Profile of bonohu

Written by Hidemasa Bono in about on 月 04 5月 2020.

研究・教育遍歴

2020年5月現在。

大学

生物に興味を持つも、具体的に何をやりたいかは決めきれずに東京大学理科2類に入学。 進学振り分け …

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roomba reloaded

Written by Hidemasa Bono in misc on 日 03 5月 2020.

ルンバ復活

6年前に買ったルンバ871。

他の掃除機との併用ぐらしでそんなに利用頻度は高くなかったものの、すぐに充電切れになるように …

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April2020

Written by Hidemasa Bono in misc on 木 30 4月 2020.

2020年4月を振り返って

怒涛の1ヶ月が終わろうとしている。

ラボの立ち上げということでほぼゼロから始めていたものの。 移ってきてすぐに周りのラボの方との挨 …

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Website for bonohulab

Written by Hidemasa Bono in misc on 水 29 4月 2020.

bonohulabウェブサイト

bonohulabのウェブサイトは、着任当初は来たばかりで大学で提供されているサービス等全くわからなかったこともあって、自鯖上に作った …

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launching bonohulab

Written by Hidemasa Bono in misc on 金 10 4月 2020.

bonohulabの立ち上げ

埼玉医大でのきしょいラボ(2003年)やDBCLS(2007年)など、新しい研究室のセットアップをこれまで何度か経験してきたが、今回は …

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RNAseqRecipe 2nd print

Written by Hidemasa Bono in RecipeBook on 金 06 3月 2020.

RNAseqレシピ本第2刷

「RNA-Seqデータ解析 WETラボのための鉄板レシピ」(略称、RNAseqレシピ本)が早くも第2刷をするという連絡が出版社から。 2019年11月末(実際には12月頭)に上梓されたから、3ヶ月ほどで。

RNA-Seqデータ解析に特化した内容で、同時期に出たDRY解析教本2にもRNA-Seq解析の章があるから、正直売れ行きは厳しいかと …

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Feburary2020

Written by Hidemasa Bono in misc on 土 29 2月 2020.

2020年2月を振り返って

2020年2月は前半に共同研究打ち合わせの出張があった他は出張も少なく、懸案の論文執筆を進めたり、データ解析を進めたり、研究を進めることができた。

そして、先月に続いて、論文の公開 …

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AirPods Pro

Written by Hidemasa Bono in misc on 水 19 2月 2020.

AirPods Pro

ずっと欲しかったAirPods Pro。 自分への誕生日プレゼントと思い、Apple Storeに行った時に売っているかも、と思って何回か挑戦。 2020年1月頭に出張先のSan DiegoのApple Storeでも探したがやはり品切れ。

そこで観念して、帰国 …

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GLIS1 Paper Published

Written by Hidemasa Bono in papers on 水 12 2月 2020.

新規低酸素応答因子GLIS1の論文published

広島大学原爆放射線医科学研究所の谷本先生、廣橋先生のグループとの共同研究論文がadvance articleとして …

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Copidosoma Polyembryony Paper Published

Written by Hidemasa Bono in papers on 火 11 2月 2020.

キンウワバトビコバチの多胚形成の論文published

去年(2019年)の3月に投稿して。 11ヶ月経ってようやくキンウワバトビコバチの多胚形成に関する論文が出版された。

Analysis of molecular mechanism for acceleration of polyembryony using gene functional annotation pipeline in Copidosoma floridanum. BMC Genomics 21:152 (2020) doi: https://doi.org …

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AOE paper published

Written by Hidemasa Bono in papers on 土 25 1月 2020.

公共遺伝子発現DB目次AOEの論文がPLOS ONEにpublished

2019年5月のCold Spring Harbor Laboratory Meeting、The Biology of Genomesに参加、ポスター発表する前に、学会発表する前にはその内容をbioRxivにアップすると …

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Uber debut

Written by Hidemasa Bono in misc on 木 16 1月 2020.

Uberデビュー

空港からの行きは乗せてもらって、帰りは自分でアカウントを作って、今回のPAG出張でUberデビュー。 支払いに一切現金を使わず、運転手 …

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Plant and Animal Genome Conference XXVIII day2

Written by Hidemasa Bono in misc on 日 12 1月 2020.

PAGXXVIII day2

朝8時からEBIのworkshop、Genome annotation resources at EMBL-EBIに参加。 知っていることも多いが、updateすべき情報も多く、ためになる。 途中から、Non-coding RNAのworkshopに。 R研のHさんの発表を拝聴する。

夕方、いつも通り最初のplenary lecture終了後、reception。

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Plant and Animal Genome Conference XXVIII day1

Written by Hidemasa Bono in misc on 土 11 1月 2020.

PAGXXVIII day1

4年ぶりのInternational Plant and Animal Genome Conference (PAG)参加。 朝8時からArthropod genomics and genome engineering のworkshopがあるなど。 これ以外にもArthropod関係のworkshopが複数、色々とあることが冒頭にアナウンスされ、予定に追加。

California roomの奥で時折PCを充電しつつ休憩。 かつてはこの奥で口頭発表してい …

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Plan 2020

Written by Hidemasa Bono in misc on 水 01 1月 2020.

2020年の計

明けましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いします。 年頭恒例にしている「一年の計は元旦にあり」。 今年 …

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At the end of 2010's

Written by Hidemasa Bono in drbonobon on 火 31 12月 2019.

2010年代を終えるにあたり

今日で、2010年代が終わる。

この10年間自分は何してきたのだろう? そう思って、このぼうのブログを見返してみると、10年前何をしていたのか、克明に記録されていた。 それをみることで記憶 …

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CommonWL for practical use 3

Written by Hidemasa Bono in IT4BDA on 土 28 12月 2019.

作成したCWL ツール・ワークフローを実際に動かしてみた(その3)

stringtie-mergeができたものとして、次なるプロセスがmergeされたGFFから該当するFASTAファイルを作成すること。 このプ …

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Nights in hotels 2019

Written by Hidemasa Bono in misc on 水 25 12月 2019.

2019年出張外泊数

三島勤務になった2014年以来、数えて来た「仕事で外泊」した日数。 年内の出張が全て終わって、2019年の日数が確定。 その結果、2019年は91泊で昨年より8泊増えて、さ …

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Books published in 2019

Written by Hidemasa Bono in misc on 土 21 12月 2019.

2019年に出版した本

2019年もあと10日となって色々と振り返りモードな情勢。 私も振り返ってみたい。

2019年は、結果として4冊の本を世に出す結果となった。 去年の今頃、全て期限内に出せるか不安だったが、編集担当者や共著者の …

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23rd Workflow Meetup

Written by Hidemasa Bono in misc on 月 16 12月 2019.

23rd Workflow Meetup

前回は参加できなかったが、23回目の今回は参加。

HISAT2-StringTieによる新規transcript発見ワークフローを自分で作ろうとしたのだが、Live codingの話題としていただき、一気に進んだ! あとは、持ち帰って実際に動かしてみるところに。 あ …

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NGS_DAT2 for sale

Written by Hidemasa Bono in NGS_DAT on 土 14 12月 2019.

次世代シークエンサーDRY解析教本 改訂第2版 正式発売開始

福岡であった第42回日本分子生物学会年会(2019/12/3-6)ですでに先行発売されていたが、2019年12月14日に正式に発売開始。

Amazonから …

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November2019

Written by Hidemasa Bono in misc on 土 30 11月 2019.

2019年11月を振り返って

秋になって出張も多くなって、長らく月末の振り返りエントリがご無沙汰だった。 調べてみると7月以来で、四ヶ月ぶり。

2019年11月は中盤からずっと出張で、出 …

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