohu in misc on 土 10 10月 2009.
不思議な縁で学会で一緒だった人とずっと同じ。SFO行きが一時間ほど遅れたが、元々乗り換えに余裕があったためセーフ。SFOからNRTへは約11時間のフライトだったが、飯食って新劇場版エヴァンゲリオン序を見ていたら寝て …
'The Next-Gen: not only for sequencer but also for human resource'
Written by bonohu in misc on 金 09 10月 2009.
MGED12 で思ったこと。一介のメリーランド大学の大学院生が次世代シーケンサーからの配列データの定量用のプログラ …
MGED12 最終日
Written by bonohu in misc on 木 08 10月 2009.
我らがR研のKさんが口頭発表。引き続きFANTOMアクティビティとして頑張ってくれているのを見るのは大変喜ばしく。今後どういう展開を考えているのだろう？そこで自分に対して思ったのは、以前の自分を引きず …
MGED12 3日目
Written by bonohu in misc on 火 06 10月 2009.
自分のポスター発表。なんとか凌ぐ。新しく始めたDBCLSの発現統合プロジェクト(togoexp)と、DRA(DDBJ Read Archive)との協力体制について早い時期に発表できたこと …
MGED12 2日目
Written by bonohu in misc on 月 05 10月 2009.
写真は会場となっているホテル。詳細はtwitterのハッシュタグ#MGED12を参照。
今日からがこの学会の本チャン（昨日は前座のチュートリアル＆ワークシ …
MGED12 1日目
Written by bonohu in misc on 月 05 10月 2009.
チュートリアルな1日。午前にDeep sequencing analysisのtutorial、午後に3つのWorkshop(Submitting UTHS data to GEO/ArrayExpress, MAGE-TAB annotation, BioConductor)。いろいろ新しい有益な情報で知恵熱が出そう。
Phoenix, AZへ
Written by bonohu in misc on 日 04 10月 2009.
ちょうど10年ぶり。「I'm drunken!」の迷言を産み出したマイクロアレイの会議で行って以来。自分は果たしてあの頃思い描いていた「10年後 …
Sheraton Phoenix Downton Hotel
Written by bonohu in misc on 土 03 10月 2009.
このホテル、高い割には便利じゃない。すなわち、部屋でネットが無料じゃない、お湯を沸かせるポットがない、テッシュ …
壁に耳あり障子に目あり
Written by bonohu in misc on 土 03 10月 2009.
みんな実は良く見ているということが判明。仕事中寝るような行為はこうやって広まっていくのだろうな…。そしてよ …
小さな世界
Written by bonohu in misc on 土 03 10月 2009.
昨日のそれに追い討ちをかけるように、普段お世話になっている方がそこに関係していることがさらに判明。この世 …
自転車ソウギョウ
Written by bonohu in misc on 土 03 10月 2009.
学会会場にてなんとかsubmit。一日遅れで。
It’s a small world after all!
Written by bonohu in misc on 金 02 10月 2009.
やっぱり世界は狭い、ということが今回の学会参加でも明らかに。まさか、前の前の職場での知り合いが現職場の同僚 …
精神と時の同窓会
Written by bonohu in misc on 木 01 10月 2009.
異様に楽しいひとときなのは久しぶりに集合しただけではない気がした。あの、お互い切磋琢磨した時期を振り返り …
クソ忙しい中対応したというのに
Written by bonohu in misc on 水 30 9月 2009.
no response。酷いんとちゃう？そうやってモチベーションは低下していくもの。
さすが変態牧場！
Written by bonohu in misc on 火 29 9月 2009.
やはりg86な変態たちには、実際にマシンを使って何かをやっている現実を見せるのが一番インパクトがあるようだ。例えばmysql一つとってもそれが実際にどう使われているのか、実際に …
It’s a small world, again!
Written by bonohu in misc on 火 29 9月 2009.
もちろんありうることだが、まさかのニアミスというか、ハチ合わせ。なす術もなく、素直に自分がそこに居る理由を白 …
発現統合打ち合わせ
Written by bonohu in misc on 月 28 9月 2009.
国立遺伝学研究所へ。うまく連携して「動くもの」と思われるものを年内に是非出したい！
It’s a small world!
Written by bonohu in misc on 月 28 9月 2009.
まさかとは思っていたが、そのまさかだった。お気の毒なので早く時代が移り変わることを切に願う次第。
変更
Written by bonohu in misc on 金 25 9月 2009.
いつものほうとう屋、いつのまにか全席禁煙に。時間によってはクレカが扱えないレジのおばあさんがいたりするこ …
電撃訪問
Written by bonohu in misc on 木 24 9月 2009.
来てもらえるのはありがたいが、その途中音信不通にしているわけなのだからきっちりとupdateはしていただきたいのが本音。ほんの少し誰かさんぽ …
停電前夜祭
Written by bonohu in misc on 水 23 9月 2009.
停電のため冷凍庫＆冷蔵庫のものが駄目になるという名目の。新人デビューの場となってよかったが果たして…。
2日連続WiiFit
Written by bonohu in misc on 水 23 9月 2009.
なんていつ以来だろう。今日はお昼に眠気覚ましがてら。三角のポーズをやってみた以外は、昨日とほぼ同じメニュー …
23日ぶりのWiiFit
Written by bonohu in misc on 火 22 9月 2009.
やはり週末外出が続くと駄目。これからは涼しくなるし、平日もやらんと。今日のところ、運動貯金30。
PHP×PostgreSQL reloaded
Written by bonohu in misc on 月 21 9月 2009.
ちょうど10年前にも同じようにマイクロアレイデータを見せるためのウェブサイトを作るために「手習い」を始めたのを思い出した。しかも同じ著者によるPHPの本で。
ウチバリカン
Written by bonohu in misc on 日 20 9月 2009.
中7週間。いつも思うことだが、一人でやるのは至難の業だ。
迷惑電話
Written by bonohu in misc on 金 18 9月 2009.
普段滅多に電話がかかってこないうちの部屋に電話がじゃんじゃんかかってきた。それも人間からじゃなくて機械 …
統合DB構築は完結しないプロセスである
Written by bonohu in misc on 金 18 9月 2009.
ということの実例に直面。でもやはり、統合DBの四ヶ条の憲法にあるように「研究開発の生産性向上を目指す」べく対処すべきかと。「サービス事業」なん …
統合TVも生命科学データベース横断検索
Written by bonohu in misc on 木 17 9月 2009.
でひっかかるようにインデックスされるようになった模様。横断検索して、「統合DBプロジェクト」でデフォルトでは解かれてない階 …
会議三つ
Written by bonohu in misc on 木 17 9月 2009.
本当はもう一つあったのだが。その後の会議の準備もあってパス。さすがにこれだけあると他には何にもできない。復 …
日本遺伝学会第81回大会
Written by bonohu in misc on 火 15 9月 2009.
もう81回もやっているのか…。何気に初めて参加するこの学会の大会。したがって、「アウェー」での戦い。スタンドからのブーイングに負けずに …
スーパーあずさ29号
Written by bonohu in misc on 月 14 9月 2009.
で松本へ。明日からの日本遺伝学会第81回大会でのお話に備える。「プロジェクト」の説明のスライドを新規に作成。「センター」との関係を鮮明に。
異種格闘技再開
Written by bonohu in misc on 月 14 9月 2009.
昨日からまた火がついて。パラメタいじってもっと閾値を上のほうで足切りした方がいいように思う。どうせ下の方 …